这个B0字段映射的主要特性(FM)工具箱
在罗宾逊和Jovicich (MRM, 2011)。简而言之,他们是
我)从多通道线圈使用阶段信息的组合
埃尔米特内积(HP)方法,相位匹配(PM)或方法
单独的通道(SC)方法。
(二)字段映射通过中值去噪替换的异常值
或通过标准偏差在射频通道(SC方法只)。
iii)当地fieldmaps阈值的最大实现
如果用于distortion-correct EPI几何失真校正。

工具箱需要大小和相位multi-echo梯度回波
(兆欧)核磁共振数据,或许多single-echo梯度回波(GE) MRI
扫描获得单独的回声时候,NIfTI格式。目前[3]
安装,这个工具箱使用打赌,提取和大脑
展开序幕。快速打开程序PHUN(斯蒂芬
Witoszynskyj et al .,医学图像分析,2009)可以作为
前奏的替代品。这是免费提供的请求
stephan[点]witoszynskyj[在]meduniwien.ac。在和需要
单独安装。

例如通用电气和EPI数据可用[2]。结合
在fm_caller例子。米,这应该弄清楚如何使用
工具箱为最常见的情况。

从分析用户参数可能会改变(输入和分析
输出目录,列出频道的数量)
fm_caller.m。其他选项,如结合使用的方法
相位图像和阈值选择和前奏,列出
主要功能,fm_calc_main。米,在“% % %用户定义的开始
% % %”参数。这些可能是修改部分或搬到
fm_caller.m。如果相同的参数是fm_caller中指定。m和
fm_calc_main。米,fm_caller。m precidence。

西门子核磁共振扫描仪的用户可能会发现它有用的将他们的
使用dicom_sort_convert_main NIfTI DICOM数据。m [4]
,
这将通用电气和兆欧数据格式可用这一领域
映射工具箱(4 d、5 d和6 d NIfTI),以及提供
采集参数信息文件(text_header.txt)
可以使用这个工具箱,减少信息的数量
需要用户输入的。另外,用户可能需要
以一个合适的格式准备数据使用MATLAB的“dicomread”或
函数“load_nii”,然后创建一个NIfTI结构相似
在病例2 (fm_caller.m中的例子之一)与“make_nii”并保存
这与“save_nii”,所有这些都是NIfTI工具箱的一部分
MATLAB(8797年吉米沈,FEX ID)。

我做了我最好的为NIfTI测试这个数据与不同
组织的回声,相位和大小和序列
参数可以通过一个text_header。txt或直接通过了,但是
不可避免的会出现一些问题,这与更广泛的测试
各种各样的数据从不同的扫描仪。请在联系
西蒙·罗宾逊[点][在]meduniwien.ac。如果你有问题,我
尽力解决任何错误和增加灵活性,是有意义的。

如果你在研究使用这个工具箱,请引用相关
论文[1]。

[1]
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21608027
或
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mrm.22879/pdf
[2]
http://dl.dropbox.com/u/9241799/field_mapping/fm_example_data.tar.gz

[3]
http://www.fmrib.ox.ac.uk/fsl/

[4]
//www.tatmou.com/matlabcentral/fileexchange/22508-siemens-dicom-sort-and-convert-to-nifti