SimBiology教程:导入数据和Noncompartmental分析
从系列:SimBiology教程QSP PBPK, PK / PD建模和分析
导入数据和Noncompartmental分析视频:这个视频演示了如何将数据导入SimBiology从电子表格,如何计算派生的数据列在数据集和数据可视化。数据集还用于执行noncompartmental分析,然后分析结果导出到电子表格中。
在这个视频中,我们将展示如何将实验数据导入SimBiology以及如何执行non-compartmental分析数据。
我们需要做的第一件事就是导入数据,和SimBiology允许您直接从文件导入数据,比如电子表格是逗号分隔或Excel表。在本例中,我们将使用茶碱,我们将导入CSV文件。在这种情况下,列分隔符是一个逗号。一旦你填写一个逗号,你可以看到SimBiology自动填充的列和也从第一行填充列标题。
如果我们单击OK,数据导入SimBiology。您可以重命名数据。在这里你可以看到数据。我们在这种情况下,12组。为每个组,我们有一个时间列,和集中列,和一个剂量列,以及一个重量列。所以重量,协变。
在这种情况下,数据是由体重规范化。你可以撤销,标准化通过添加一个列到你的数据集。我首先需要填写实际的表达式计算浓度,列命名为DV,然后点乘以WT,点次意味着每个元素是元素的DV值偏差乘以重量。
我们可以给这一个名字。我们可以叫它的浓度。我们可以添加另一个列的剂量,因为剂量也是规范化。所以,我们可以做同样的事情。我们可以说剂量,剂量点乘以重量,称之为总数。
下面列的名字,你可以看到一个行分类。因此,我们可以把每一列所表示的数据。浓度是一个因变量。剂量是一剂列。然后,我们可以设置重量是协变的。
还可以添加浓度单位,例如,在毫克每升,在毫克剂量,协变千克。时间是一个小时。,完成整个数据集的设置。
我们也可以看看数据本身。在这种情况下,您可以创建一个新的情节,直接拖到情节的数据。然后,您可以看到,这是口服给药,其次是间隙。我们可以画出,在半对数y有个更好的主意。然后,你可以看到这可能看起来像一个一室模型。
所以,我们现在有数据设置。如果我们想做non-compartment分析,我们唯一需要做的就是添加一个名为non-compartmental分析。
这个程序在一个数据集。在这种情况下,只有一个数据集在你的项目中,但可能有更多的在你的情况中。然后,你需要说哪些列在您想要使用的数据集的分类模型。现在,因为你已经做了分类的数据集,这是自动完成的。你唯一需要改变,在这种情况下,是第四剂量不是丸,但相反,它是血管外的,所以你需要剂量列移动到血管外的。
另一件事我们可以做,我们可以设置时间范围。例如,如果我想计算部分,我使用c 0到12之间。我可以做到这样。而且,我还可以定义量化的下限。
所以,这个设置的我可以运行这个程序。然后,在这里你可以看到结果。计划下一个,最后运行。,我唯一需要做的就是生成一个新的数据表,并把结果放到这里。在这里,每一个错误的12个主题,你看到的结果non-compartmental分析。你看到一个AUC, C-max,然后一直到最后,你也得到你的部分AUC。
如果你想,你可以导出一个工作区,或另一件事你可以做,这是第二个数据表,您可以导出到Excel。
完成这个视频时,将数据导入到SimBiology和执行non-compartmental分析。
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