主要内容

getSummary

类:BioMap

打印摘要BioMap对象

语法

getSummary (BioObj)
ds = getSummary(BioObj)

描述

getSummary (BioObj）的摘要BioMap对象。摘要包括参考文献的名称、映射到每个参考文献的序列数量以及每个参考文献中序列覆盖的基因组范围。

ds= getSummary (BioObj）类中的摘要信息数据集数组中。

输入参数

BioObj

对象的BioMap类。

输出参数

ds

数据集控件的摘要BioMap对象,BioObj．数据集数组中每个引用都有一个观察值(行)BioObj，和两个变量(列):映射到每个参考文献的序列数量和序列在每个参考文献中覆盖的基因组范围。

getSummary类的附加元数据BioMap对象中的用户数据的属性ds，您可以使用ds.Properties.UserData．

例子

构造一个BioMap对象，然后显示该对象的摘要:

从SAM文件BMObj2 = BioMap('ex2.sam');getSummary (BMObj2)
名称:" Container_Type: '数据是文件索引。'Number_of_Sequences: 3307 Number_of_References_in_Dictionary: 2 Number_of_Sequences基因组范围seq1 1501 1 1569 seq2 1806 1 1567

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