探索三维体积容积数据查看器应用程序

打开生活的脚本

这个例子展示了如何看待和使用体积探索三维容积数据查看器应用程序。体绘制是高度依赖于定义一个适当的alphamap,以便在您的数据结构,你想看到是不透明和结构,你不想看到是透明的。说明,这个示例加载人类进入核磁共振研究使用查看器应用程序,探讨了数据量的可视化功能查看器的体积。

体积体积数据加载到查看器

这部分的例子展示了如何体积容积数据装载到查看器应用程序。

核磁共振数据加载的人头MAT-file进入工作区。核磁共振数据的修改子集小鬼数据集(1]。此操作将创建一个变量命名D在工作区中包含容积数据。使用挤压命令来删除单维度的数据。

负载核磁共振成像D =紧缩(D);谁

类属性名称大小字节D 128 x128x27 442368 uint8地图89 x3 2136双siz 1 x3 24双

查看器应用程序打开卷。从MATLAB®将来发布,打开应用程序选项卡,并在图像处理和计算机视觉,点击。你也可以打开应用程序使用volumeViewer命令。

volumeViewer (D)

体积体积数据装载到查看器应用程序,单击进口数量。你可以加载一个图像通过指定的文件名或加载一个变量工作区。如果你有体积DICOM格式,它使用多个文件中的数据代表一个卷,您可以指定DICOM文件夹的名字。选择从工作区进口在工作区中选择,因为数据。

选择工作空间变量进口数量对话框,然后单击好吧。

启动一个新实例的体积查看器应用程序,点击新会话。

当您创建一个新的会话时,此选项删除所有数据目前在观众。点击是的创建新会话。

体积体积数据视图查看器

在这部分的示例中,您决定您想要查看的数据。体积观众提供几个选项。

查看卷卷查看器应用程序中。查看器显示的数据量体积和飞机。核磁共振数据显示为一个卷识别出作为人的头。探索体积,放大和缩小的图像使用鼠标滚轮或右键单击。你也可以旋转的体积定位光标在图像窗口中,紧迫和拿着鼠标,光标移动。你总是缩放或旋转中心的体积。轴的位置定位轴窗口反映了图像的空间方位旋转它。

改变背景颜色用于显示窗口,打开3 d显示选项卡,点击背景颜色,并选择一个颜色。

核磁共振数据视图作为一组片飞机。点击片的飞机。你也可以放大和旋转这个视图的数据。使用滚动功能的三片窗口查看个人片的飞机。

继续使用查看器体积功能直到你实现最好的数据视图。

体积体积数据的调整视图查看器

在这部分的示例中,您调整卷的体积数据的视图查看器应用程序。

点击3 d体积返回查看你的数据容量和使用体积观众的能力得到最好的可视化数据。体积查看器提供了几个空间引用选项,让你得到一个更实际的观点的体积。(默认视图的头似乎被夷为平地。)

指定的尺寸——3 d显示选项卡可以指定维度在X, Y, Z方向。

Upsample到多维数据集体积观众计算一个比例因子,使样品的数量在每个维度一样体积最大的维度。这个设置可以使anisotropically抽样数据出现了更正确。

使用体积元数据如果数据文件包括分辨率数据的元数据,体积观众使用元数据和显示体积的真实规模。量观众选择使用体积元数据选项,默认情况下,如果存在元数据。

完善与呈现编辑器视图

这部分的例子描述了如何使用体积观众呈现编辑器来修改你的数据视图。使用呈现编辑器,您可以:

选择整体观察方法:体积渲染,最大强度投影,或等值面。
修改alphamap通过指定预设alphamap,如ct-bone或定制alphamap使用不透明度/图像强度曲线。
指定使用的colormap可视化。
指定可视化的照明。

选择查看的方法

卷查看器提供了几种查看方法卷。的最大强度投影(MIP)选项寻找最高的立体像素强度值为每个射线投影数据。MIP可用于揭示最高强度结构内卷。您还可以查看作为一个量等值面。

指定Alphamap

体绘制是高度依赖于定义适当的alphamap结构你想看到是不透明和结构你不想看到的是透明的。呈现编辑器允许您定义体素值的不透明和透明整个体积。你可以选择从一组alphamap预设自动实现某些定义良好的效果。例如,定义一个视图,能够很好地处理CT骨的数据,选择CT骨呈现预设。默认情况下,体积查看器使用一个简单的线性关系,但每个预设改变剧情的曲线给特定的数据值或多或少的不透明度。你定制alphamap直接通过操纵阴谋。

指定Colormap

颜色,当使用立体像素强度和透明度,体积可视化是一个重要的元素。在呈现编辑器中,您可以选择从一个预定义的MATLAB colormaps列表,等飞机和parula。您还可以指定一个自定义colormap你在工作区中定义为一个变量。还可以更改任何colormap colormapping通过使用交互式颜色条的规模。例如,减轻可视化中的颜色值,点击颜色栏创建一个圆形滑块。修改colormapping,这样更多的值映射到一些较亮的颜色,移动滑块向左。您可以创建多个颜色栏上的滑块来定义其他colormappings。