请随时查看NIfTI_tools.pdf的详细描述和最新更新。

如果您对分析图像的左/右感到困惑，请阅读UseANALYZE.pdf。

您可能还想通过FAQ.pdf获取实用解决方案和真实示例。金宝搏官方网站

基本程序:

1.load_untouch_header_only.m：只加载NIfTI或ANALYZE文件的header部分，自动检测输入文件，NIfTI文件返回NIfTI结构，ANALYZE文件返回ANALYZE结构。

2.load_nii.m：加载N维NIfTI文件（其中N可以是3到7）或分析文件（其中N可以是3到4），并将标题信息（例如仿射几何变换、体素强度缩放等）应用于数据。如果您的文件具有3维以上（例如时间序列等），还可以指定仅提取1个或多个卷的范围。

3.save_nii.m：将由“load_nii.m”或“make_nii.m”加载的N维NIfTI结构（其中N可以是3到7）保存到NIfTI文件中。

4.make_nii.m：基于N维矩阵和其他可选参数（例如体素大小、原点等）生成N维NIfTI结构（其中N可以是3到7）。使用“save_nii”命令，可以将由“make_nii”生成的NIfTI结构保存到NIfTI文件中。

5.make_ana。m:基于3D矩阵和其他可选参数(如voxel_size, origin等)制作3D ANALYZE结构。使用“save_untouch_nii”命令，可以将由“make_ana”生成的ANALYZE结构保存到ANALYZE文件中，以便与某些ANALYZE only程序兼容。

6.reslice_nii。m:重新采样3D(或4D) NIfTI文件，或。mat文件中带有仿射矩阵m的ANALYZE文件，并将重新采样的数据保存到新的NIfTI文件中。该程序将基于仿射矩阵，这是特别有用的斜图像与非正交旋转或剪切，不能加载“load_nii.m”。你也可以指定voxel_size等。只要你记得在使用"reslice_nii.m"后不要做切片时间校正，就不会产生负面影响。

7.pad_nii。m:在NIfTI结构中从六个方面中的任何一个填充体积，同时保持发起者、体素大小、数据类型和描述不变。在您使用reslice_nii之后，这个程序特别有用，因为新卷很可能有不同的维数。

8.clip_nii.m：从六个面中的任意一面剪裁NIfTI结构中的体积，同时保持原始体、体素大小、数据类型和描述不变。使用reslice_nii后，该程序特别有用，因为新卷很可能具有不同的维度。

9.view_nii。m:查看和编辑3D(或4D) NIfTI或分析结构，由“load_nii. m”加载。或由make_nii.m制作。激活图、ROI等可以叠加在背景图像上(见上图)。绘制的视图可以嵌入到现有的图形窗口中。如果您将其作为一个单独的程序使用，它还可以编辑图像的方向和体素值，查看体积直方图，并保存修改后的图像。

10.load_untouch_nii。m:加载N维NIfTI文件(N可以从3到7)或ANALYZE文件(N可以从3到4)，但不应用头部指示的任何更改。警告:不要使用"view_nii. "以查看由load_untouch_nii.m加载的结构。

11save_untouch_nii.m：将“load_untouch_nii.m”加载或“make_ana.m”生成的N维NIfTI结构（其中N可以是3到7）或分析结构（其中N可以是3到4）保存到新的NIfTI或分析文件中。如果不修改加载的数据集，则新保存的文件中的标题和数据应与原始文件中的标题和数据相同。

其他项目:

1.collapse_nii_scan。m:将多个单扫描NIfTI或ANALYZE文件集成到一个多扫描NIfTI文件中。

2.expand_nii_scan。m:将一个多次扫描的NIfTI文件分解为多个单次扫描的NIfTI文件。

3.save_untouch_slice。m:保存回原始图像，其中包含由load_untouch_nii加载的部分切片。您可以以任何方式处理这些切片矩阵，只要它们的维数没有改变。

4.get_nii_frame.m：返回NIfTI文件的时间帧数。

5.flip_lr。m:沿平面左右翻转NIfTI或ANALYZE文件，并将L-R翻转数据保存到NIfTI文件中。警告:请谨慎使用此程序，尽管您总是可以翻转它。

6.load_nii_ext。m:从NIfTI文件加载头扩展名。

7.mat_into_hdr。m:将旧SPM .mat文件中的仿射矩阵集成到它的。hdr头文件中。因此，ANALYZE文件被转换为带有更新后的.hdr头文件的NIfTI文件。