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水分子聚类算法

版本1.0.1(1.32 MB)的几率 彼得亚雷Pieczywek
算法设计集群水从MD模拟粒子根据坐标分成同样大小的组。
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Actualizado2022年7月8日

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算法设计集群水从MD模拟粒子根据坐标分成同样大小的组。它是用于聚合non-bounded MD(水)分子为了它们的参数映射到粗粒度模型(如基于耗散粒子动力学)。参见下面出版过程的完整的描述:
Pieczywek,点Płaziński, w . & Zdunek a homogalacturonan耗散粒子动力学模型,基于分子动力学模拟。Sci代表14691 (2020)。https://doi.org/10.1038/s41598 - 020 - 71820 - 2
输入数据应该包含分子的坐标矩阵连续的MD模拟帧。样本数据包含在文件“test_data.mat”。脚本”的例子。垫”澄清的函数是如何工作的。

Citar科莫

彼得亚雷Pieczywek (2023)。水分子聚类算法(//www.tatmou.com/matlabcentral/fileexchange/91685-water-molecules-clustering-algorithm), MATLAB中央文件交换。Recuperado。

Pieczywek,点Płaziński, w . & Zdunek a homogalacturonan耗散粒子动力学模型,基于分子动力学模拟。Sci代表14691 (2020)。https://doi.org/10.1038/s41598 - 020 - 71820 - 2

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