请始终查看NIfTI_tools.pdf以了解详细说明和最新更新。

如果您对ANALYZE图像的左/右感到困惑，请阅读UseANALYZE.pdf。

你也可以通过FAQ.pdf找到实际的解决方案和实例。金宝搏官方网站

基本课程：

1.load_untouch_header_only。m:只加载NIfTI或ANALYZE文件的头部分。输入文件将被自动检测。对于NIfTI文件将返回NIfTI结构，对于ANALYZE文件将返回ANALYZE结构。

2.load_nii。m:加载N维NIfTI文件(其中N可以从3到7)或ANALYZE文件(其中N可以从3到4)，并应用头部信息(如仿射几何变换，体素强度缩放等)到数据。如果您的文件超过3维(例如时间序列等)，您也可以指定一个范围，只提取1或几个卷。

3.save_nii。m:保存由“load_nii. m”加载的N维NIfTI结构(N可以从3到7)。或由make_nii制造。m”，进入NIfTI文件。

4.make_nii。m:基于N维矩阵和其他可选参数(如voxel_size, origin等)，制作N维NIfTI结构(其中N可以是3到7)。使用“save_nii”命令，可以将由“make_nii”生成的NIfTI结构保存到NIfTI文件中。

5.make_ana。m:基于3D矩阵和其他可选参数(如voxel_size, origin等)制作3D ANALYZE结构。使用“save_untouch_nii”命令，可以将由“make_ana”生成的ANALYZE结构保存到ANALYZE文件中，以便与某些ANALYZE only程序兼容。

6.reslice_nii.m：重新采样3D（或4D）NIfTI文件，或使用.mat文件中的仿射矩阵m分析文件，并将重新采样的数据保存到新的NIfTI文件中。该程序将以仿射矩阵为基础，该矩阵特别适用于具有非正交旋转或剪切的倾斜图像，这些图像不能用“load_nii.m”加载。您还可以指定体素大小等。只要记住在使用“reslice_nii.m”后不要进行切片时间校正，就不会产生负面影响。

7.pad_nii。m:在NIfTI结构中从六个方面中的任何一个填充体积，同时保持发起者、体素大小、数据类型和描述不变。在您使用reslice_nii之后，这个程序特别有用，因为新卷很可能有不同的维数。

8.clip_nii。m:在NIfTI结构中，从6个侧面中的任何一个截取体积，同时保持发起者、体素大小、数据类型和描述不变。在您使用reslice_nii之后，这个程序特别有用，因为新卷很可能有不同的维数。

9.view_nii。m:查看和编辑3D(或4D) NIfTI或分析结构，由“load_nii. m”加载。或由make_nii.m制作。激活图、ROI等可以叠加在背景图像上(见上图)。绘制的视图可以嵌入到现有的图形窗口中。如果您将其作为一个单独的程序使用，它还可以编辑图像的方向和体素值，查看体积直方图，并保存修改后的图像。

10.load_untouch_nii。m:加载N维NIfTI文件(N可以从3到7)或ANALYZE文件(N可以从3到4)，但不应用头部指示的任何更改。警告:不要使用"view_nii. "以查看由load_untouch_nii.m加载的结构。

11.save_untouch_nii。m:保存由“load_untouch_nii. m”加载的N维NIfTI结构(N可以从3到7)或ANALYZE结构(N可以从3到4)。或由make_ana制作。m”转换成一个新的NIfTI或ANALYZE文件。如果不修改加载的数据集，则新保存文件中的头和数据应与原始文件中的头和数据相同。

其他项目:

1.collapse_nii_scan。m:将多个单扫描NIfTI或ANALYZE文件集成到一个多扫描NIfTI文件中。

2.展开\u nii\u scan.m：将多扫描NIfTI文件分解为多个单扫描NIfTI文件。

3.save_untouch_slice.m：将load_untouch_nii加载的部分切片保存回原始图像。您可以以任何方式处理这些切片矩阵，只要它们的尺寸不变。

4.get_nii_frame。m:返回NIfTI文件的时间帧数。

5.flip_lr。m:沿平面左右翻转NIfTI或ANALYZE文件，并将L-R翻转数据保存到NIfTI文件中。警告:请谨慎使用此程序，尽管您总是可以翻转它。

6.load_nii_ext。m:从NIfTI文件加载头扩展名。

7.mat_into_hdr。m:将旧SPM .mat文件中的仿射矩阵集成到它的。hdr头文件中。因此，ANALYZE文件被转换为带有更新后的.hdr头文件的NIfTI文件。