主要内容

高通量测序

下一代测序（NGS）数据的基因表达，转录因子和甲基化分析，包括RNA-SEQ和CHIP-SEQ

高通量测序方法生成大量序列数据，并需要强大的计算工具进行进一步分析。BioInformitics Toolbox™提供算法来支持下一代测序（NGS）数据的共同分析金宝app工作流程，例如过滤和修剪读数，映射到参考文献，计算映射到基因组特征的读数数量以及执行统计分析。

突出的主题

类别

  • 数据导入
    导入下一代测序（NGS）数据和SAM，BAM，FASTA，FASTQ，GTF和GFF文件的特征注释
  • 预处理
    使用单端和配对的读取，过滤和修剪读数管理NGS数据，并显示质量统计信息
  • 结盟
    地图读取到参考序列
  • 统计分析
    阅读有关RNA-SEQ和CHIP-SEQ数据的摘要和统计分析
  • 可视化
    可视化读取与参考序列的对齐