Zeffiro Interface (ZI), Sampsa Pursiainen©2018,是一个开放源代码
程序包构成了一个基于有限元(FE)的可访问工具
脑电/脑磁图的正、反仿真,也可用于其他领域
针对大脑的生物电磁成像应用。子,
一个人可以分割一个现实的多层几何和生成
多室FE网格,如果三角形ASCII表面网格(DAT或
ASC文件格式)。一个合适的曲面分割可以
例如,使用FreeSurfer软件套件制作(版权所有©
FreeSurfer, 2013)。ZI还允许导入由FreeSurfer创建的分割
以便区分不同的大脑区域,从而进行分析
大脑功能在一个时间序列中的连通性。不同的
隔间可以定义为活动的,允许分析
分皮质凖。在每个隔间,朝向
活动通常可以是受限的,也可以是不受限的。主要的
ZI的例程在计算机上可以显著加速
使用图形计算单元(GPU)。特别推荐
进行正向模拟过程,即生成有限元网格
引出场矩阵并在不同的点集之间进行插值,
利用GPU。经过前向仿真阶段后,模型即可
处理也没有GPU加速。
简要介绍一下界面的基本特性即可
发现:
https://github.com/sampsapursiainen/zeffiro_interface/wiki
接口本身已经被引入:
He, Q., Rezaei, A. & Pursiainen, S.(2019)。Zeffiro用户界面
电磁脑成像:GPU加速有限元工具向前
Matlab中的逆计算。Neuroinformatics,
doi: 10.1007 / s12021 - 019 - 09436 - 9
在界面中使用的基本数学技术已经
评审和验证:
Miinalainen, T., Rezaei, A., Us, D., Nüßing, A., Engwer, C., Wolters, C.。
H., & Pursiainen, S.(2019)。一个真实,准确和快速的来源
脑电正演问题的建模方法。科学杂志184年56 - 67。
Pursiainen,美国(2012年)。适用于应用脑电图的raviart - thomas型源
MEG:执行和结果。数学学报,28(6),065013。
迭代交替序列最大后验概率
反演方法基于:
Calvetti, D., Hakula, H., Pursiainen, S., & Somersalo, E.(2009)。
脑源定位的条件高斯超模型。暹罗
影像科学学报,2(3),879-909。
它已被应用于现实的大脑几何,例如:
Lucka, F., Pursiainen, S., Burger, M., & Wolters, C. H.(2012)。
基于层次贝叶斯推理的脑电逆问题
仿真头部模型:深度定位和源分离
焦点主要电流。科学杂志,61(4),1364 - 1382。
电流保持源模型结合了线性(面交)
和二次(沿边)元素通过位置优化
(PBO)方法和10源模板,其中4个面源和6个边缘
源应用于每个包含源的四面体元素:
张志强,张志强,张志强,等。
(2015).Whitney (Raviart-Thomas)型源模型的比较研究
基于有限元法的脑电正演模拟。IEEE
生物医学工程,62(11),2648-2656。
Pursiainen, S., Vorwerk, J. & Wolters, C. H.(2016)。
利用H (div)有限元进行脑电图正演模拟
震源与焦点插值。物理学报,61(4):457 - 461
8502.
引用作为
Sampsa Pursiainen(2021)。脑成像的Zeffiro正向和反向接口GitHub (https://github.com/sampsapursiainen/zeffiro_interface)。检索.