Bioinformatics工具箱
Leggere,Analizzare E Visualizzare Dati Genomici E蛋白质
Bioinformatics Toolbox™Contiene Algoritmi E APP每IL Shequenziamento di Nuova Generazione(NGS,下一代测序),L'Analisi di MicroArray,La Spettrometria di Massa E L'Ontologia Genica。Grazie Alle Funzioni del Toolbox,è可能leggere dati genomici exceomici da formati文件标准sam,fasta,cel e cdf,oltre che da data database在线来到Il Gene表达omnibus dell'ncbi e Genbank®。èChoribileesplorare eVisualizzare Questi Dati Con浏览器Di Shequenziamento,Mappe di Calore Spaziali E Clusterram。Il Toolbox Disope Anche di Tecniche Statistiche Per Il Rilevamento di Picchi,L'Traveuzione di Valori每我Dati Mancanti e La Selezione Delle功能。
Positibile Combinare Le Funzioni del Toolbox Per S金宝apphiteSare Flussi di Lavoro di Bioinformaticapiùdiffusi。èCosibibleUSARE Dati Chip-SEQ每个人I Fattori di Trascrizione;Analizzare I Dati RNA-SEQ每个人I Geni Interprisemente浓咖啡;Trovare Le Varianti Del Numero di Copie E在Dati di MicroArray中的Gli SNP;Classificare I Profili Delle Proteine usando dati di spettrometria di massa。
Maggiori Informazioni Sulla.Biologia Computazale。
Inizia Ora:
Bioinformatics工具箱offre algniche e tecniche divestiveizaione per svolgere analisi nell'ambito del shedenziamento di nuova generazione(ngs)。IL Toolbox Conserente di Analizzare Interi Genomi eSeguendo,Al Contempo,Dei Calcoli A Un Livello di Risoluzione di Coppia di Basi。èChoribibleUSARE IL浏览器NGS每个Visualizzare e Studiare Gli Allineamenti delle读取Corte Usando读取Corte di Tipo Single-End O结束。èCheCositibileCostruire常规Di Analisi Perforfizzate,来illustrato oppti Esempi Che Seguono。
Visualizzaione e Studio Dell'allineamento delle读取科尔特
Usando Il浏览器NGS,èConsibileVerificaree Studiare L'Allineamento Delle Sequenze di读取Corte Supporto delle分析a金宝appnalisi Che Misurano la Variazione Genetica E L'Espressione Dei Geni。IL浏览器NGS同意DI:
- Visualizzare dati di读取Corte Allineati A Una Sequenza di Riferimento Nucleotidica
- Confrontare Diversi Set di Dati Allineati Rispetto A Una Sequenza di Riferimento Commune
- Visualizzare La Copertura delle Diverse Basi E Regioni Della Sheadenza di Riferimento
- Studiare laqualitàealtridettagli delle读取所有内容
- 个人披风脱离了一个Errori di Chiamata delle Basi O脊髓蝇
- Visualizzare Inserimenti edielinazioni
- 休养是一个相对于一个特定地区的特征
我们可以给读过的内容排序
我将Di Dati Urilitzati设置为analisi del shemenziamento di Nuova Generazione Spesso Sono Tropi Grandi Per La Memoria Fisica。Bioinformatics工具箱Mette A Disizione Degli Appositi Contanitori di Dati Che Consentono di Analizzare Genomi Interi。
L 'oggetto生物indexedfile.
同意di accedere al contenuto dei文件di testo che contengono voci di di diminience non supplyi guest le sendenze,Le Annotazioni E I Riferimenti IncoCiati Al Set Di Diati。Quest Oggetti Possono Essere Generati A Partire Da Tabelle,平面文件O Formatii每种确定应用程序SAM,Fasta E FastQ。
Nella Classe.BioMap
Vengono Salvate Informazioni Dalle Sequenze di Reads Corte,Complesi Gli Header Delle Sequenze,Le Sendenze Di Reads,I PunteggidiQualitàeiTeiRelativi All'allineamento E Alla Mappatura Rispetto Ad Unica Shequenza di Riferimento。èCurizileuperizzareproprietàdi oggetti e esplorare,Accedere,Filtrare e Manipolare I Dati Contenuti在Un Oggetto Biomap。
Qualcarizzione di microarray
èConsibibileUSARE Diversi Metodi Per Qualizzare I Dati Di Microarray,ComplosaLacomenizzazione Lowess,Della Media Globale,Della Deviazione Mediana Assoluta(Mad)e La Normalizzazione Stime。Questi Metodi Possone Essere Applati All'Intero Chip Del MicroArray O区域o Blocchi特定。Le Funzioni di Filtraggio E Stationuzione Consenterono di ulire i dati grezzi prima di eseSuire le Analisi e Le rustine divestiveizzione。
Analisi E Visualizzione dei Dati
生物信息学工具箱一致同意我们的背景,我们的表达方式,我们的表达方式,我们的表达方式,我们的表达方式®Usando LE程序强大的多阵列平均值(RMA)e GC鲁棒多阵列平均值(GCRMA)。è可以申请Una semmentazione Binaria Quinolare AI Dati Di Array-CGH E Stimare IL Tasso Di Falsa Scoperta diPiù测试Di ipotesi dei dati di Espressione dei Geni A Partire Da Un Esperimento Su UN Microarray。在(PIU),è不可能性eseguire LA normalizzazione一个兰戈invariante sulleintensità阿尔探空仪每彪文件CEL的Affymetrixö绥valori二espressione代GENI一个partire哒由于condizioni sperimentali多样化。
Le常规专业专长每拉宫桂节dei dati dei microarray comand comono i火山图,i broadloplot,i grafici log-log,i grafici i-r e le mappe di Calore spaziali del microarray。èChePossibileVisualizzareDilegli Idegography Con Pattern Di G-anding。
乌斯索乐常规迪统计和机器学习工具箱™,èChisibible类I Risultati,Eseguire IL Clustering Gerarchico E K-Meance,Oltre A Rappresentare I Dati del MicroArray在Visualizzaioni Statistiche,我来了Intressgram 2D Con Ordinamento Ottimale Delle Foglie,Mappe di Calore,I Grafici Delle Componenti Principali E Gli Alberi di分类齐见。
生物信息学工具箱提供了一套用于分析光谱的方法。通过对不同品种的SELDI、MALDI、LC/MS和GC/MS的分析,对不同品种进行了分类鉴定。先精化后理解,再线性化,再校准,再重新校准,再重新校准,再重新校准。È和其他可能的方法,如LC/MS / GC/MS等。È可能的eseguire il plottaggio di più spettri contemporaneamente。
我们可以线性化,也可以标准化。如果你是统计学的一名学徒,你就会发现你是一个分类的个体,你就会发现你是一个生物标记。
我很高兴看到你
Bioinformatics工具箱同意DI Applicare La Teoria dei Grafi基地A Matrici稀疏。Possibile Creare,Visualizzare e Manipolare Grafi来Le Mappe di Interazione,I Grafici Gerarchici e途径。Lo Strumento Consente Di Matchinare e Visualizare i PercorsiPiùBrevi Nei Grevi,Verificare I Cicli Nei Digrafi E Trovare Isomorfismi Tra DuS Grafi。
Apprendimimeno Statistico E Visualizzione
生物信息学工具箱提供了统计学分类算法的实用工具统计和机器学习工具箱,tra cui:
- Classificatori支金宝app持向量机(SVM)e K-Interlight邻居
- Funzioni /整体灯节esperimenti di交叉验证E Misurare Le Prestazioni Dei Vari Metodi Di Classificaione
- STRIMALI Interativi Per La Selezione Delle特色,La Mappatura E La Visualizzaione di Grafici Gerarchici E途径
Ontologia genica
Bioinformatics Toolbox Permette di Accedere Al Database Del Progetto基因Intology da Matlab®,di analizzare i文件安宁蒂迪纳洛洛世Genica e di Ottienere dei sottogruppi dell'ontologia来到Gli Antenati,我Discendenti o我hentri。
Allineamento di Sendenze.
IL Toolbox Mette A Distosizione Funzioni,Oggetti e Metodi Per L'Analisi Delle Sequenze,Compleso l'Allineaeao A Coppie,Multiplo E Di Profili di Sendenze。Sono Complesi:
- Miffileazioni Matlab Di Algoritmi标准PerMeaeali Di Sendenze Locali E Globali,来L'Algoritmo Di Createrleman-Wunsch,Smith-Waterman E Quello del Modello Nascosto di Markov
- AllIneamento di Sendenze多进步
- Rappresentazioni Grafiche delle Matrici dei Risultati degli Allineamenti
- Matrici di punteggio标准,来Le Famiglie di Matrici Pam E Blosum
- Calcolo Delle Sequenze Consenso E Visualizzione del Logo Della Shequenza
相对等位基因序列的统计效用
IL Toolbox Consente di Manipolare e Analizzare le Proprie Sequenze每个ComperendersPiù是一个Fondo I Propri Dati。è可能:
- 转化,测序,DNA和RNA测序,测序,基因
- Svolgere analisi Statistiche Sulle Sequenze e Cercare Pattern特定机构All'Terno di Una Sequenza
- Asemluire La Digestione in-silico dele shedenze o casi di测试的硅胶la消化e Proteasi
- prevedere la struttura secondaria con il minimo dell'energia libera delle sendenze di Rna
Visualizzazione delle sendenze.
IL Toolbox Conserente di Visualizzare Sequenze e Allineaeali。è可能奥泰伦Mappe lineari o circolari delle sequenze注释on features genbank。è可以Visualizzare i diagrammi delle strutture stuparie di Una sequenza di Rna。degli strumenti divestiveione Interattivi Consenterono di esplorare e Modififare Gli Allineamenti di shedenze多个oppie。
analisi di Alberi丝瘤
IL Toolbox Conserente di Creare E Modififare Alberi Fileogyi。è可能性callare le distanze tra le coppie,tra shedenze di nucleotidi o amminoacidi o amminaacidi oalineate o meno,usando un'ampia gamma di metriche di somiglianza,来jukes-cantor,p远程,对齐 - 分数o un altro metodo defiredo dall'utente。GLI Alberi Fileogyi vengono costruiti usando collegamenti gerarchici con tecniche多样化,来邻居加入,legame singolo e primento e upgma(未加权对组方法平均值)。
Il Toolbox 金宝appSupporta IL Calcolo Del Peso E Lo Spostameno Delle Radici degli Alberi,Il Calcolo Dei Subtree E Della Forma Canonica Degli Alberi。Lo Strumento diVisualizzazione degli Alberi Filogycii同意Di Potare,Riordinare e Rinominare I Rami;esplorare le distanze;Leggere o scrivere文件在formato di newick中。èChePossibile Usare Gli Strumenti di Annotazione Disonibili在Matlab in Matlab Alberi Alberi Da Chineseazione。
analisi delle carateristiche delle proteine
IL Toolbox Offre Tecniche Per Analizzare Le Sendenze di Proteine,Compres Perle常规Per IL CalcoloProprietàdiUna Sequenza di Peptidi来La Composizione Dell'atomo,Il Punto Isoelettrico E IL PESO Sollarare。è可能确定洛杉矶Composizione Degli Amminoacidi Delle Sequenze Di Proteine,Scindere Una Proteina Con Un Enzima E Craree Graficii Del骨架E Grafici di Ramachandran di Dati Pdb。è可能usare inl序列工具per vedere leproprietàdi una sequenza di Amminoacidi o Il分子观众每个Visualizzare e Manipolare Strutture Sollatulari 3D。
Formati Dei File e Accesso AI数据库
è可以使用Dati Biologici的Formati文件标准,一个数据库在线e Siti Web。生物信息学工具箱同意迪:
- 我们使用FASTA, PDB和SCF格式的文件
- Leggere I Dati Dei MicroArray D Formati文件来我文件Affymetrix DAT,EXP,CEL,CHP E CDF;Dati di Risultati Imagene®;文件安捷伦®特征提取软件;文件Genepix.®GPR e Gal.
- Leggere I Dati da数据库在线来到Genbank,Embl,NCBI Blast E PDB
- ImportArt Dati Dirtittamente Dal Sito Web Del基因表达式omnibus dell'ncbi Con Unico Comando
- 在ucsc的书面文件中,我们可以把它写在表意文字上
- Leggere Dai di spettrometria di massa da文件mzxml e Jcamp-DX
Condivisione di Algoritmi E Distribuzione Di Applicazioni
Matlab Offre Strumenti每个Trasformare联合国Profirecta软件Plessizzata的Dei Dati Dei Dati。Sono Complesi Strumenti di Sviluppo Per La Creazione di Interfacce Utente,Un Ambiente di Sviluppo积分帕迪瓦e联合国探查器。I Prodottio Persottizione Delle Applicaii opmazioni Matlab Consentono DI Integrare i Propri Algoritmi Matlab Con Con Codice C,C ++ E Amplicaioni Java™Esistenti,DI Distribure e Alcritmi Sviluppati e Le Interfacce Psurbleizzate firformizzate feedizzate specizeions starceize opplionionialstone,di convertion gli alcoritmi matlab在Componenti Microsoft®.Net o com a cui sipuòachaceraqualsiasi应用程序苏基com e di crahe加载项di microsoft Excel®。
è可以整容Matlab Con Gli Strumenti di BioinformaticaPiùUSATI来生物培养器,I Servizi Web Basati Su Soap E I插入COM。