主要内容

非线性回归

最小二乘估计,以适应分组或汇集的数据,单一或多个实验

功能

适合 使用SimBiology问题对象进行参数估计
sbiofit 执行非线性最小二乘回归
sbionlinfit 执行非线性最小二乘回归使用SimBiology模型(需要统计和机器学习工具箱软件)
sbioparamestim 进行参数估计
sbiosampleparameters 通过采样协变量模型生成参数(需要统计和机器学习工具箱软件)
sbiosampleerror 在误差模型的基础上采样误差,并在仿真数据中加入噪声
sbioparameterci 计算估计参数的置信区间(需要统计和机器学习工具箱
sbiopredictionci 计算模型预测的置信区间(需要统计和机器学习工具箱

对象

fitproblem SimBiology问题对象的参数估计
groupedData 表格式的数据和元数据集合
EstimatedInfo对象 对象,该对象包含关于估计模型数量的信息
LeastSquaresResults对象 结果对象包含估计结果的最小二乘回归
可观测的 包含模拟后计算表达式的对象
OptimResults对象 的子类LeastSquaresResults
NLINResults对象 的子类LeastSquaresResults
ParameterConfidenceInterval 包含估计参数的置信区间结果的对象
PredictionConfidenceInterval 包含模型预测的置信区间结果的对象

应用程序

SimBiology模型构建器 交互式地建立QSP、PK/PD和机械系统生物学模型
SimBiology模型分析 分析QSP, PK/PD和机械系统生物学模型

例子和如何做

应用程序工作流程

使用SimBiology模型分析仪App计算NCA参数并拟合模型到PK/PD数据

通过非线性回归拟合实验PKPD数据,进行非分室分析和校准模型参数。

程序化的工作流程

基于SimBiology问题的工作流程拟合PK参数

这个例子展示了如何使用SimBiology问题对象估计模型参数。

将一室模型与个人PK剖面相匹配

这个例子展示了如何将个体的PK剖面数据与一室模型拟合,并估计药代动力学参数。

将二室模型与多个体PK谱拟合

这个例子展示了如何使用二室模型估计多个个体的药代动力学参数。

估计多个个体的特定类别PK参数

这个例子展示了如何使用来自多个个体的PK配置文件数据来估计特定类别的参数(例如层次模型中的年轻与年老、男性与女性)、特定于个体的参数和群体范围的参数。

使用sbiofit执行混合优化

这个例子展示了如何配置sbiofit来执行混合优化。

概念

非线性回归

回归模型的目的是将响应变量描述为自变量的函数。

金宝appSimBiology中支持的参数估计方法

SimBiology®金宝app支持各种优化方法的最小二乘和混合效应估计问题。

误差模型

SimBiology支金宝app持如下表所示的误差模型。

情节进展

在使用过程中,进度图提供了参数估计状态的实时反馈sbiofitsbiofitmixed,或者是合适的数据项目SimBiology模型分析应用程序。