创建跟踪模拟冠状病毒的传播(COVID-19)。情况下获得的数据在网络上和安装在一个物流模型来预测流行病传播。
操作包含脚本加载文件夹COVID19Modelingv2并在命令提示符中输入下面的代码:COVID19Modelingv2(“国家”)。
例如:COVID19Modelingv2(“我们”)。可以同时分析多个国家将他们放置在列表:COVID19Modelingv2(“我们”、“意大利”)。
该模型是由米兰巴蒂斯塔(fitVirus)。数据模型是数据驱动的模型符合流行对数曲线。模型的目标是使当地预测病毒传播和流行持续时间。该模型可用于提供准确的近似在某些情况下。“纯粹的回归融合可能会失败初始猜测或小数据集,因此该方法不适用于传染病的早期阶段。此外,结果是无用的,如果回归统计不符合最低标准,说R ^ 2 > 0.8, p值< 0.05。”(Milan Batista)
免责声明:模型在某些情况下将会失败。应该在所有执行严格的统计分析结果。模型失败时额外的流行阶段(不是逻辑功能描述)。使用自己的自由裁量权。
数据存储提供在线和通过JHU CSSE从各种来源,包括:
“世界卫生组织(世卫组织),DXY.cn。一支持肺炎。2020年,
国家健康委员会的人吗?中华民国(NHC),
中国疾病防控中心(CCDC),香港卫生署,澳门政府,台湾疾控中心、美国疾病预防控制中心,加拿大政府,澳大利亚政府健康部门、欧洲疾病预防和控制中心(ECDC)和新加坡卫生部(卫生部)”
在图上,流行率与蓝线绘制(例/天)。蓝点是实际感染率(例/天)。区域颜色独立流行过渡阶段:
红色——快速增长阶段
黄色——过渡到稳态阶段
绿色——结束阶段
引用作为
JM2系列(2021)。COVID-19建模(//www.tatmou.com/matlabcentral/fileexchange/74632-covid-19-modeling), MATLAB中央文件交换。检索。
> > COVID19Modelingv2(“中国”)
错误使用COVID19Modelingv2(第94行)
行索引超出表维度。
这怎么能是固定的吗?
抱歉错误
COVID19Modelingv2(“我们”)
错误使用COVID19Modelingv2(47)行
表变量名必须特征向量。
错误使用COVID19Modelingv2(47)行
表变量名必须特征向量。
嗨,尤金,
三参数逻辑模型拟合的数据。
这是形式:/ (1 + B * exp (t - c *))
最好的,
杰克
这个项目完美工作。我有一个常规配件的连续形式逻辑,但我想出略有不同(低)的K值我需要追踪如何拟合3参数模型,当物流是基于r & K。
错误使用livemapcovid19(46行)
表变量名必须特征向量。
(MATLAB2018a)
更新
需要优化工具箱不是目前在提交声明。
这里是国家级数据来源:https://covidtracking.com/data/
原始数据仍然存在,但不再更新。
你好医生,
原始数据集被中断源。看到“https://data.humdata.org/dataset/novel -冠状病毒- 2019 ncov病例”。
不幸的是,没有什么我能做的。最初我并没有打算让这个模型提供国家级造型。我会让你知道如果我找到一个新的数据源。
杰克
我看不出美国爆发在网上输入文件路径为结果变量。之前的版本有一个路径为我们结果,数据来源,每个州爆发了。这是需要协助区域规划。
当我运行这个版本我得到以下错误- >输出参数太多了。
我们可以让这些源数据的状态恢复到excel文件输入路径?和确认,另一个看到我的同样的错误吗?
优秀的工作。运行的很好。谢谢你的辛勤工作。
固定所有兼容性问题(希望)
嗨Suksan。这是一个兼容性的问题,我仍然试图解决。我版本的代码运行良好(2019 b)。
出色的工作,但当我运行代码给我这个错误:
无法识别的属性“PreserveVariableNames”类
“matlab.io.text.DelimitedTextImportOptions”。
错误fitVirusCV19v3(第132行)
选择。PreserveVariableNames = true;
你好,摩根,
我跑2019 b没有问题。必须有一个兼容性问题的导入数据。我将工作在一个更健壮的方法。
杰克
收到此错误,R2020a使用版本。
错误使用COVID19Modelingv2(第62行)
复制表变量名:“南”。
嗨Tsotne。我听说从其他用户,这是一个兼容性问题。最简单的修复将会升级你的MATLAB - 2019 b或更新。
“从R2019b,变量名和行名称可以包含任何字符,包括空格和非ascii字符。同时,他们不仅可以从任何字符,字母。变量和行名称不需要有效的MATLAB标识符(如由isvarname函数)。保存这些变量名称和行名称,设置PreserveVariableNames真实。”
非常感谢你的工作。我有这个错误
无法识别的属性“PreserveVariableNames”类“matlab.io.text.DelimitedTextImportOptions”。
错误COVID19Modelingv2(24)行
选择。PreserveVariableNames = true;
我应该做什么?
嗨,每个人,我想看到的哪一部分文档是空的。我找不到,你能帮我吗?我得到消息:
错误使用matlab.io.text.TextImportOptions /组。DataLine(第73行)
DataLine必须是一个正整数。
错误COVID19Modelingv2(23行)
选择。DataLine =(2,正);
我用R2017b
谢谢!
谢谢医生。我将试着接触的人保持数据集。这是非常动态的希望它很快就会被更新。
嘿每个人。这是不错,但它已经停止工作。建议对死亡的更新文件,这个模型取决于列3/21失败。如果有人进入修复这一列这将获得开始工作。否则,解决方案。把文件下载到本地文件夹和用readtable代替
webread ('https://proxy.hxlstandard.org/api/data preview.csv?url=https%3a%2f%2fraw.githubusercontent.com%2fcssegisanddata%2fcovid - 19% - 2 - fmaster%2fcsse_covid_19_data%2fcsse_covid_19_time_series%2ftime_series_19 covid deaths.csv&filename=time_series_2019 - ncov deaths.csv
如果你固定空数据在3/21的死亡。csv在本地文件夹,我们下面的事情会工作获得直到在线文件是固定的。
%使用本地数据,因为在线数据似乎打破了此刻
结果= readtable (“time_series_2019-ncov-Confirmed.csv”);
deathresult = readtable (“time_series_2019-ncov-Deaths.csv”);
ilPlus30我得到同样的错误。我相信这是一些版本兼容性问题。我能够为我的国家运行脚本进行一些更改代码。具体的问题,解决的办法是改变选择的代码。DataLines =(2,正);选择。DataLine =(2,正);因为没有DataLines变量选择。
嗨iiPlus30。这是一个最有可能与MATLAB版本兼容性问题。其他用户和我没有遇到这个错误。你运行的是什么版本?
不存在公共财产DataLines matlab.io.text.DelimitedTextImportOptions为类。
错误COVID19Modelingv2(23行)
选择。DataLines =(2,正);
这是工作对每个人都正确吗?