系统树图与自定义着色

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卡 2017年2月14日

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//www.tatmou.com/matlabcentral/answers/324932-dendrogram-with-custom-colouring

编辑: T0m07约5小时前

答:接受亚当

嗨,我是准备在MATLAB系统树图。我可以设置颜色阈值如下:

                         > >图()
                        
                         H =系统树图(树,0,“ColorThreshold”1);
                        
                         集(H,“线宽”,1.5)

这给下面的输出:

我有两个问题关于上图:

1)我怎么能只有MATLAB颜色最大的集群低于我的阈值(这是一个红色)

2)如何指定颜色

提前谢谢。

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在回答这个问题。

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亚当 2017年2月14日

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//www.tatmou.com/matlabcentral/answers/324932-dendrogram-with-custom-colouring answer_254711

如果你使用

线=系统树图(…)

语法你会得到一个处理数组作为输出。这将处理行创建。这些可以单独颜色和任何你想要的颜色。我想指定的行命令是leafOrder虽然我没有检查。

                             X =兰德(10,3);
                            
                             树=连杆(X,“平均”);
                            
                             D = pdist (X);
                            
                             leafOrder = optimalleaforder(树,D);
                            
                             图()
                            
                             h =系统树图(树,“重新排序”,leafOrder);
                            
                             h (1)。颜色=“r”;
                            
                             h (8)。颜色= (0.5 0 0);

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卡 2017年2月14日

排序,谢谢。

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答案(1)

micholeodon 2021年4月14日

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//www.tatmou.com/matlabcentral/answers/324932-dendrogram-with-custom-colouring answer_675031

编辑:micholeodon 2021年4月14日

这是你如何从你的系统树图得到颜色和链接它与观察。

通过改变颜色的属性下面的行存储在h变量可以改变颜色在你的系统树图。

                             清晰;关闭所有;clc;
                            
                             % %生成示例数据
                            
                             rng (“默认”)%的再现性
                            
                             N = 10;%的观察
                            
                             X =兰德(N, 3);
                            
                             % %获得联系
                            
                             树=连杆(X,“平均”);
                            
                             % %获得所需数量的集群
                            
                             nClusters = 2;
                            
                             截止=值([树(end-nClusters + 1, 3)树(end-nClusters + 2, 3)));
                            
                             % %画树
                            
                             图
                            
                             h =系统树图(树,“ColorThreshold”,截止);% h包含线对象
                            
                             % %选取颜色
                            
                             linesColor = cell2mat (get (h,“颜色”));%得到线颜色;
                            
                             colorList =独特(linesColor,“行”);
                            
                             %注意,每一行一行对应的同一行树
                            
                             %变量。我使用下面的这个性质。
                            
                             X_color = 0 (N, 3);
                            
                             X_cluster = 0 (N, 1);
                            
                             为iLeaf = 1: N
                            
                             [iRow ~] =找到(树= = iLeaf);
                            
                             颜色= linesColor (iRow:);% !
                            
                             %的颜色分配给每一个观察
                            
                             X_color (iLeaf:) =颜色;
                            
                             %将集群数量分配给每一个观察
                            
                             X_cluster (iLeaf:) =找到(ismember (colorList,颜色,“行”));
                            
                             结束
                            
                             % %改变线的颜色
                            
                             h (5)。颜色= [0 1 0]