均方位移(MSD)分析是胶体研究和生物物理学中常用的一种技术，用于确定随着时间的推移粒子的位移模式。特别是，它可以帮助确定粒子是否:
-自由扩散;
——运输;
-在运动中受到限制。
在此基础上，它还可以导出运动参数的估计值，如扩散系数。

@msdanalyzer是一个MATLAB的逐值类，有助于执行这种分析。用户提供他测量过的几个轨迹，类可以为确定运动模式派生出有意义的量。

@msdanalyzer可以处理不同时开始的轨迹(粒子轨迹)，具有不同的长度，有缺失检测(间隙:一个粒子未能在一个或几个帧中被检测到，然后重新出现)，并且没有相同的时间采样。一旦您将您的轨道添加到类，一切都是透明的。它提供了绘制和检查数据的工具，无论是单个粒子，还是总体平均量。它有几种方法来校正漂移，这是分析中误差的主要来源。修正后的数据可以通过MSD曲线或速度自相关进行分析。包括MSD曲线的自动拟合(但它们需要您拥有曲线拟合工具箱)，允许导出运动类型及其特征。

包括一个相当长的参考教程，它将向您介绍使用数值模拟的问题，使您重现已发表的结果，并详细说明类如何工作。有些物理学基础是必需的。

http://tinevez.github.io/msdanalyzer/

如果您在工作中使用此工具，我们请您引用以下文章:

纳丁·塔伦蒂诺，让-伊夫·蒂内维斯，伊丽莎白·法里斯·克罗威尔，伯特兰·博瓦松，里卡多·恩里克斯，穆萨·姆兰加，法布里斯·阿古，阿兰Israël和伊曼纽尔·拉普兰廷。TNF和IL-1在诱导NEMO-IKK超分子结构时表现出不同的泛素需求。中华细胞生物学杂志(2014)vol. 204 (2) pp. 231-45

http://jcb.rupress.org/content/204/2/231