scGEAToolbox(单细胞基因表达分析工具箱)

单细胞基因表达分析工具箱

796下载

更新2023年5月21日

从GitHub

查看许可GitHub

有许多特征scGEAToolbox作为单细胞转录组分析的综合功能包。
所有的基本功能
通过简单的点击,您可以探索与用户友好的接口和数据访问更新功能为所有在单细胞转录组分析的基本任务。
可伸缩的三维可视化
scGEAToolbox优化与MATLAB可视化成千上万的单个细胞的高质量的互动技术,帮助您将原始内部数据转换成的见解。
通用的数据集成
scGEAToolbox支金宝app持广泛的cross-study加深你的理解分析和数据集成。公共scRNA-seq地理数据库中的数据可以导入没有编程知识。
免费和开源
生成独立应用程序的源代码可以在GitHub库。你还可以找到相关的引用的出版物通过访问 谷歌学术搜索
独立应用程序
SCGEATOOL ( https://scgeatool.github.io/ 基于scGEAToolbox)是一个端到端的桌面应用程序。SCGEATOOL是一个预编译的独立应用程序提供访问所有功能的scGEAToolbox封装在单个应用程序中。

引用作为

Cai,詹姆斯j .“ScGEAToolbox: Matlab工具箱对单细胞RNA测序数据分析。“生物信息学,由Yann Ponty编辑,牛津大学出版社(牛津大学出版社),2019年11月,doi: 10.1093 /生物信息学/ btz830。

查看更多的风格
MATLAB版本兼容性
创建R2023a
兼容任何释放
平台的兼容性
窗户 macOS Linux
类别
找到更多的在使用应用程序开发应用程序设计师帮助中心MATLAB的答案

社区寻宝

找到宝藏在MATLAB中央,发现社区如何帮助你!

开始狩猎!

+ gui

+ gui / orphons

+ gui /私人

+包裹

+包裹/ orphons

+包裹/私人

+运行

+ /外部/ R_ScType运行

+ /外部/ R_scTenifoldKnk运行

+ /外部/ R_scTenifoldNet运行

+ /外部/ celltype_mat_new运行

+ /外部/ py_harmonypy运行

+ /外部/ py_metaviz运行

+ /外部/ stringdb运行

+运行/私人

+ /第三方/ CSN_transform运行

+ /第三方/ ClusterPack运行

+运行/第三方/战斗

+ /第三方/ DESeq2运行

+ /第三方/ GCL运行

+ /第三方/ GENIE3运行

+运行/第三方/ GENIE3 / RT

+ /第三方/ HCP_hidden_covariates_with_prior运行

+跑步/第三方/魔法

+ /第三方/ MPPC运行

+ /第三方/ McImpute / + McImpute运行

+ /第三方/ Network_Enhancement运行

+运行/第三方/ Network_Enhancement /核心

+ /第三方/ PHATE运行

+ /第三方/ SIMLR运行

+运行/第三方/ SIMLR / src

+ /第三方/ SNNDPC运行

+ /第三方/ SinNLRR运行

+ /第三方/ SoptSC运行

+运行/第三方/ SoptSC / NNDSVD

+运行/第三方/ SoptSC / symnmf2

+运行/第三方/ SoptSC / vinlinplot

+运行/第三方/幽灵

+运行/第三方/幽灵/ LSC

+运行/第三方/幽灵/ dimred

+运行/第三方/幽灵/跑龙套

+ /第三方/ TSEE运行

+ /第三方/ alona_panglaodb运行

+运行/第三方/ alona_panglaodb / msigdb_c8

+ /第三方/ alona_subtypes运行

+ /第三方/ cbrewer运行

+运行/第三方/ faster_svd / lmsvd

+运行/第三方/ faster_svd / svdandpca

+ /第三方/ k-NN-code运行

+运行/第三方/ locfit /源

+跑步/第三方/ locfit / m

+ /第三方/ scGeneFit运行

+运行/第三方/ scGeneFit /源

+ /第三方/ scGeneFit /运行/ classification_metrics来源

+ /第三方/ umapFileExchange运行

+ 10

@SingleCellExperiment

@SingleCellNetwork

私人

资源/ HPA_Single_Cell_Type_Atlas

tensor_toolbox

tensor_toolbox / @ktensor

tensor_toolbox / @tenmat

tensor_toolbox / @tensor

tensor_toolbox / @ttensor

tensor_toolbox /测试

版本使用GitHub缺省分支不能下载

版本 发表 发布说明
23.2.4.0

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v23.2.4

23.2.3.0

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v23.2.3

23.2.1.0

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v23.2.1

23.1.4.0

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v23.1.4

23.1.3.0

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v23.1.3

23.1.2.0

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v23.1.2

23.1.1.0

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v23.1.1

22.9.1

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.9.1

22.7.1

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.7.1

22.6.1

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.6.1

22.5.6

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.5.6

22.4.11

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.4.11

22.4.1

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.4.1

22.3.6

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.3.6

22.3.1

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.3.1

22.2.21

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.2.21

22.2.9

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.2.9

22.1.31

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.1.31

22.1.30

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.1.30

22.1.29

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.1.29

22.1.23

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.1.23

22.1.19

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.1.19

22.1.13

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v22.1.13

21.12.28

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.12.28

21.12.13

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.12.13

21.12.10

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.12.10

21.12.8

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.12.8

21.12.04

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.12.04

21.11.19

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.11.19

21.11.18

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.11.18

21.11.17

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.11.17

21.11.13

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.11.13

21.11.6

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.11.6

21.10.17

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.10.17

21.9.30

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.9.30

21.9.23

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.9.23

21.9.7

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.9.7

21.9.3

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.9.3

21.9.2

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.9.2

21.8.29

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.8.29

21.8.24

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.8.24

21.8.9

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.8.9

21.8.4

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.8.4

21.8.1

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.8.1

21.7.278

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.7.278

21.7.27

GitHub上看到这个版本发布说明:https://github.com/jamesjcai/scGEAToolbox/releases/tag/v21.7.27

21.7.26

新医生

21.7.14

新标题

21.7.13

显示在安装插件时添加的文件夹

21.1.16

sc_scatter

21.1.15

SC_SCATTER (X, genelist)

21.1.14

试试新功能:SC_SCATTER.m
阅读文档URL:https://scgeatoolbox.readthedocs.io/

20.8.2

添加sc_celltypeexplorer_auto

20.7.5

细胞标记基因识别功能补充道。

1.0.0

问题在这个视图或报告GitHub插件,参观GitHub库
问题在这个视图或报告GitHub插件,参观GitHub库