医疗软件处理多参数图像管道
有关更多资料，请参阅我们的刊物(https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fninf.2020.594799/full):
MP3:医疗软件处理多参数图像管道。
布罗萨德;神经信息学前沿，2020,14,53。
演示和教程可以在这里找到!
https://www.youtube.com/playlist?list=PL-Tj6Wc9aE9x7i6s-RLetvNE0isnEsFm7
MP³是一款开源软件，旨在支持临床前和临床研究人员进行图像处理研究。金宝app这个Matlab工具箱提供了一个图形界面，可以帮助处理医学图像。以下是MP³中包含的最重要的工具:
导入医学图像(如DICOM、NIFTI、Bruker等)，并转换为NIFTI /json格式
可视化图像(2D到5D数据)
过程(例如，注册，模型拟合，过滤器，…)
分析(如roi，散点图，…)医学图像。
可以调用来自SPM或FSL的标准流程，也可以调用自定义函数。复杂的后处理管道可以创建并应用于多参数(例如MRI T1w + MRI T2w，…)、多维(例如空间+时间+回声，…)或多模态(例如MRI +CT，…)数据。一旦在单个患者中定义了这些过程，就可以使用并行架构存储并应用到更大的数据库中。MP³最初由格勒诺布尔神经科学研究所(法国)创建，用于在+500只动物的队列中处理多参数MRI协议(解剖+松弛测量+灌注)。
海报(英语)(法语):在SFRMBM第四届大会(斯特拉斯堡)上发布的海报。
需求
为了充分享受MP³，您必须满足以下要求:
Matlab 2017b或更高版本
工具箱(必选:图像处理工具箱——推荐:统计和机器学习工具箱;并行计算工具箱)
Java 8或以上
数据以Bruker / DICOM / Philips / Nifti格式处理
该项目由格勒诺布尔神经科学研究所的神经成像和脑灌注团队开发
本项目的主要贡献者是:Clément Brossard和Benjamin Lemasson
关键词:动物，蚂蚁，asl，脑提取，bruker, cbv，临床，聚类，计算断层扫描，转换，ct，数据库，dicom, fit, fsl，人，图像分析，图像处理，图像配准，掩模，小鼠，mri，多参数，parrec，灌注，流水线，临床前，放射组学，放射组学，大鼠，so2, spm, t1, T2*， vsi
引用作为
本杰明·勒马森(2022)。MP3医学影像工具箱(MRI, CT, PET…)GitHub (https://github.com/nifm-gin/MP3/releases/tag/v1.4)。检索。
布罗萨德，C.，蒙提贡，O.，布克斯，F.，德尔芬，A.，克里斯坦，T.，巴比尔，E. L.，和勒马森，B.(2020)。MP3:医疗软件处理多参数图像管道。神经信息学前沿，14,53。
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