请始终查看nifti_tools.pdf进行详细说明和最新更新。
如果您在分析图像的左/右侧混淆,请阅读useAnalyze.pdf。
您可能还想通过FAQ.PDF进行实际解决方案和实际示例。金宝搏官方网站
基本计划:
1. load_untouch_header_only.m:仅加载NIFTI或Analyze文件的标题部分。将自动检测到输入文件。NIFI结构将返回NIFI文件,并将返回分析结构进行分析文件。
2.负载_nii.m: Load N-Dimensional NIfTI file (where N can be from 3 to 7) or ANALYZE file (where N can be from 3 to 4), and apply header info (e.g. affine geometric transform, voxel intensity scaling, etc.) to the data. If your file has more than 3-Dimension (e.g. time series etc.), you can also specify a range to extract only 1 or several volumes.
3. save_nii.m:保存n维nifti结构(其中n可为3到7),由“load_nii.m”或由“make_nii.m”进行到nifti文件中。
4. make_nii.m:基于n维矩阵和其他可选参数(例如voxel_size,原点等)制作n维NIFI结构(其中n可以为3到7)。使用“save_nii”命令,“make_nii”制作的nifti结构可以保存到nifti文件中。
5.make_ana。m:基于3D矩阵和其他可选参数(如voxel_size, origin等)制作3D ANALYZE结构。使用“save_untouch_nii”命令,可以将由“make_ana”生成的ANALYZE结构保存到ANALYZE文件中,以便与某些ANALYZE only程序兼容。
6. Reslice_nii.m:重新示例3D(或4d)nifti文件,或分析带有仿射矩阵m的文件.mat文件,并将重新采样的数据保存到新的nifti文件中。该程序将基于仿射矩阵,这对于具有不能加载的非正交旋转或剪切的倾斜图像特别有用,这些旋转或不能加载“Load_NII.m”。您还可以指定Voxel_Size等。它不会引起负面影响,只要您记得在使用“Reslice_nii.m”后不做切片时间校正。
7.pad_nii。m:在NIfTI结构中从六个方面中的任何一个填充体积,同时保持发起者、体素大小、数据类型和描述不变。在您使用reslice_nii之后,这个程序特别有用,因为新卷很可能有不同的维数。
8.剪辑_NII.M:将NIFI结构中的卷从六个边中的任何一个剪切,同时保持发起者,体素大小,数据类型和描述不变。在您使用reslice_nii之后,这个程序特别有用,因为新卷很可能有不同的维数。
9.view_nii。m:查看和编辑3D(或4D) NIfTI或分析结构,由“load_nii. m”加载。或由make_nii.m制作。激活图、ROI等可以叠加在背景图像上(见上图)。绘制的视图可以嵌入到现有的图形窗口中。如果您将其作为一个单独的程序使用,它还可以编辑图像的方向和体素值,查看体积直方图,并保存修改后的图像。
10.load_untouch_nii。m:加载N维NIfTI文件(N可以从3到7)或ANALYZE文件(N可以从3到4),但不应用头部指示的任何更改。警告:不要使用"view_nii. "以查看由load_untouch_nii.m加载的结构。
11. save_untouch_nii.m:保存n维NIFI结构(其中N可以为3到7)或分析结构(其中n可以为3到4),由“load_untouch_nii.m”或由“make_ana制作。m“进入新的nifti或分析文件。如果不修改加载的数据集,则新保存文件中的标题和数据应与原始文件中的标头和数据相同。
其他项目:
1.collapse_nii_scan。m:将多个单扫描NIfTI或ANALYZE文件集成到一个多扫描NIfTI文件中。
2. expand_nii_scan.m:将多扫描NIFTI文件中断到多个单扫描NIFTI文件中。
3. save_untouch_slice.m:保存回原始图像,其中包含由load_untouch_nii加载的一部分切片。只要没有更改它们的维度,您可以以任何方式处理这些切片矩阵。
4. get_nii_frame.m:返回nifti文件的时间帧数。
5.flip_lr。m:沿平面左右翻转NIfTI或ANALYZE文件,并将L-R翻转数据保存到NIfTI文件中。警告:请谨慎使用此程序,尽管您总是可以翻转它。
6.load_nii_ext。m:从NIfTI文件加载头扩展名。
7.mat_into_hdr。m:将旧SPM .mat文件中的仿射矩阵集成到它的。hdr头文件中。因此,ANALYZE文件被转换为带有更新后的.hdr头文件的NIfTI文件。
引用
吉米沉(2021)。nifti和分析图像的工具(//www.tatmou.com/matlabcentral/fileexchange/8797-tools-for-nifti-ananalyze-image),Matlab中央文件交换。检索到.
Matlab释放兼容性
平台的兼容性
窗户 麦克斯 Linux标签
致谢
启发:MRI分析工具
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