对准和漂移校正

对齐和漂移校正工具可以用于对齐打开的数据集的切片或对齐两个独立的数据集。这是校准和漂移校正工具的新版本，与MIB版本1.23一起发布。

以下视频提供了演示:
https://youtu.be/-qwoO5z02aA

回指数-->用户指南-->菜单-->数据集

内容

当前数据集面板

的当前数据集面板显示当前打开的数据集的详细信息，如文件名、尺寸和像素大小

对齐面板

的对齐面板允许选择校准和漂移校正的主要参数。

• 模式面板-选择对齐模式:
  • 当前数据集，对齐打开的数据集
  • 两个堆栈，对齐两个堆栈。第二个堆栈可以从Matlab加载或导入
• 算法-选择对齐方法:

  漂移修正	漂移校正模式推荐用于小偏移或相对大小的图像 大多数情况下都推荐使用
  模板匹配	当两个栈对齐且第二个栈比主栈小时，模板匹配模式是最好的。 它是不推荐用于对齐当前打开的堆栈
  单一里程碑点	单地标点模式是手动模式，用户使用笔刷工具在两个后续切片上标记相应的区域。在对齐过程中，图像将被翻译以对齐标记区域
  三个里程碑点	三个路标点模式是另一种手动模式，用户应该使用画笔工具在两个相应的切片上标记三个相应的区域。在对齐过程中，图像将被翻译/缩放/旋转以对齐标记区域

• 与-参考幻灯片有三个不同的选项:
  • 前片，将每个切片与前一个对齐
  • 第一片，将所有图像对齐到序列的第一个z切片;当数据集变化不大时，它可以很好地解决漂移校正问题
  • 相对于，将每个片与另一个片对齐，在序列的前面，在一步“编辑”框定义此移位
• 颜色通道-选择用于对齐过程的颜色通道
• 使用强度梯度有时，当原始图像的强度梯度相关时，可以获得更好的对齐效果。选择此复选框使用渐变而不是原始图像。
• 背景定义图像对齐后的背景类型
  • 白色，对齐的数据集的所有背景像素将为白色
  • 黑色的，对齐的数据集的所有背景像素将为黑色
  • 的意思是时，对齐数据集的所有背景像素将被计算为原始数据集所有像素的平均值
  • 自定义，为背景颜色提供自定义强度

选项面板

“选项”面板仅在对齐当前打开的数据集时显示。

• 使用掩码/选择勾选此选项可强制对齐工具仅从数据集的蒙版或选定区域计算相关性。使用画笔工具在第一个和最后一个切片上选择最清晰的区域;然后使用i键快捷键将一个区域插入到另一个区域(或从菜单- >选择- >插入形状）
• 使用好子窗口对于大的统一图像，使用子窗口可以显著加快对齐速度。使用minX, minY, maxX, maxY编辑框或从选择按钮来定义子窗口。
• 保存/加载切换到文件使用此选项，可以保存和加载转换转换到磁盘

第二个栈板

选项面板仅在两个堆栈对齐时显示

• 目录的图片选择第二个堆栈映像所在的目录
• 卷在一个单一的文件，当第二个堆栈嵌入到单个文件中时使用此选项
• 从Matlab进口，如果另一个堆栈已经在Matlab中打开，它可以导入并与当前打开的对齐。
• 自动模式，当选择时，对齐将自动完成。或者，也可以手动将参数提供到ShiftX和机智的编辑框。

参考和确认

对齐算法是基于

< http://onlinedigeditions.com/publication/?i=223321&p=40>

回指数-->用户指南-->菜单-->数据集

发布与MATLAB®R2016a