请经常检查NIfTI_tools。pdf格式的细节描述和最新更新。

如果你感到困惑的左/右分析图像,请阅读UseANALYZE.pdf。

你也可以通过FAQ。pdf的实际解决方案和实际例子。金宝搏官方网站

基本程序:

1。load_untouch_header_only。m:负载的头部分NIfTI或分析文件。输入文件将自动检测到。NIfTI结构将返回NIfTI文件,并分析结构为分析文件将被返回。

2。load_nii。m: N维NIfTI加载文件(其中N可以从3 - 7)或分析文件(其中N可以从3 - 4),并应用头信息(如仿射几何变换,立体像素强度比例,等等)的数据。如果你的文件有超过三(例如时间序列等),您还可以指定一个范围来提取只有1个或多个卷。

3所示。save_nii。m: N维NIfTI保存结构(其中N可以从3 - 7),由“load_nii加载。m”或由“make_nii。m”到一个NIfTI文件中。

4所示。make_nii。m: N维NIfTI结构(其中N可以从3 - 7)基于N维矩阵和其他可选参数(例如voxel_size、起源、等等)。使用“save_nii”命令,NIfTI结构是由“make_nii”可以保存到一个NIfTI文件。

5。make_ana。m:让3 d分析结构基于3 d矩阵和其他可选参数(例如voxel_size、起源、等等)。使用“save_untouch_nii”命令,分析结构,是由“make_ana”可以保存到一个分析文件只为了兼容一些分析程序。

6。reslice_nii。m: Re-sample 3 d(或4 d) NIfTI文件,或分析文件与仿射矩阵m .mat文件,并保存re-sampled数据到一个新的NIfTI文件中。程序将基于仿射矩阵,这是特别适合斜图像与非正交旋转或剪切,不能含有“load_nii.m”。您还可以指定voxel_size等等。它不会造成负面影响,只要你记住不要使用“reslice_nii.m”后片时间校正。

7所示。pad_nii。m:垫NIfTI结构的体积(s)的六个方面,同时保持发起人,体素的大小,数据类型,和描述不变。程序在您使用reslice_nii尤其有用,因为新的体积将最有可能有不同的维度。

8。clip_nii。m:夹卷(s)在NIfTI结构从任何的六个方面,同时保持发起人,体素的大小,数据类型,和描述不变。程序在您使用reslice_nii尤其有用,因为新的体积将最有可能有不同的维度。

9。view_nii。m:查看和编辑3 d(或4 d) NIfTI或分析结构,由“load_nii加载。m”或由“make_nii.m”。激活地图、ROI等可以覆盖的背景图像(见图)以上。绘制视图可以嵌入到现有的图窗口。如果你使用它作为一个个体程序,它还可以编辑图像的方向和体素值,查看体积直方图,并保存已修改的图像。

10。load_untouch_nii。m: N维NIfTI加载文件(其中N可以从3 - 7)或分析文件(其中N可以从3 - 4),但不适用任何更改标题中注明。警告:不要使用“view_nii。m”查看加载的结构“load_untouch_nii.m”。

11。save_untouch_nii。m: N维NIfTI保存结构(其中N可以从3 - 7)或分析结构(其中N可以从3 - 4),由“load_untouch_nii加载。m”或由“make_ana。m”到一个新的NIfTI或分析文件。如果你不修改加载数据集,新的保存文件的标题和数据应该是相同的原始文件。

其他项目:

1。collapse_nii_scan。m:集成多个single-scan NIfTI或分析文件成一个多扫描NIfTI文件。

2。expand_nii_scan。m:打破多扫描NIfTI文件分成多个single-scan NIfTI文件。

3所示。save_untouch_slice。m:救回原始图像与片的一部分被load_untouch_nii加载。你可以处理这些切片矩阵以任何方式,只要他们的尺寸不改变。

4所示。get_nii_frame。m:返回时间框架NIfTI文件的数量。

5。flip_lr。m:翻转NIfTI或分析文件左右沿平面在发起人,并保存唐森翻到一个NIfTI文件数据。警告:请使用这个程序时要格外小心,虽然你总是可以翻转回来。

6。load_nii_ext。m:从NIfTI文件加载头扩展。

7所示。mat_into_hdr。m:仿射矩阵在旧SPM .mat文件集成到其.hdr头文件。因此,分析文件转换为NIfTI .hdr头文件的文件更新。