seqwordcount
出现次数计数的词序列
语法
seqwordcount (Seq,词)
参数
Seq |
特征向量或字符串包含一个核苷酸或氨基酸序列。你还可以输入一个结构 |
词 |
输入一个简短的字符序列。 |
描述
seqwordcount (计算的次数,一个单词出现在一个序列,然后返回单词出现的次数。Seq,词)
如果词包含核苷酸或氨基酸符号代表多个可能的符号(模糊字符),seqwordcount所有匹配。例如,象征R代表要么G或一个(嘌呤)。另一个例子,如果词=“艺术”,然后seqwordcount数出现的AAT的和“AGT”。
例子
seqwordcount多次不计算重叠模式。在接下来的例子中,seqwordcount三场报告。TATATATA是算作两个截然不同的匹配,而不是三个重叠的现象。
seqwordcount (“GCTATAACGTATATATAT”,“塔塔”ans) = 3
下面的示例报告两场比赛(“TAGT”和“TAAT”)。B模棱两可的代码吗G,T,或C,而R是一个模糊的代码吗G和一个。
seqwordcount (“GCTAGTAACGTATATATAAT”,“巴特”ans) = 2
