MATLAB的答案

simbiology竞争和抑制

2视图(30天)
迈克尔
迈克尔 2013年11月15日
回答: 英格丽tigg 2013年11月19日
我探索simbiology是否适合应用程序:探索桌面和直接编码:快指针赞赏!
在桌面环境中1)有无论如何表达竞争绑定或通路抑制过程?我没有发现这个图形界面吗?大概这意味着编码模式直接在matlab ?2)如何桌面生成的代码回港matlab对所有配置组件?(它必须做屏幕的屏幕?)3)如何设置参数(k)约束?(限制范围)或选择特定的参数不同模式:这是可能的在桌面吗?4)如何构建块模型合并到集成模型最有效?在桌面功能?
迈克

在回答这个问题。

答案(2)

英格丽tigg
英格丽tigg 2013年11月18日
你好,这里是我快速回复你的问题:
1)创建的反应,而不是你通常那样SimBiology桌面然后输入反应,选择动能定律“未知”,进入“ReactionRate”的动力学。用这种方法,你可以使用任何你可以想象的反应速率。
2)点击小,导航栏旁边的向下的三角形,并选择“模型导出到工作空间”
3)你能更具体吗?你想限制范围的参数可以吗?如果是的,请看看这个链接 指定的上限和下限的物种
4)我很抱歉,但我不明白你的问题。你能解释详细一点吗?
我希望这可以帮助。
1评论
迈克尔
迈克尔 2013年11月18日
英格丽德,
谢谢你的快速回答我的第一个两个问题。很有帮助。
澄清:3)我的问题相关速率常数的范围限制在一些生理的或防止特定的常量不同优化阶段(为了防止——的灵活性可能over-prametised模型)。即我们可能解决组件的模型/室一组实验数据,然后需要一套独立的方程的模型适合元素/室。限制物种浓度当然也可能有用是有用的:因此,这也是很有用的)
4)这与建筑模型基于实验数据分别之前将单独的模型集成到一个更大的模型。有可能一些模型导入到图形界面和连接(即添加舱或模型)?在代码中我可以看到这是如何做到的,但也许可以在一定程度上也在图形界面吗?
与感谢
迈克

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英格丽tigg
英格丽tigg 2013年11月19日
你可以找到一个解释应该如何适应参数在一定范围内: 指定在SimBiology参数拟合的参数
关于第四个问题可以复制并粘贴在SimBiology元素从一个模式到另一个桌面。从命令行,也有有限的支持复制使用一个名为copyobj的方法。金宝app

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