主要内容

DimensionalAnalysis

对模型进行尺寸分析

描述

DimensionalAnalysis属性指定是否在模拟之前对模型执行尺寸分析。这是一个属性编译对象。编译持有模型的编译时间选项,是object属性configset对象。什么时候DimensionalAnalysis被设置为真正的,偶像生物学®软件检查是否涉及反应和规则的单位的物理量,匹配和适用。

例如,考虑反应a + b - > c.使用质量动作动力学,反应速率定义为a * b * k, 在哪里K.是反应的速率常数。如果你指定初始数量一种B.分别为0.01M和0.005M,则K.1 /(m *秒).如果您指定K.另一个等价的单位定义,例如,1 / [(moles /升)*第二]DimensionalAnalysis检查物理数量是否匹配。如果物理量不匹配,就会看到一个错误,模型就不会被模拟。

单元转换需要尺寸分析。如果DimensionalAnalysis关闭了,你转过身来UnitConversion.然后DimensionalAnalysis自动打开。如果UnitConversion.打开,你关掉了DimensionalAnalysis, 然后UnitConversion.自动关闭。

如果你有matlab®函数调用在模型中,尺寸分析忽略了包含函数调用的任何表达式并生成警告。

反应速率的有效物理量是量/时间,质量/时间或浓度/时间。

特征

适用于 目的:编译(在configset对象)
数据类型 布尔
数据值

真正的错误的.默认值为真正的

使用权 读/写

笔记

SimBiology允许将任何无量纲数量的指数指向任何无量纲功率。例如,如果两者都可以编写以下表达式X一种无维:(x + 3)^(a + 0.5)

笔记

SimBiology使用包括空单位的单位与DimensionalAnalysisUnitConversion.特征。

  • 什么时候DimensionalAnalysisUnitConversion.都是错误的,不使用单位。然而,SimBiology仍然执行最低尺寸分析水平,以确定反应速率是否处于量/时间或浓度/时间的尺寸。

  • 什么时候DimensionalAnalysis真正的UnitConversion.错误的,单位(如果不是空)必须具有一致的维度,以便素质可以执行尺寸分析。但是,单位未转换。

  • 什么时候UnitConversion.被设置为真正的(这需要DimensionalAnalysis成为真正的),SimBiology执行尺寸分析并将所有内容转换为一致的单位。因此,您必须指定一致的单位,并且没有单位可以为空。如果您有维度参数,则必须将其单元设置为无尺寸

提示

如果您有自定义函数和UnitConversion.正在开启,遵循以下建议书。

  • 如果它们尚未维度,则不维度传递给函数的参数。

    假设您有一个定义的自定义函数y = f (t)在哪里T.是一个小时和时间y是一种物质的浓度,单位是摩尔/升。例如,当你在模型中使用这个函数来定义一个重复赋值规则时,将它定义为:s1 = f(time / t0)* s0, 在哪里时间为模拟时间,T0.是一个定义为1.0小时的参数,S0.是一个参数定义为1.0摩尔/升,S1是一种物质的浓度,单位是摩尔/升。请注意,时间S1不必与同一单位一样T0.S0.,但它们必须在维度上保持一致。例如,时间S1单位可分别设置为分钟和皮摩尔/升。

例子

此示例显示了如何检索和设置DimensionalAnalysis从默认真正的错误的在模型对象中设置的默认配置中。

  1. 导入模型。

    modelobj = sbmlimport('振荡器'的)

    SIMBIOGY MODEM  - 振荡器型号组件:型号:0参数:0反应:42规则:0种:23
  2. 检索configset模型对象的对象。

    configsetobj = getconfigset(modelobj)配置设置 - 默认(活动)solvertype:ode15s solvertions:10.000000 Solveroptions:absoluteTeLerance:1.000000E-006 RelativeTolerance:1.000000E-003 RuntimeOptions:Statestolog:全部编译:UnitConversion:True
  3. 检索编译对象。

    optionsObj =得到(configsetObj,'compileOptions')编译设置:UnitConversion:True VileIonsis分析:True
  4. 分配一个值错误的DimensionalAnalysis

    set(Optionsobj,'多方面分析', 错误的)

也可以看看

得到getconfiget.sbiosimulate