图像缩略图

Bacstalk

细菌细胞生物学的全面互动图像分析软件工具

Updated14 Oct 2020

BACSTALK是一种互动且用户友好的图像分析软件工具,可研究普通用过的细菌物种的细胞生物学(例如大肠杆菌,枯草芽孢杆菌,枯草芽孢杆菌,铜绿假单胞菌等)和茎形形成细菌(例如,Caulobacter Crescentus,brevmonas nepthomonasnastunimonas,Hypthomonas neptunimonos,Hypthomonasnimonononas,Aveniformis等)。BACSTALK使用相比对比度,明亮场和/或荧光图像来分割细菌并产生人口统计,基因图,直方图,散点图。对于茎细菌,BACSTALK还可以鉴定出几乎可见的细菌茎,以观察茎的形成动力学和芽细胞的生长。荧光图像可用于测量沿细胞和茎的蛋白质表达模式。

BACSTALK使用非常直观和现代的图形用户界面,并提供了文件处理,元数据提取,细胞/茎/芽分段,单元格跟踪,数据分析和可视化所需的所有工具。Bacstalk仅单击几下生成出版级数字。尽管BACSTALK基于MATLAB-SOFTWARE,但它不需要任何编程知识即可使用。

引用为

Hartmann,Raimo等。“ BACSTALK:一种用于细菌细胞生物学的综合且交互式图像分析软件工具。”分子微生物学,第1卷。114,不。1,威利,2020年4月,第140-50页,doi:10.1111/mmi.145​​01。

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