SimBiology模型分析器

分析QSP, PK/PD和机械系统生物学模型

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描述

的SimBiology模型分析器app可以让你分析动态系统的模型，如代谢网络，信号通路，定量系统药理学(QSP)模型，和药物的药代动力学/药效学(PK/PD)模型。它提供了几种方法来分析模型和各种图形来可视化结果。

使用该应用程序，您可以:

模拟模型以查看其随时间变化的动态行为。
通过模拟虚拟病人等替代场景来探索生物变异性。
使用非线性回归和非线性混合效应方法估计模型参数。
进行参数扫描和灵敏度分析，研究模型参数和初始条件对模型行为的影响。
指定单位，并让应用程序自动将匹配的物理量转换为一致的单位系统。
探索各种给药方案。
执行非区室分析(NCA)从药代动力学数据计算药代动力学参数。
查看各小区的分析结果。

可用的情节

该应用程序允许您使用各种图表可视化分析结果，包括:

模型量的时间过程
灵敏度矩阵
在实验数据上叠加估计结果
用于测量拟合质量的图，如置信区间图、残差图、残差分布图、实际与预测图以及箱形图
散点图矩阵
百分位图

打开SimBiology Model Analyzer App

MATLAB^®工具条:在应用程序选项卡,在计算生物学，点击应用程序图标。
MATLAB命令提示符:输入simBiologyModelAnalyzer．

例子

编程使用

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`simBiologyModelAnalyzer`

simBiologyModelAnalyzer打开SimBiology模型分析器应用程序。

`simBiologyModelAnalyzer (m1）`

simBiologyModelAnalyzer (m1）打开SimBiology模型m1在SimBiology模型分析器如果你也有SimBiology模型构建器应用程序同时打开，两个应用程序共享相同的模式。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析器App已经打开，不能从命令行加载模型或项目。直接从应用程序加载模型。

`simBiologyModelAnalyzer (prjFile）`

simBiologyModelAnalyzer (prjFile）打开项目文件prjFile在SimBiology模型分析器应用程序。文件是一个字符串或字符向量，指定SimBiology项目SBPROJ文件的文件名或路径和文件名。如果仅指定文件名，则该文件必须位于MATLAB搜索路径或当前文件夹中。如果你也有SimBiology模型构建器应用程序同时打开，两个应用程序共享同一个项目。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析器App已经打开，不能从命令行加载模型或项目。直接从应用程序加载模型。