生物信息学的工具箱
里拉,分析仪等Visualiser的DES最近搜索génomiques等protéomiques
生物信息学工具箱™提出了新一代测序(NGS)的算法和应用,生物分析,masse光谱和本体遗传学。对于工具箱的样式,你们可以用基因表达综合和基因库来描述基因组和蛋白质,包括SAM, FASTA, CEL和CDF的标准格式,以及基因表达综合和基因库®。你们可以用序列导航图,空间坐标图和簇图来观察。工具箱建议对图片检测的统计技术平等,对人的数量和对动物的选择的价值平等。
你们可以把支持者的生物信息学过程的工具箱的方法结合起来。金宝app你们可以使用des数据ChIP-Seq倒标识符莱斯德转录的影响,分析des数据de d 'ARN倒序列标识符des基因exprimes方式differentielle,标识符des变体de滑道et des SNP在des数据副本de biopuces et des的资料分类器proteiques从数据de spectrometrie de。
用savoir加上labiologie computationnelle。
En savoir plus:
生物信息学工具箱为分析新一代测序提出了算法和可视化技术。在工具箱里你们可以在完整的情况下对基因组进行分析,所有的结果都是通过基数的分辨率计算的。你们可以用导航仪进行视觉化并对课程进行排列从课程到个人的分类。你们可以在分析人员的常规上提供平等的方法,就像例子中的例子一样。
可视化和分析演讲库的排列
AVEC乐navigateur NGS,VOUS pouvez验证等分析器L'alignement DES序列的演讲courte,解sorteàétayerLES分析魁拉mesurent变异génétique和l'表达génétique。乐navigateur NGS VOUS柏美D'effectuer莱操作suivantes:
- 在演讲过程中使用的可视化工具有一个参照的核苷酸序列
- 比较组jeux de donnees按参考序列排列
- 观察不同碱基和参考序列的区域
- 质量等方面的分析人员详细介绍了讲课内容
- 不一致的标识符导致对多态性碱基的错误选择
- 显示插入和抑制
- 对这些特征的注释与参考序列的一个特定区域有关
讲座顺序的储存和消化
在分析新一代的顺序时,用的是在记忆体格上的常规的大量的材料。生物信息学工具箱有四种不同类型的竞争者,它们可以让你在完整的水平上渗透基因组分析。
L 'objetBioIndexedFile
你们可以读到文件内容以及文件内容以及不穿制服的主菜以及顺序,注释和引用,这些都是属于你自己的。您可以将这些成果归纳为一个应用程序的图表、非层次结构或格式(SAM、FASTA、FASTQ等)。
洛杉矶的架势BioMap
说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息,说明一节课的序列信息。你们可以使用方法和固有的方法在生物制图中使用方法和固有的方法在生物制图中使用方法。
正常化de biopuces
VOUS pouvez utiliserdifférentesméthodes倾规范器DES最近搜索德biopuces,COMME LA回归区域设置,LA moyenne兴业,L'écartABSOLU MEDIAN(MAD)等LA正常化位数。VOUS pouvez appliquer CESméthodesA L'合奏德拉biopuce,OU中的沙漠地区瓯德集团spécifiques。莱斯fonctions德filtrage等D'归集VOUS permettent德nettoyer德最近搜索畜生前卫科特迪瓦执行器LES程序D'分析和de可视化。
分析和可视化
生物信息学工具箱中,你们已经完成了运货计划和价格计算,基因表达(序列组合),从序列序列到序列序列®在此基础上,提出了鲁棒多阵列平均(RMA)和GC鲁棒多阵列平均(GCRMA)方法。你们可以应用一个分割的双循环在这个过程中以及对多个假设的错误的估计来检验一个生命经验的表达基因。你们可以对不同的不变量平均地进行标准化,根据对不同矩阵的描述的强度,根据对不同实验条件的表达基因的值。
这些例程专门用于可视化描述生命的轨迹,包括生命的轨迹,生命的轨迹,生命的轨迹,生命的轨迹和生命的空间轨迹。你们可以把G波段的表示法和模型都可视化。
用例程统计和机器学习工具箱™,VOUS pouvez分类VOSrésultats,effectuer未partitionnement k均值OUhiérarchique等申述VOS最近搜索德biopuces丹斯DES可视化statistiques,特列斯阙DES clustergrams 2D AVEC未ordonnancement最佳DES弗耶,DES CARTES thermiques,脱痕迹DES composants principaux和desArbres的德分类。
“生物信息学工具箱”提出了一个数据集,用于对数据进行光谱分析。主要内容包括:产品的描述、分类和产品的识别,包括产品的质量、质量、液相色谱和气相色谱。规格包括校正、拉力、校准和参考标准。你们可以用M/Z和LC/MS和GC/MS来进行保持温度的校准。你们可以同时看到许多示踪者。
你们可以更清晰,校准和标准化幽灵,我们可以使用分类和统计学徒为分类者和生物标记潜力提供标识。
理论和图形可视化
生物信息学工具箱您已经验证了矩阵creuses图形理论的应用。你们可以用图形来表示这些相互作用,这些轨迹,层次结构和化学。你们可以标识并在图中显示化学性质,在图的方向中测试循环并确定两个图之间的同构。
学徒和可视化统计
生物信息工具箱offre DES fonctions魁reposent河畔莱algorithmes去分类等D'apprentissage statistique丹斯统计和机器学习工具箱,尤其是:
- 机器支持向量机(SVM)和分类器(K + proche金宝apps voisin)
- 德fonctions倒mettre EN PLACE DES经验去验证croisée等倒évaluer莱表演DESdifférentesméthodes去分类
- 与选择的相互作用,与绘图和绘制的痕迹,层次和化学的相互作用
本体论génétique
生物信息学工具箱你们已经通过MATLAB了解了基因本体的基础®,分析者和笔记的本体论基因和六系的本体论,即祖先,后代或父母。
Alignement德序列
工具箱中提出了序列分析的方法,结论和方法,没有按常规排列序列,序列的轮廓和序列的倍数。这些特性包括:
- 实现局部序列和全局序列对齐的MATLAB算法标准,包括Needleman-Wunsch算法,Smith-Waterman算法和马尔可夫缓存模型算法。
- 序列的对齐是级数的倍数
- 排列结果矩阵的表示
- 矩阵的符号标准,告诉我们矩阵的最常见的形式
- 乐演算德拉序列的共识和l'affichage杜标志德拉序列
UTILITAIRES等statistiques德序列
在工具箱里你们可以看到操作器和分析器在我的理解下的序列。你们可以:
- 利用编码遗传将胺类序列和胺类序列进行转换
- 对这些序列进行统计分析,并研究一个序列中的特殊模型
- 应用限制酶和蛋白酶在硅化物序列中实现消化,或在试验中实现鱼序列的消化
- 计算arn序列的最小能量结构
可视化de序列
香格里拉工具箱VOUS柏美日德Visualiser的序列和des alignements。VOUS pouvez Visualiser的DES CARTESlinéaires欧circulaires德序列annotéesAVEC DESfonctionnalités基因库。VOUS pouvez Visualiser的DES diagrammes德拉结构secondaire D'UNE序列D'ARN。莱斯afficheurs interactifs VOUS permettent德parcourir等去修改德alignements德序列倍数等齐名paires。
分析d 'arbres phylogenetiques
香格里拉工具箱VOUS柏美日créer等去修改德Arbres的phylogénétiques。VOUS pouvez calculer DES距离比肩paires恩特雷里奥斯DES序列德核苷酸欧D'的酸酐胺,qu'elles soientalignées欧非,EN utilisant diverses mesures德similaritéCOMME莱méthodes德朱克斯 - 坎特,德拉对距离,杜得分d”alignement OU UNE METHODE德距离définie相提并论L'utilisateur。莱斯Arbres的phylogénétiquesSONT construits连接utilisant UNE联络hiérarchiqueAVEC UNE综艺德技术,Y compris莱méthodes杜邻居加入,去联络简单等去联络完成,等UPGMA(非加权对组平均法)。
工具箱可以让人思考,让人思考,因为我在计算苏-阿尔和阿尔卡尼亚。系统遗传学的关系你们已经看过了排序,重组和重新排列分支,距离的分配,当你用新的格式写的时候。你们可以在MATLAB中平均地使用这些注释来证明质量的概念。
分析变形
香格里拉工具箱offre DES技术分析德德序列protéiques,notamment DES套路倒乐德演算科特迪瓦propriétésUNE序列peptidique,特列斯阙拉组成atomique,乐点isoélectrique等文件POIDSmoléculaire。VOUS pouvez确定器LA组合物连接的酸酐胺DES序列protéiques,scinder UNEprotéineAVEC UNE酶等créerDES痕迹德squelette和de的Ramachandran德最近搜索PDB。VOUS pouvez utiliser乐序列工具倒Visualiser的莱propriétésD'UNE序列D'的酸酐胺欧utiliser勒分子查看器倒afficher等manipuler DES结构moléculaires恩3D。
格式和基础的加入
VOUS pouvezaccéderAUX格式德fichiers标准倒莱斯最近搜索biologiques,莱基地去最近搜索连接LIGNE等莱网站网页。生物信息工具箱VOUS柏美D'effectuer莱操作suivantes:
- 对序列格式、格式标准、格式FASTA、PDB和SCF的定义
- 从组织切片到DAT, EXP, CEL, CHP和CDF的格式;这是图象结果的形式®;这些都是安捷伦的作品®特征提取;以及GPR和GAL GenePix®
- 这是在基因库,EMBL, NCBI BLAST和PDB的基础上的一部分
- 这是一个基因表达综合网站
- 细胞遗传学方面的信息是由UCSC的成员的概念构成的
- 这是由MZXML和jcampbell - dx组成的集合谱
划分算法和应用程序的部署
MATLAB为您提供了在个人应用程序中分析donnees的程序转换。对于界面的创建,可视化集成的开发环境和简介,您不能接受开发的许可。在应用程序C, c++和Java™中使用MATLAB,在应用程序自主开发中使用算法开发和接口,在MATLAB中使用Microsoft®.NET OU COM accessibles depuis n'importe广利应用COM,AINSI阙德créer德补充Microsoft Excel中®。
您可以将MATLAB集成到生物信息学中,使用生物信息学,基于SOAP和插件的服务网络。
基因组学查看器
Visualisez DES最近搜索NGS AVEC UNE版本intégréeDE L'综合基因组浏览器(IGV)
袖扣
根据arn序列的donnees分析统计数据和差异的效果
Consultez LES指出de版本倒恩飘出加河畔CESfonctionnalités和les fonctions correspondantes。