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生物信息学的工具箱

阅读、分析和可视化基因组和蛋白质组学数据

生物信息学工具箱™为下一代测序(NGS)、微阵列分析、质谱分析和基因本体提供算法和应用程序。使用工具箱功能,您可以从标准文件格式(如SAM, FASTA, CEL和CDF)以及在线数据库(如NCBI基因表达Omnibus和GenBank)中读取基因组和蛋白质组学数据®.您可以使用序列浏览器、空间热图和群集图来探索和可视化这些数据。工具箱还提供了用于检测峰值、为缺失数据输入值和选择特征的统计技术。

您可以组合工具箱功能来支持常见的生物信息学工作流程。金宝app你可以使用ChIP-Seq数据来识别转录因子;分析RNA-Seq数据以识别差异表达基因;识别微阵列数据中的拷贝数变体和snp;并利用质谱数据对蛋白质进行分类。

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学习生物信息学工具箱的基本知识

高通量测序

下一代测序(NGS)数据的基因表达、转录因子和甲基化分析,包括RNA-Seq和ChIP-Seq

微阵列分析

微阵列数据的基因表达及遗传变异分析

序列分析

基因组和蛋白质组序列,比对和系统发育

结构分析

可视化和操作蛋白质和其他生物分子的三维结构;RNA二级结构预测与可视化

质谱和生物分析

来自分离技术的数据,产生带有峰的痕迹,包括MS, LC/MS, NMR,色谱和电泳

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