主要内容

扫描参数范围

探索数值范围内的模拟结果

功能

sbiosimulate 模拟SimBiology模型
sbioaccelerate 为加速模拟准备模型对象
sbiosampleparameters 通过抽样协变量模型生成参数(需要统计和机器学习工具箱软件)
sbiosampleerror 基于误差模型的采样误差,并在仿真数据中加入噪声
addconfigset 创建配置集对象并添加到模型对象
addobservable 添加可观察对象到SimBiology模型
getconfigset 从模型对象中获取配置集对象
createSimFunction 创建SimFunction对象
sbioplot 图模拟结果为一图
sbiosubplot Plot模拟结果在subplot中
sbiotrellis 在格子图中绘制数据或模拟结果

对象

SimData 仿真数据
Configset 用于模型仿真的求解器设置信息
SolverOptions 指定模型求解器选项
RuntimeOptions 被砍伐物种的选择
CompileOptions 量纲分析和单位转换选项
SimFunction 执行SimBiology模型的类函数接口
SimFunctionSensitivity对象 对象的子类SimFunction对象
场景 模拟的场景

应用程序

SimBiology模型构建器 交互式建立QSP, PK/PD和机械系统生物学模型
SimBiology模型分析 分析QSP, PK/PD和机械系统生物学模型

例子和如何做

使用SimBiology模型分析仪App扫描剂量方案

探索满足疗效和毒性阈值的多个剂量。

执行参数扫描

这个例子展示了如何通过多次模拟一个模型来执行参数扫描,每次都改变一个参数的值。

概念

模型仿真

使用各种求解器模拟动态模型。

选择一个模拟求解器

SimBiology®在模型模拟过程中,使用求解函数计算不同时间间隔的微分方程组的解。金宝搏官方网站

加速模型模拟和分析

通过将模型转换为编译的C代码来加速仿真或分析。