预处理序列使用各种函数读取数据。根据测序数据的质量过滤读取,并修剪序列的端点。执行条形码匹配(解复用),以根据样本的条形码对其进行分组。将合并的对端序列数据分割成两个单独的文件。计算质量统计数据,并使用质量控制图将这些信息可视化。
seqfilter |
根据指定的条件过滤掉序列 |
seqtrim |
根据指定的标准修剪序列 |
seqsplit |
根据条形码将序列分割成单独的文件 |
seqsplitpe |
将合并的对端序列分割成单独的文件 |
seqqcplot |
为序列和质量数据创建质量控制图 |
使用Genomics Viewer应用程序查看细胞色素p450基因单核苷酸变异的NGS比对数据。