可以将表格数据导入SimBiology模型分析器应用程序或到MATLAB®工作区。支持的文金宝app件类型为Excel®文件(.xls、.xlsx)、文本文件(.csv、.txt)和SAS®导出文件(.xpt)。您还可以指定数据位于非EM中®格式的文件。导入过程根据NONMEM定义解释列。有关更多信息,请参见金宝app支持导入NONMEM格式的文件.
笔记
如果您的数据集包含作为输液数据的剂量信息,则数据集必须包含速率,而不是输液持续时间。
无论单位转换功能是开启还是关闭,数据文件中的剂量必须以数量(或)表示/时间
注入率)。默认情况下单位转换已禁用,因此必须确保数据的单位彼此一致。如果要启用单位转换,请参阅导入数据的单位转换.
如果您正在创建一个包含时间进程数据的文件,您想要导入到SimBiology中进行匹配,请创建具有以下列的数据文件:
组列-指定文本、数字或分类值。例如,您可以使用这个列将多个个体分组到单独的组中。然后,您可以将此分组或分类信息用于层次拟合.这一列是可选的。
ID列-指定文本、数字或分类值。文件中具有相同ID列值的行用于同一个人。如果测量数据仅来自一个人,则此列是可选的。
时间列-指定每个ID内单调递增的正值,定义剂量、观察测量和协变量测量的时间。
零或更多剂量列-创建一个剂量列为每个室被剂量。在每一栏中,指定表示添加到物种的剂量的正数。使用南
(不是数字)指定在指定时间未应用剂量。换句话说,指定剂量量为南
记录观察结果但未应用剂量时。
零个或多个速率列—指定正值、零或南
.0表示无限的速率南
指定不应用速率。速率栏与剂量栏相关联,并定义给药速率。例如,如果您可以在剂量1
列中指定其速率Rate1
列。
零个或多个观察列-指定数值或南
.南
值定义在指定的时间没有记录任何观测。使用南
为使用剂量但没有观察记录的次数。您可以在特定时间为每个ID指定一个观察值。当您有复制时,通过添加更多具有相同时间值的行,为同一时间点指定多个观察值。例如,请参见下面屏幕截图中的第2行和第3行中央数控在时间= 0时有两个测量值。
零个或多个协变量列——指定文本、数字或分类值,或南
. 每个值定义指定时间的协变量值。南
值表示在指定时间未记录协变量观察。SimBiology仅支持非时变协变量。例如,请参阅金宝app性别和年龄下例中的列。有关如何使用类别进行管件的示例,请参阅估计多个个体的特定类别PK参数.
下面是示例数据文件的屏幕截图。
您可以从以下位置下载示例Excel文件:matlabroot/ / simbio /数据/ sample_data_simbiology.xlsx例子
.matlabroot是安装MATLAB的根目录。您也可以输入matlabroot
在命令行中查看根目录的文件路径。
您可以指定数据在NONMEM格式的文件中。下表强调了SimBiology对该数据的解释®软件
列标题 | 理解 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID |
标识记录或组的文本(字符向量)、数字或分类值。导入过程假设具有相同值的连续数据包含来自单个数据的数据。如果数据包含对相同值的非连续引用,则导入过程将为遇到的第二个ID分配从第一个遇到的组派生的索引值。例如,如果ID列包含 |
||||||||||
时间 |
各组内单调递增的正值,表示观察时间或剂量或文本(字符向量)。数据文件可以指定时钟( 下表是导入过程如何将时钟值解释为十进制值的示例。
如果数据文件还包含 |
||||||||||
日期 ,DAT1 ,DAT2 或DAT3 |
确定观察日期或剂量。该列可以将月份包含为数字(
笔记
|
||||||||||
数码摄像 |
观测值的数值。列不能包含正 或–Inf . |
||||||||||
形状 |
定义行是否描述观察:
|
||||||||||
EVID |
定义为记录中的行描述的事件类型:
如果一列包含剂量值,但是 如果 导入过程不支持值金宝app |
||||||||||
CMT |
指示哪个隔间用于观察值或接收剂量。解释还取决于EVID :
笔记 SimBiology用1开始编号,而NONMEM用0开始编号。例如,如果NONMEM数据文件包含的剂量和测量 |
||||||||||
AMT |
正数表示剂量。0 或南 指定不给药。列不能包含正 . |
||||||||||
速度 |
表示输液速率的正数。0 指定一个无限大的速率(相当于一次药丸剂量),并且南 指定没有速度。列不能包含正 . |
||||||||||
2 |
正数定义剂量之间的时间间隔。 | ||||||||||
ADDL |
当数据指定在特定的时间间隔(定义为2 ),ADDL 指定系列中不包括初始剂量的剂量数。如果数据指定2 但不是ADDL ,则SimBiology假设给药发生在数据记录的持续时间内。 |
导入过程不支持(因此忽略)包含以下值或定义的行:金宝app
EVID
值3和4
党卫军
用于指定稳态剂量的列
PCMT
列,定义是否计算该行的预测
呼叫
列,用于调用ERROR或PK子例程
如果速率指定为小于零,则假定为零
使用。从表导入数据时SimBiology模型分析器,该应用程序支持以下金宝app列数据类型:双
,字符
,一串
,字符向量的单元格数组,分类
,期间
,必然的
,datetime
.
当您导入多维SimData
数组到应用程序中,应用程序将SimData
数组,并在相应的数据表中使用单个索引(线性索引)。例如,如果您导入一个2x2x2
SimData数组A.,应用程序将创建一个包含8个组(每个组一个)的数据表SimData
对象),索引从1到8。应用程序仍然显示原始尺寸SimData
数组中的浏览器.