主要内容
模拟对生物变异和剂量的反应
模拟生物变异性，以比较动物物种、菌株或实验条件，并研究不同的剂量策略
功能
sbiosimulate |
模拟SimBiology模型 |
createSimFunction |
创建SimFunction对象 |
sbiodose |
构建剂量对象 |
adddose |
将剂量对象添加到模型 |
addobservable |
将可观察对象添加到SimBiology模型 |
sbiovariant |
构造变量对象 |
addvariant |
为模型添加变量 |
sbiosteadystate |
的稳态SimBiology模型 |
sbioaccelerate |
为加速模拟准备模型对象 |
sbiosampleparameters |
通过抽样协变量模型生成参数(需要统计和机器学习工具箱软件) |
sbiosampleerror |
基于误差模型对误差进行采样，并在仿真数据中添加噪声 |
sbioplot |
绘图模拟结果在一张图中 |
sbiosubplot |
小区模拟结果在子小区中 |
sbiotrellis |
在格子图中绘制数据或模拟结果 |
sbioensemblerun |
的多个随机集合SimBiology模型 |
sbioensembleplot |
使用2-D或3-D图显示集成运行结果 |
sbioensemblestats |
从集成运行数据中获取统计信息 |
对象
可观测的 |
对象，该对象包含模拟后计算的表达式 |
场景 |
模拟的场景 |
SimFunction |
类似功能的界面来执行SimBiology模型 |
ScheduleDose |
定义给药方案 |
RepeatDose |
定义给药方案 |
变体 |
存储备用组件值 |
SimData |
仿真数据 |
Configset |
模型仿真求解器设置信息 |
SolverOptions |
指定模型求解器选项 |
RuntimeOptions |
被记录物种的选项 |
CompileOptions |
尺寸分析和单位转换选项 |
应用程序
| SimBiology模型构建器 | 交互式构建QSP、PK/PD和机械系统生物学模型 |
| SimBiology模型分析器 | 分析QSP, PK/PD和机械系统生物学模型 |
例子和如何
使用SimBiology模型分析仪应用程序模拟虚拟患者的生物变异性
生成模型参数的样本值来表示虚拟患者，并模拟探讨模型的可变性。
这个例子展示了如何创建和应用变体的G蛋白模型的野生型菌株。
这个例子展示了如何模拟正常和糖尿病受试者的葡萄糖-胰岛素反应。
概念
使用剂量来模拟不同的给药方案。
使用变量来存储模型的备用参数值和初始条件。
使用各种求解器模拟动态模型。
SimBiology®在模型模拟过程中，使用求解器函数计算微分方程组在不同时间间隔的解。金宝搏官方网站
通过将模型转换为已编译的C代码来加速模拟或分析。
使用两种不同的方法组合生成的样本。
故障排除
解决SimBiology模拟错误，如集成公差不满足错误，通过改变求解器或公差。
SimBiology使用AbsoluteTolerance而且RelativeTolerance控制仿真过程中积分的精度。
对于模型模拟，SimBiology利用质量平衡原理从模型反应中推导常微分方程(ode)。
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