图像缩略图

COVID-19模型

3.6.3版本(2.73 MB)通过 约书亚麦吉
这个模型是创建基于fitVirus的关闭。这是一个数据驱动的模型,获得最新的数据和预测COVID-19的传播。

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更新2020年05月03日

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创建跟踪模拟冠状病毒(COVID-19)的传播。通过网络获取数据的情况下并安装到一个逻辑模型随着时间的推移,预测疫情蔓延。

为了操作负载包含脚本COVID19Modelingv2的文件夹,并输入在命令提示以下代码:COVID19Modelingv2(“国家”)。
例如:COVID19Modelingv2( “US”)。多个国家可以在同一时间通过将其放置在列表进行分析:COVID19Modelingv2(“US”,“意大利”)。

该模型是由米兰巴蒂斯塔(fitVirus)创建的。该模型是一种数据驱动的模型适合疫情数据的逻辑曲线。该模型的目标是使对病毒式传播和流行持续时间本地预测。该模型可以用来在某些情况下提供精确的近似值。“回归收敛失败可能纯的初始猜测或小的数据集。因此,该方法并不适用于流行的早期阶段。此外,结果是无用的,如果回归统计不符合最低标准,说R ^ 2>0.8,p值<0.05“。(米兰巴蒂斯塔)

免责声明:型号会在某些情况下会失败。一个严格的统计分析,应该对所有的结果进行。遇到额外的流行阶段(而不是由逻辑功能描述)当模特失败。使用您自己决定。

详情参见:
https://www.researchgate.net/publication/339912313_Forecasting_of_final_COVID-19_epidemic_size_200320

数据在线保存,并通过JHU海派从各种渠道,包括提供:
“世界卫生组织(WHO),DXY.cn.肺炎。2020年,BNO新闻,
中华人民共和国国家卫生委员会?中华民国(NHC)
中国疾病预防控制中心(CCDC),卫生部,澳门,台湾CDC,美国CDC,加拿大政府的香港,卫生署的澳大利亚政府部门,欧洲中心的疾病预防和控制(ECDC)和卫生部新加坡(MOH)”

在图中,流行率绘制了蓝线(件/天)。蓝点是实际感染率(件/天)。区分开的颜色过渡流行阶段:
红 - 快速增长阶段
黄色 - 过渡到稳态阶段
绿色 - 收尾阶段

引用作为

约书亚麦基(2020年)。COVID-19模型(//www.tatmou.com/matlabcentral/fileexchange/74632-covid-19-modeling),MATLAB中央文件交换。检索

评论和评分(34

菲利普·库格勒

>> COVID19Modelingv2( '中国')
使用COVID19Modelingv2误差(线94)
行索引超出表的尺寸。

怎么会这样能解决吗?

戴阳

铝ķ

纳菲斯Ahamad

对不起错误
COVID19Modelingv2( '美国')
使用COVID19Modelingv2误差(线47)
表变量名必须是文字的载体。

凯斯扎曼

使用COVID19Modelingv2误差(线47)
表变量名必须是文字的载体。

约书亚麦吉

喜尤金,
A 3参数逻辑模型从数据拟合。
这是如下形式:A /(1 + B * EXP(-C * t))的
最好,
玩笑

尤金·加拉格尔

该项目精美的作品。我有用于安装物流的连续形式的套路,但我想出的K.我需要稍微不同的(低)值时,该物流是基于追查你是如何装修的3参数模型,只是R&K.

Dzenan Smajic

abdelkader.nhar

使用livemapcovid19误差(线46)
表变量名必须是文字的载体。
(MATLAB2018a)

约书亚麦吉

更新

马修

要求当前没有在规定提交优化工具箱。

特德·哈内斯

下面是州级数据的源:https://covidtracking.com/data/

约书亚麦吉

原始数据仍然存在,但它不再被更新。

约书亚麦吉

嗨Kirtis,
原始数据集是由源中断。请参阅“https://data.humdata.org/dataset/novel-coronavirus-2019-ncov-cases”。
不幸的是,没有什么我可以做这件事。我原本无意为这个模型提供国家级造型。我会让你知道,如果我找到一个新的数据源。
玩笑

Kirtis克里斯滕森

我不认为美国在饲料结果变量的网络路径上的输入文件进行细分。的现有版本有用于致使有美国和数据细分的每个状态的源路径。这需要在区域规划协助。
当我运行这个版本我碰到下面的错误 - >太多的输出参数。
我们可以得到的状态恢复到输入路径中的Excel文件的源数据?并确认,其他看到了同样的错误,我是谁?

摩根埃文斯

优秀作品。运行伟大。感谢您的辛勤工作。

约书亚麦吉

修复了所有的兼容性问题(希望)

拉尔夫Elsas

约书亚麦吉

嗨Suksan。这是一个兼容性问题,我仍然在努力解决。该代码运行在我的版本(2019b)的罚款。

Suksan Suwanarat

出色的工作,但是当我运行的代码它给我这个错误:
无法识别的属性“PreserveVariableNames”类
'matlab.io.text.DelimitedTextImportOptions'。
误差在fitVirusCV19v3(线132)
opts.PreserveVariableNames = TRUE;

约书亚麦吉

嗨摩根,

我没有问题,运行2019b。必须有与数据的导入的兼容性问题。我会在一个更强大的方法工作。

玩笑

摩根埃文斯

收到此错误,使用版本R2020a。

使用COVID19Modelingv2误差(线62)
重复表变量名:“男”。

约书亚麦吉

嗨Tsotne。我从其他用户听说过,这是一个兼容性问题。最简单的解决将是您的MATLAB升级到2019b或更新版本。

“在R2019b开始,变量名和列名可以包含任何字符,包括空格和非ASCII字符。另外,他们可以与任何字符开头,而不仅仅是字母。变量和列名不必是有效的MATLAB标识符(如由isvarname功能)决定,为保护这些变量名和列名,集PreserveVariableNames为true。”

Tsotne Marghia

非常感谢您为您的工作。我有这个特殊的错误

无法识别的属性“PreserveVariableNames”上课“matlab.io.text.DelimitedTextImportOptions”。

误差在COVID19Modelingv2(第24行)
opts.PreserveVariableNames = TRUE;

我该怎么办?

罗尔夫Boelens

嗨,大家好,我想看看该文档的一部分是空的。我无法找到它,你能帮帮我吗?我不断收到的消息:
使用matlab.io.text.TextImportOptions错误/ set.DataLine(线73)
的DataLine必须为正整数。

误差在COVID19Modelingv2(线23)
opts.DataLine = [2,INF〕;

我使用R2017b

谢谢!

约书亚麦吉

谢谢Kirtis。我会试着伸手维持数据集中的人。这是非常动态的,所以希望它很快就会更新。

Kirtis克里斯滕森

嘿大家。这是工作正常,但它已经停止。注意,在更新到死亡文件,这种模式依赖于失败的3/21列。如果有人访问修复列,这将开始工作增益。否则,解决方法如下。文件拉到你的本地文件夹,并使用readtable代替
webread(”https://proxy.hxlstandard.org/api/data-preview.csv?url=https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FCSSEGISandData%2FCOVID-19%2Fmaster%2Fcsse_covid_19_data%2Fcsse_covid_19_time_series%2Ftime_series_19-covid-Deaths。CSV文件名&= time_series_2019-ncov-Deaths.csv

如果您修复空的数据在3/21的deaths.csv在您的本地文件夹,我们下面一行事情会放大,直到网上的文件都是固定的。
%用途本地数据,因为在线数据似乎在一瞬间爆发了
导致= readtable( 'time_series_2019-ncov-Confirmed.csv');
deathresult = readtable( 'time_series_2019-ncov-Deaths.csv');

Orides Golyjeswski

Orides Golyjeswski

ilPlus30我得到了同样的错误。我相信这是某些版本的兼容性问题。我能够做一些改变的代码运行为我的国家的脚本。该特定问题,该解决方案是改变代码opts.DataLines = [2,INF〕;到opts.DataLine = [2,INF〕;因为在OPTS没有DataLines变量。

约书亚麦吉

嗨iiPlus30。这是最有可能与您的MATLAB版本的兼容性问题。其他用户,我还没有遇到这个错误。什么版本的,你运行?

ilPlus30

没有公共财产DataLines存在类matlab.io.text.DelimitedTextImportOptions。

误差在COVID19Modelingv2(线23)
opts.DataLines = [2,INF〕;

约书亚麦吉

难道这正常工作为大家?

Matlab的专家

更新

3.6.3

更新5/2

3.6.2

更新4/30

3.6.1

更新4/22

3.5.9

更新4/18

3.5.8

更新4/17

3.5.7

更新和补充笔记4/15

3.5.6

与链接更新为深入介绍

3.5.5

更新4/15

3.5.3

更新图像

3.5.2

- 更新图形样式

3.5.1

更新4/13

3.5

- 更新4/13

3.4.9

更新4/11

3.4.8

- 更新4/10

3.4.7

更新4/9

3.4.6

- 更新4/8

3.4.5

- 更新4/6

3.4.4

- 更新4/5

3.4.3

- 更新4/5

3.4.2

- 更新数据

3.4.1

-图片

3.4

- 更新4/1

3.3

的示例标签上-fixed图表

3.2

更新3/31

3.1

在例如标签-fixed曲线

3.0

-更新

2.9

- 增加了更多的例子

2.8

- 更新实例

2.7

订做可执行脚本的功能
- 新增实例

2.6

-bug修复和改进

2.5

-optimization笔记

2.4.9

-bug修复

2.4.8

-图片

2.4.7

-兼容性

2.4.6

-bug修复和兼容性

2.4.5

-描述

2.4.4

-名称

2.4.3

-兼容性

2.4.2

-attempted要修复的变量名的兼容性问题

2.4.1

-名称

2.4

-compatibility修复

2.3.9

- 修正了所有的兼容性问题

2.3.8

-bug修复

2.3.7

-fixed预测()米兰巴蒂斯塔的功能礼貌

2.3.6

- 更新,以反映数据库的变化

2.3.5

-compatibility记

2.3.4

- 更新兼容性

2.3.3

- 增加图表总感染估计的形象化稳定性(米兰巴蒂斯塔提供)

2.3.2

-Ability同时运行多个国家模拟

2.3.1

-version#

2.2.212.1

-名称

2.1

-描述

MATLAB版本兼容性
创建与R2019b
与R2019b兼容任何版本
平台兼容性
视窗 苹果系统 Linux的
致谢

启发:fitVirus

启发:冠状病毒跟踪 - 国家建模