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6.19 |
小更新。 |
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6.18 |
轻微更改为6.17。 |
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6.17 |
在Simulink中为beta函数添加额外的分支多达30个分支。金宝app还包括其他一些可视化改进。 |
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6.16 |
由于添加了新的数据源而修改代码。 |
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6.15 |
轻微的变化。 |
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6.14 |
轻微的变化。 |
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6.13 |
轻微的变化。 |
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6.12 |
小的变化。 |
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6.11 |
小更新。 |
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6.10 |
将“WorldCOVID19”程序添加到包中,用于绘制全球传播约一年的病毒的2D、3D、线性和对数彩色地图(仅通过更新数据即可编辑)。 |
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6.04 |
轻微的变化。 |
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6.03 |
轻微的变化。 |
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6.02 |
小更新。 |
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6.01 |
与之前版本的Simulink (R2018a, R2018b, R2019金宝appa, R2019b, R2020a, R2020b)兼容 |
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6.00 |
这个版本的SimCOVID在一个包中同时运行Simulink和MATL金宝appAB模型。 利用MA金宝appTLAB R2020b建立Simulink模型。 |
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5.80 |
在这次更新中,将新每日确认的数据与模拟的(梯度(I+R))进行比较。 I+R为累计确诊病例。 |
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5.75 |
您可以绘制从模拟中获得的beta、gamma和lambda结果。参见更新5。 |
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5.74 |
一些评论。 |
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5.73 |
添加一些笔记。 |
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5.72 |
一些改进 |
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5.71 |
微小的变化 |
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5.70 |
在文件夹(SimCOVID5\SimCOVID5\Update_5)中添加Method-5 (Update-5),以允许用户选择模拟(模拟数据)的开始和结束日期。 |
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5.62 |
选择时间变量位置(t0)的更有效方法。 |
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5.61 |
更新预印本(附)。 |
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5.60 |
“更新4”中的程序现在有一个新的变量控制参数“c”。 你可以将它用于三个版本的预测: (1)悲观预测(c=0.0) (2)乐观预测(c=1.0) (3)中度预测(c=0.5) 或者其他任何值。 |
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5.56 |
小的评论。 |
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5.55 |
小更新。 |
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5.50 |
小的评论。 |
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5.45 |
添加另一个程序,其回收率由s形函数表示(除了感染率)。 |
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5.40 |
小更新。 |
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5.35 |
将累积图添加到更新-3程序(SimCOVID5\Update_3_NEW)。 |
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5.30 |
小更新。 |
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5.20 |
添加另一个通用方法(Update_3_NEW)来预测未来的爆发,而不管模拟时间的长短。更改模拟时间以获得短期、中期和长期估计。 |
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5.10 |
一些改进。 |
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5.00 |
新: 加入使用SIR和SEIR模型(MATLAB版本)对COVID-19传播的短期、中期和长期估计。 |
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4.300 |
更新: 将SEIR模型添加到MATLAB文件(文件夹“3_NEW_Generalized_Detailed”)。 |
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4.210 |
小更新。 |
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4.200 |
添加一个新文件夹,在同一图表上绘制感染和死亡病例。文件夹的名称是“death_and_感染力”。 |
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4.175 |
小的评论。 |
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4.105 |
小的修改(标签,评论…) |
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4.100 |
添加另一个带有多个场景图的通用情况。 |
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4.095 |
小的评论。 |
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4.090 |
利用死亡病例(除感染病例外)跟踪和估计疫情爆发。 |
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4.085 |
添加一个文件“Generalized_Method3”,以便随时绘制更改。 |
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4.075 |
添加另一个通用的估算程序。 |
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4.05 |
对“通用”程序进行了一些改进和评论。 |
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4.02 |
小更新。 |
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4.01 |
一些小笔记。 |
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4.0 |
新: 采用一种广义方法来确定beta函数所需的s形函数数量(每次爆发根据需要将具有不同数量的s形函数)。 |
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3.90 |
在MATLAB文件夹中添加带有20个sigmoid函数的beta函数的详细模型。 |
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3.85 |
将另一个程序添加到MATLAB文件中,使用十个s形步骤(结果更平滑,但“以秒为单位”相对较慢)。 |
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3.81 |
旧版本中的一些改进。 |
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3.80 |
一些改进在最新的MATLAB文件(更快)。 |
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3.70 |
小的改进。 |
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3.61 |
小的评论。 |
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3.60 |
小更新。 |
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3.50 |
更新1:现在根据给定的数据(变量)自动选择sigmoid函数中使用的时间参数的初始值。 更新2:更新了sigmoid函数,以捕获一些快速的动态变化。 |
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3.30 |
更新了s形函数和参数限制。 |
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3.20 |
小的评论。 |
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3.2 |
小的评论。 |
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3.1 |
更新:添加R0(复制数)图。 |
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3.0 |
现在,可以用一种普遍、简单、快速和有效的方式模拟世界各国的疫情。 |
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2.3000 |
将“变量beta -变量gamma”的案例添加到MATLAB文件夹中(程序4在最新的“新增”文件夹中)。 |
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2.2000 |
在MATLAB-version文件夹(最新的“新增”文件夹)中添加一个文件,以模拟考虑多个参数值(beta函数中的百分比变化)的问题,并绘制相应的区域。 |
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2.1111 |
向MATLAB版本中添加另一个文件夹,用于估计在其余模拟时间内的爆发情况(由用户选择)。 |
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2.0111 |
添加用于绘制所有状态变量的文件夹。 |
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2.011 |
固定x轴标签(日期)。 |
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2.010 |
小的评论。 |
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2.01 |
添加一些评论。 |
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2.0 |
新: 新增SimCOVID的MATLAB版本。 所考虑的个案包括: 美国、英国、意大利、西班牙、法国和德国。 它可以很容易地为新的案例研究进行修改。 |
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1.1222 |
“New金宝apply_Added”文件夹中的Simulink文件也被保存以供旧版本(R2019b, R2019a, R2018b, R2018a)使用。 |
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1.1221 |
在文件夹金宝app"Newly_Added"中的Simulink文件也被保存以供旧版本(R2018a, R2018b, R2019a, R2019b)使用。 |
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1.1211 |
改进一些详细的评论。 |
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1.121 |
使用了三个初始易感(S0)版本: 1.整个种群被认为是易感的(S0=N)与之前模拟的一样。 2.半数人群被认为是易感人群(S0=1/2*N) 3.10%的人口被认为是S0 |
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1.120 |
SIR的更简单的模型在这个文件夹中展示。 1.可变beta,常数gamma(见钟磊,mul 1,李俊杰,王俊杰,尹志强,刘德麟,“基于简单数学的中国大陆2019年新冠病毒爆发的早期预测 |
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1.110 |
在零时刻使用并行循环计算添加beta参数的更改。 |
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1.102 |
添加一些评论 |
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1.101 |
在beta参数中添加更改。 |
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1.10 |
小编码注释。 |
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1.1 |
添加一个新文件夹以对感染率变量执行并行循环。这可以让你在纸上自动绘制一些图,如图5a-b。 一个新的版本也即将到来,从MATLAB自动优化参数。 |
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1.0.11 |
小的代码注释 |
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1.0.1 |
1.用新的光滑阶跃函数代替旧的光滑阶跃函数,用s形函数给出光滑的结果。 2.旧版本(R2018a, R2018b,和R2019a)也包括,除了R2019b,用于创建Simulink文件的版本。金宝app |
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1.0.0 |
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数据来源将人口年份从2018年改为2019年。如果您下载并使用新数据,请更新代码中的相关行:
“popData2018”到“popData2019”。
确保您的excel表格在代码所在的文件夹中,并确保其名称。这就是错误消息告诉你的。
我得到以下错误时,试图运行您的代码。
使用readtable时出错(第216行)
无法打开文件
“covid - 19 -地理disbtribution -世界- 2020 - 05 - 30. - txt”。
SEIR_Long_Term错误(第6行)
COVID19_Data =
readtable(“covid - 19 -地理disbtribution -世界- 2020 - 05 - 30”,
“ReadVariableNames”,真正的);
对于估计,从一个较低的值“MaxNumChanges”(> 1)开始,即2、3、4、5,等等。如果有足够的数据,或者疫情超过了峰值,可以增加它。3 - 5个典型值。
要估计未来的疫情,只需将模拟时间更改为大于报告病例最后一天的值。
(请参阅文件Generalized_Method中的注释)。
文件中还以注释的形式提到了一些主题。例如,在3-10之间选择s型函数的数量。如果您选择了大量的s型函数,您将让最后的模拟值影响预测,这不是首选。
如何使用这个模型进行未来预测
谢谢Ismael的回复。良好的工作。用新版本(R2020a)的Simulink创建的文件夹'Newly_Added2'。金宝app这个文件夹与旧版本的Matlab不兼容。请创建上述文件夹,与旧版本的matlab(2019, 2018…)兼容。
请注意,有几个更新的文件夹中使用了不同的公式作为beta函数。最新的一个使用了(1)类似的函数来表示没有指数幂的变量和变量(2)常数和变量没有指数幂的。你可以用这个。在本文的第2节,第3段中提到(对于恢复增益的参数在0-2之间为正值,而对于感染函数的指数幂的值为负的相似值,选择了一组合理的初始值)。我希望这对你有所帮助。
Beta*e^u在你的论文中没有提到(只提到了Beta),但它在Simulink块中使用。金宝app为什么?e^u的数学表达式是什么用,和s形函数表示,用,和s形函数表示。
为了优化参数(beta和gamma),请使用Simulink工具“参数估计”,如下面的视频所述:金宝app
https://www.dropbox.com/s/ncihp1dbqx1p35m/Italy_Optimization.webm?dl=0