错误- xml文件转换成计量矩阵使用sbmlimport函数

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帕迪可以喝 2015年6月24日

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//www.tatmou.com/matlabcentral/answers/225123-error-xml-file-conversion-into-stochiometric-matrix-using-sbmlimport-function

评论道: 英格丽tigg 2015年6月25日

你好,

我使用sbmlimport函数将KEGG通路SBML (KGML)文件转换为计量矩阵。它有.xml扩展名，但是得到这个错误——错误使用simbiological . sbmlreadwrite /sbmlread。读取此文件时发生致命错误。privatesbilio错误(第26行)。smlimport错误(第62行)ret = privatesbmlio('read'，nargout，{fullfilename, varargin});

1.我使用Matlab 2014a。2.例如，m = sbmlimport('lotka.xml');[M,objSpecies,objReactions] = getstoichmatrix(m1);是有效的，但不是我的Kegg路径。我下载了一个酒桶路径-http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?map=hsa05230&show_description=show。代码是m = sbmlimport('hsa.xml')，但它给出了错误。