xml文件转换成化学计量矩阵使用sbmlimport函数

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帕迪可以喝 2015年6月24日

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//www.tatmou.com/matlabcentral/answers/225123-error-xml-file-conversion-into-stochiometric-matrix-using-sbmlimport-function

评论道: 英格丽tigg 2015年6月25日

你好,

我正在使用sbmlimport函数将KEGG通路SBML (KGML)文件转换为化学计量矩阵。它有.xml扩展名，但得到这个错误-错误使用SimBiology.SBMLReadWrite/sbmlread。读取此文件时发生致命错误。privatesbmlio中的错误(第26行)。错误在sbmlimport(第62行)ret = privatesbmlio('read'，nargout，{fullfilename, varargin});

1.我使用Matlab 2014a。2.例如，m = sbmlimport('lotka.xml');[M,objSpecies,objReactions] = getstoichmatrix(m1);是有效的，但不是我的Kegg路径。我下载了一个kegg路径——http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?map=hsa05230&show_description=show。代码是m = sbmlimport('hsa.xml')，但它给出错误。