分割骨和体绘制CT数据集

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简森-巴顿 2017年7月31日

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//www.tatmou.com/matlabcentral/answers/350880-segmenting-bone-and-volume-rendering-ct-datasets

评论道: 亚历山大Juall2020年4月8日

答:接受 Sharan Paramasivam Murugesan

大家好！

我在分割和体绘制CT DICOM数据方面遇到了瓶颈。我需要帮助。

我的输入是一个原始CT Abdo dicom，我已经转换成一个3D矩阵(512x512x118双)。我想要实现的输出是扫描的骨骼组件的3D渲染体，然后我可以操纵观看位置/方向轴(IE。从多个视角保存骨架的jpeg)。我的目标是将这些图片输入神经网络。

我可以使用体积查看器应用程序生成足够的骨架等值面体积渲染图像，见下文。是否有一种方法可以通过命令行输入来使用Volume应用程序?(我有很多ct要处理)。对于每个CT卷渲染图像，我想保存一个JPEG从预先设置的视角(即。45*， 90*等围绕z轴)，这将不可能使用应用程序本身。或者，是否有一种方法可以将体积渲染的图像保存到工作区，这样我就可以操纵体积查看轴了?

感谢输入!

1评论
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亚历山大Juall 2020年4月8日

你好,

我是罗文大学生物医学工程专业的学生。我的顶点项目围绕着在软骨下骨中寻找空间间隙的体积的任务。我已经尝试了几个体积渲染工具箱，包括图像处理工具箱，体积查看器和颜色阈值。这些都可以根据手动设置的阈值对dicom图像进行分割。但是，这些工具箱不能创建roi，这意味着当图像被分割时，由于dicom文件的灰度性质，整个图像将被突出显示。我还没有找到一个程序可以执行这三个任务，创建ROI，阈值ROI，并为ROI产生输出量。有人知道文件交换或工具箱可以提供帮助吗?我尝试创建自己的代码来执行这些任务。但是，我一直无法单独与dicom图像进行交互。我只能创建一个显示我的dicom目录的视频播放器。 Any help is greatly appreciated!

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