@daiana pur，
这些是我改变的位，以适应我的需求：
对于自定义颜色映射，从负号到正号，从蓝色到白色到红色:
addParameter (p,“标签”,defaultLabel @iscell);
[行，Col，V] =查找（AddacencyMatrix）;
[~,我]= (abs (v));
row =行（i）;
col = col（i）;
v = v（i）;％此分类将确保从最弱到最强的绘图线条，保持底层的弱连接
Colourmap = Zeros（长度（v），3）;％这是蓝白红色的Colourmap
对于colourmapping = 1:length(v)
如果v（colourmapping）<0
Colourmap（Colourmapping，:) = [0.2 0.2 1] + [0.8 0.8 0] *（v（托尔马图）+1）;
别的
Colourmap（Colourmapping，:) = [1 0.2 0.2] + [0 0.8 0.8] *（1-V（Colourmapping））;
结束
结束
解析（p，adjacencymatrix，varargin {：}）;

为了改变线宽，原来的线宽已经有了，我调整了一些位:

minLineWidth = 0.1;
lineWidthCoef = 1;
u = abs (v);
线宽=美国/ max (u);
线宽=线宽。^ 2;%当系数具有相似的绝对值时，使用幂来控制线宽的范围
如果sum（linewidth）== numel（linewwidth）％所有行都是相同的宽度。
线宽= repmat (minLineWidth元素个数(线宽),1);
其他％的可变宽度行。
linewidth = linewidthcoef * linewidth + minlinewidth;
结束

嗨，是否有没有添加箭头以指定​​连接的方向？

此外，如何使用相关强度改变线路的代码是什么，并具有Colormap匹配。我无法从下面的评论中弄清楚。会欣赏任何帮助！

解决了二，三，还剩一题，谢谢你，屋大维

/ home / hom / ovl /图片/截图起，2020-11-22 14-07-32.png
/home/ovl/ images /截图from 20-11-22 14-07-57.png
伟大的工具。三个问题：
1.专业：看到上面的图片，它代表了两个连续变焦+的初始图，在matlab中，由于某种原因，该图夹在矩形，中央画布中。我不能没有放大，因为这是一个大的连接矩阵（来自FreeSurfer的Destrieux包裹）。
2.次要:看上面的图片，标签文件包含标签(来自相同的集合包裹)，其中包括'_'和'-'在他们的名字，但这些读取为转义字符，它看起来不整洁。
3.非常小:由于某些原因，如果我首先选择All，然后只禁用一个节点(通过单击它的小圆)，则显示的连接不会更新;所以如果一个人想显示所有但一个节点,一个必须单独点击激活所有节点,但一个被排除在外(这是一个极端的例子,但它将会很高兴有一个刷新选项后激活/ disactivating各个节点(工具/重置不做)

@Chiara Bulgarelli,
我认为你可以这样做，用代码中的这个块手动调整颜色图，
对于colourmapping = 1:length(v)
如果v（colourmapping）<0
Colourmap (colourmapping，:) = [0.5 0.5 1] + [0.5 0.5 0]*(v(colourmapping)+1);
别的
Colourmap（Colourmapping，：）= [1 0.5 0.5] + [0 0.5 0.5] *（1-V（Colourmapping））;
结束
结束
然后你只要把"colourmap"矢量放到指定的地方，这是一个颜色地图，从蓝色到白色到红色，从负数到正数。

嗨，有没有办法根据一些强度改变节点的大小？

@Paul，非常感谢你的代码!

@Ryan McDoNough，我正在尝试修改版本，为相关的相关性使用不同的颜色。但是，我只有一个节点在中间的一个节点，没有别的。你介意在这里附加整个代码吗？

非常感谢
Chiara.

亲爱的Paul，非常感谢这个例子，这正是我在ML动态溢出分析中试图做的。
但我有个问题。当我运行代码时，我会收到一个错误，因为功能'circulargraphy？本身不接受双重类作为输入。

我也尝试了细胞类型，同样的结果。你能给我一个提示吗？

问候，

gianfranco portaluri.

嗨，保罗，谢谢你的情节。
有没有可能把下面的弧调高一点，这样acs的顶点就更接近圆心了?
非常感谢你，enrico

也发生了变化

[row2、col2 v2] =找到(correlationMatrix);%v2将创建所有相关值的Nx1矩阵

来

diag = tril（correlitationmatrix）;
对于n = 1：尺寸（DIAG，1）
v2（n，1）= max（diag（n，:)）;
结束

跟进我的评论。改变两个实例

>“颜色”,this.ColorMap(行(i),:)…

来

>'颜色'，defaultColormap（i，:)，...

对于那些想要根据相关价值控制线颜色的人，我找到了解决方案

将第二个输入添加到函数调用以包含另一个矩阵（如果仅使用一个矩阵忽略，只需用AddacencyMatrix或您选择的矩阵替换CorrelationMatrix）

>功能=循环（AddacencyMatrix，CorrelationMatrix，Varargin）

在线之后

> p = inputParser;

粘贴以下内容，将你组装的相关值数组转换为实例顺序的RGB值:

> [row2，col2，v2] =查找（correlationmatrix）;%v2将创建所有相关值的Nx1矩阵
= >地图colormap(热);%初始化颜色映射，将颜色映射方案更改为您所选择的颜色映射方案之一
> minv = min (v2 (:));%min Max来建立颜色地图的边界
> maxv = max（v2（:)）;
> ncol = size（地图，1）;
> S =圆形（1+（NCOL-1）*（V2-MINV）/（MAXV-MINV））;％规模表明转换
> rgb_image = ind2rgb(年代,地图);%将缩放指标转换为RGB，得到Nx1X3矩阵
>defaultColorMap =重塑(rgb_image， [length(v2) 3]);%重塑为Nx3矩阵

更改当前第46行(将变为第54行)

> addParameter (p ' ColorMap defaultColorMap, @ (ColorMap)长度(ColorMap) = = (adjacencyMatrix));

来

> addParameter (p ' ColorMap defaultColorMap, @ (ColorMap)长度(ColorMap) = = (defaultColorMap));

现在的121行(将变成130行)

>“颜色”,this.ColorMap(行(i),:)…

您还可以创建一个自定义颜色映射，它是您拥有的节点连接数的长度，并将其提供给代码(可能需要更改几行)。希望这可以帮助!

来

>'颜色'，defaultColormap（i，:)，...

@Richard谢谢你修复了线路外的磁盘bug!
对于其他人，请注释掉这一节:
如果u(1) >= 0 && v(1) >= 0
％确保弧在单位磁盘内
Theta = [Linspace（Max（Thetalim），PI，50），...
linspace（-pi，min（etalim），50）]。';
别的
Theta = Linspace（雷达姆（1），六甲基姆（2））。';
结束

而是替换为此：

sortedthetaLim = (thetaLim)进行排序;
如果sortedthetaLim (2) -sortedthetaLim(1) >π
thetaLim (1) = sortedthetaLim(2) -(2 *π);
thetaLim (2) = sortedthetaLim (1);
结束
Theta = Linspace（雷达姆（1），六甲基姆（2））。';

嗨，是否有一种方法可以在绘制相关系数时从-1到1调整Colormap范围？

谢谢你的功能，我真的很喜欢它。有没有办法关闭按钮？我试图评论代码的各自部分，但不知何故它不会影响外观......谢谢！

嗨，是否有任何方法可以同时更改节点编号的字体大小，而无需单独执行它们？

嗨，当我创建一个新的标签，它只是覆盖它。如何先删除默认标签?matlab。

干杯。

谢谢分享，等不及要尝试了。

我指的是这篇文章中的第二个人物:http://circos.ca/intro/tabular_visualization/

如何指定图中节点的数量?

你是怎么做圆形图和颜色条的?

@Paul似乎有个问题，有些弧线是向外而不是向内的;我认为如果节点数能被4整除就可以。在这种情况下，talim(2)是+pi，但算法期望的是-pi，并最终绘制了错误的两个可能的弧线。我通过明确检查哪个弧更短(排序talim，如果值之间的差是>pi减去2*pi从较大的一个，把它放在第一个)，并绘制它，而不是做u(1)，v(1)>=0检查。希望会有帮助!

@John,谢谢!(：

非常感谢这非常赞赏的代码。我一直想尝试一下，“今天就是最好的机会!”

@Roman，看起来像是一篇有趣的文章!谢谢引用我的代码。(我很高兴有用。)我已经把你的文章分享给了MathWorks的一些朋友，他们一直在考虑在化学/ ChE课程中使用计算。干杯!

我在出版物中使用并引用了您的代码:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1749772816300768#fig0015

@Paul Great Tool，谢谢。我拥有的一个问题是我的一些图表在外面的节点之间有一些连接。看起来有点奇怪并穿过标签。你熟悉这个以及如何解决它吗？非常感谢。

@Iness
您没有使用此代码控制颜色（请参阅下面保罗的回答）。
为了改变线的宽度:在circularGraph。米去
％基于s的值（存储在v）的值并调整参数来计算线宽
例如：
minlinewidth = 5;
lineWidthCoef = 5;
线宽= v;
希望它有效。
问候，

请我想改变线条的颜色及其宽度，我该怎么办？

亲爱的，所有人都可以启动绘图时钟位置12:00，然后顺时针顺时针，而不是9:00？我怎样才能管理这个？

@gyan.
您的用例超出了我的设计可以做的事情。我设计了节点和连接线作为单个图形对象：具有单个标记的线（）。因此，当更改节点的颜色时，更改出来的所有连接的颜色。您的用例可能很常见。如果我发现时间，我会考虑改变这种设计以启用它。与此同时，您现在可以与Matlab中的网络图表功能相得同。我在MATLAB包括网络图形作为基本数据类型之前写下了这一点。请选中此文档页面：

//www.tatmou.com/help/matlab/graph-and-network-algorithms.html.

谢谢@mathworks物理团队
但是我仍然有控制连接线颜色的问题。
您能否请帮助我根据阈值生成连接线（例如，连接值为1，则连接行#red，如果连接值为2，则连接线是#blue）。

@gyan.
感谢您的笔记和评级。

在节点的makeLine()中。M，在行对象构造中，添加以下行:
MarkerFaceColor, this.Color,……

将这行代码添加到Node.m中的updateColor()中
this.NodeMarker.MarkerFaceColor = this.Color;

将此代码添加到Node.m中的UpdateTextLabel（）的末尾
this.TextLabel.FontWeight =“大胆”;

指定每个节点的颜色。
c =循环（x）;有点x的％
提出= colormap(酷(长度(c.Node)));%一些colormap
当k = 1时:length(c.Node)
c.Node (k)。颜色=提出(k,:);
结束

亲爱的保罗，
请您帮我做一下:
1.用固定的颜色填充特定的节点。
2.控制线的颜色。
3.制作标签字体粗体。

感谢这个伟大的工具。

亲爱的保罗，有可能给这些联系的颜色赋予意义吗?例如，它们能根据连接的强度涂上颜色吗，有点像热图?你能给我一些如何做到这一点的建议吗?

这真的很有帮助，谢谢你…我也想知道如何减少字体大小?你能否在下面提供更多的信息?另外，我如何从一个以上的节点添加连接请?目前，我只能为一个节点添加连接。
谢谢，Gemma.

@PAUL：伟大的可视化工具，简单，但有效。始终想要一些版本的matlab。在侧面笔记中，我不得不修改第120和143线：从违法行为（i）到abs（linewidth（i）），所以我可以绘制负连接（反相）

@Paul非常感谢。我非常感谢您的快速回复和帮助。

@atif，谢谢你的赞美和评级。

我建议在节点类中编辑UpdateTextLabel（）方法（在此包的Node..m中定义）。在UpdateTextLabel（）中，创建底层文本（）对象（内置到MATLAB的类），这是分配文本（）对象的FontSize属性的好地方。

如果需要进一步帮助，请告诉我。
-
保罗

这太棒了。感谢分享。
我的标签字体有问题。我画了50个有长标签的节点。在我的情况下，圆形图形抑制实际图形的大小，并放大标签字体大小，但我希望它反过来。是否有一种方法可以减少节点标签的字体，并放大图形本身?

1词:棒:)

@Donald，在名为node的文件中。M看哪一行是

集(this.Connection,“颜色”,0.9 * (1 1 1));

把它改成

(此设置。连接、“颜色”(1 1 1));

保罗,

这很有用。有没有办法使隐藏的连接变白（匹配背景）而不是灰色？

大学教师

@ivan，谢谢（：

可以扩展很多功能，但仍然是一个很好的工作。谢谢你！

@MarcVanKralingen你可能有一个例子代码片段来演示这个问题?

其中一条线放在圆的外面。我找不到漏洞。

@Cristi
您可以通过在CircularGraph.m中更改第112行来修复BUG
如果是行（i）来
如果row(i) ~= col(i)

你好，非常好看的图表!它是否也适用于有向图，即矩阵的上下三角形都有1 ?
我在矩阵“hc”上运行代码，其有1个值对以下标签进行关流：
> > c.Label(找到(hc (:, 4) > 0))

ans = ' A ' '“ACC MOFC”“MTG”的“”PHG PMC“R””TP”

> > c.Label(找到(hc (4:) > 0))

ans ='a'''''''pcc'''vlpfc''''ai''pi''

然而，当只突出显示节点4，点击标记为ACC'时，只绘制4条线，从ACC'到PCC'、VLPFC'、aI'和pI'。
此外，在查看节点4时，它返回5个连接，尽管在图表上只能看到上述4个连接：
>> C.Dode（4）

ans =.

具有属性的节点：

标签:ACC”
连接(1 x5线):
位置：[-0.9629 -0.2698]
颜色:[0.2095 0.2331 0.6660]
可见:1
程度：0.2833

对这个问题的任何想法？显然，它只绘制与具有更高数字的节点的连接，在此示例中忽略节点2（a'）和3（acc）。

谢谢,
Cristi