成像photoplethysmogram (iPPG)技术为远程非接触式脉搏测量。iPPG通常从面部或棕榈视频获得的。
这个包提供了iPPG信号提取和处理工具。[1]的恒河猴iPPG数据作为测试数据集。
输入:视频文件。
输出:iPPG信号;估计脉冲重复频率。
内容:
1。extract_color_channels_from_video提取彩色视频信号。颜色信号计算值的红色、绿色和蓝色的颜色组件平均在感兴趣的区域(ROI)为每个视频帧。ROI可以选择手动第一帧(如果预计只有有限的运动)或设置自动使用Viola-Jones算法(iPPG提取人脸只!)。这个函数选择不包括从ROI non-skin和损坏的像素。
2。compute_ippg实现iPPG提取方法被认为是[2](包括最近推出了铬和POS方法)以及一些iPPG预处理和后期处理技术。
3所示。ippg_extraction_example——基本(最小)的例子使用包的脉搏率估计iPPG从视频中提取。
4所示。dataset_analysis——扩展示例使用的包数据[1]。
5。信号处理技术实现为单独m-files: wavelet_filter wavelet_init_scales, smoothness_priors_detrending std_sliding_win。
6。函数脉冲率从iPPG估计信号:
6.1。DFT_pulse_rate_estimate使用离散傅里叶变换来计算平均脉冲率。
6.2。wavelet_pulse_rate_estimate使用连续小波变换来估计脉冲重复频率。
7所示。有用的功能比较iPPG-based脉搏率与地面的真相:
7.1。bland_altman_plot——吸引平淡Alman情节的数据。
7.2。compute_SNR——计算iPPG信号的信噪比(信噪比)考虑到真正的脉搏。
7.3。assess_estimation_performance -计算估计的质量指标,包括均方根误差、平均绝对误差,皮尔森相关等。
8。数据集文件夹包含数据集用于测试包。数据被记录从恒河猴,因此脉冲率高于人类(100 - 250 BPM),详情请参阅[1]。
9。dataset_description。数据集的多克斯包含一个简短的描述。
额外的功能将被添加。

确认:
我要感谢廉价香烟Slapničar广泛的测试和改进代码。
我想感谢卡多佐博士将玉。m脚本,用来实现ica的iPPG提取。

引用
[1]Unakafov, Moeller年代,卡根,盖尔,狼的忠诚,f .使用成像photoplethysmography心率在非人灵长类动物的估计。《公共科学图书馆•综合》2018;13 (8):e0202581。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0202581
[2]Unakafov。脉冲重复频率估计使用成像photoplethysmography:通用框架和比较公开的数据集的方法。生物医学物理与工程表达。2018;4 (4):045001。