显微镜图像浏览器入门

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简要描述

摘要近年来,多维显微成像技术的快速发展,对获取的数据集进行有效的图像处理、可视化和分析提出了许多问题。世界各地的大多数大学都提供了现代成像技术,因此任何研究人员都可以相当容易地获得所需样本的描述性多维数据集。

在获取数据集之后,必须对数据集进行分析,如果不从多维数据中分割(创建模型)感兴趣的对象,通常不可能进行详细的分析。分割似乎是图像分析程序中最耗时的部分。例如,正确地分割一张电子断层图可能需要一个月的时间。缓慢的过程是由两个主要因素造成的:有限的种类好的软件工具(甚至商业的)和良好的用户友好的分割算法,可以用于促进建模。因此,收集和未正确处理的数据的数量远远高于产生的结果的数量。

随着显微镜图像浏览器(MIB)的开发,我们解决了这个问题,并提供了一个免费的、开源的软件包,可以用于图像处理、分析、分割和多维数据集的可视化。

该程序被设计为工作在Matlab环境和作为独立的实例。在后一种情况下,需要安装MATLAB编译器运行时(MCR),它可以从以下网站免费获得MathWorks

请注意,在编译版本中可能没有所有可用的特性。

开始这个项目

请按照手册中描述的步骤安装部分安装程序。

开始显微镜图像浏览器im_browser命令的主Matlab窗口,并参考以下章节的功能细节;特别是用户指南部分。

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