显微图像浏览器的数据层(图像、模型、蒙版、选择)

显微图像浏览器具有在内存中保持打开的数据集的分层结构。每个打开的图像数据集存储在图像层。的图像层是补充额外模型面具选择层等于图像层X, Y, z尺寸。这些额外的层用于图像分割过程。

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内容

一般的组织

为实现可视化,将所有层组装在一起以显示显示在图像视图面板MIB。每一层都可以开关;透明度和颜色也可以修改。

为了在默认情况下保留计算机内存,所有附加层(模型面具,选择)保存在8位无符号整数类的同一个数据块中。这将材料的数量限制在63个,但减少了内存需求。或者,也可以将材料数量增加到255个。然而,在这种情况下,MIB将把每个额外的层存储在一个单独的数据块(变量)中,这将增加两倍的内存需求。组织的类型可以在Preferences对话框菜单- >文件- >首选项).

图像层

图像层包含2D-4D显微数据集。它是始终存在的基本层。

选择图层

选择层是图像分割所需要的。它是一个临时层,可以很容易地使用手动或一些自动分割工具进行修改。默认情况下,它显示为绿色(可以从中选择颜色)Preferences对话框

分割例程只影响选择层(除了一些自动例程修改面具图层),不影响模型层,定义为存储分割的最终结果。因此,分割过程中的任何错误都不会影响现有的模型,并且可以使用以下方法之一进行潜在的修复:

  1. 方法撤消最近的操作Ctrl + Z中的“撤消”按钮工具栏
  2. 手动固定时使用笔刷工具在橡皮擦模式下:使用笔刷配合控制按下键(详见画笔工具的描述
  3. 选择图层可以被完全清除C快捷方式(使用Shift + C为整个数据集清除选择的快捷方式)。

当选择好到足以被接受时,它应该被转移到模型层(使用A / RShift + A / R快捷方式)。

模型层

模型层包含最终的分割结果。它可以保存到一个文件,可视化和分析。

掩膜层

面具层是一个辅助的分割层。此层的目的是定义可以进一步分析或过滤的特定区域(例如,使用掩码统计(菜单->掩码->掩码统计))选择模型层。

面具层用于局部黑白阈值划分,其中阈值划分区域由面具层。

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