分割工具
这个面板承载了用于图像分割的不同工具。
内容
一般信息
这个面板由两部分组成。面板的左边有两个组合框(选择类型和材料)。面板右侧的视图可能会不同，这取决于选择类型．
分割工具可以选择使用选择类型组合框。
注意!的组合Ctrl +鼠标滚轮允许修改画笔大小和其他分割工具。
的材料组合框定义模型的可视化类型。模型可以显示为填充结构或轮廓结构。透明度模型图层可以通过透明度滑块的视图设置面板．
1.三维球
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使选择作为一个球形物体在三维空间与半径从半径,px编辑框。 注意!球的三维形状是由像素维度定义的，参见数据集参数在菜单- >数据集- >参数． 选择修改器
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https://youtu.be/ZcJQb59YzUA?t=1s
2.注释
以下视频提供了一个简短的演示:https://youtu.be/3lARjx9dPi0
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一组添加/删除注释的工具。 当选择Annotation工具时，在图像上方单击鼠标将注释添加到模型中。可以使用Ctrl +鼠标左键点击组合。
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3.画笔工具
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使用笔刷进行选择。电刷尺寸由电刷调节半径,px编辑框 以下视频提供了一个简短的演示: https://youtu.be/ZcJQb59YzUA?t=37s来自不同图像切片的对象可以使用插值函数(快捷键我或通过菜单- >选择- >插入)，详情请参阅选择菜单部分。 电刷的大小可调节使用Ctrl +鼠标滚轮． 选择修改器
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使用画笔工具超像素
Superpixels模式可以通过选择分水岭或SLIC复选框。在超像素模式下，笔刷工具不是选择单个像素，而是选择像素组(超像素)。在绘制时，可以通过按下Ctrl + Z快捷方式。
方法计算超像素
- SLIC(简单线性迭代聚类，适合具有不同强度的对象)算法编写Radhakrishna Achanta等人，2015年瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)。
- 分水岭(适用于边界清晰的对象)。
框中的两个额外编辑(N，紧凑型/反转)提供修改生成的超像素大小的可能性(见下文)．的值N编辑框可以使用Ctrl+Alt +鼠标滚轮或Ctrl+Alt+Shift +鼠标滚轮快捷方式。
引用:
- Radhakrishna Achanta, Appu Shaji, Kevin Smith, Aurelien Lucchi, Pascal Fua, and Sabine Süsstrunk, SLIC超像素与最先进的超像素方法比较，IEEE模式分析与机器智能学报，vol. 34, num. 11, p. 2274 - 2282, 2012年5月。
- Radhakrishna Achanta, Appu Shaji, Kevin Smith, Aurelien Lucchi, Pascal Fua, and Sabine Süsstrunk, SLIC Superpixels, EPFL Technical Report no. 4149300年,2010年6月。
超像素的集合是独立的为每个放大(特别是在SLIC模式)。可以定义超像素的大小N编辑框，SLIC的默认值为220，分水岭使用较低的数字)和紧凑性紧凑的编辑框;更高的紧凑度会产生更多的矩形超像素)。在分水岭模式的紧凑的编辑框被称为反；当物体有黑暗的边界在明亮的背景数字反编辑框应该是1(或更高)，如果对象有明亮的边界在黑暗的背景，这个数字应该是0。
在绘制SLIC模式的超像素边界时，使用drawregionboundaries.m函数写的彼得Kovesi西澳大利亚大学地球与环境学院勘探目标研究中心。
注1 !超级像素模式对适应。复选框的选择面板．当适应。选中复选框时，超像素将基于平均值初始选择+ / -中规定的因子乘以同一区域内的标准偏差适应。editbox的选择面板。
注2 !在适应。编辑框可以使用鼠标滚轮进行更改。
注意3 !函数依赖于slicmex.c应该为您的操作系统编译。请参阅显微镜图像浏览器系统要求部分细节。
4.黑白阈值工具
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使黑白阈值的当前图像切片或整个数据集(取决于状态所有复选框)。 使用低Lim和高Lim滑动条和编辑框来提供阈值。 如果戴面具的区域选中复选框时，只对图像的蒙面区域进行阈值设置，这对局部黑白阈值设置非常方便。 在滑动条的阈值上方点击鼠标右键，会打开一个弹出菜单，允许设置滑动条移动的步骤。 |
https://youtu.be/ZcJQb59YzUA?t=4m37s
5.套索工具
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选择与套索，矩形，椭圆形或折线工具。 以下视频提供了一个简短的演示: https://youtu.be/OHFdGj9uBro如何使用:
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套索工具也适用于3D。
选择修改器：
- 无/ Shift +鼠标左键点击，将添加与现有的选择。
- Ctrl +鼠标左键点击，将从当前选项中删除所选内容。
6.魔棒工具
的像素选择鼠标按钮根据它们的强度。强度变化由选定像素的强度和两个阈值计算阈值编辑框。
以下视频提供了一个简短的演示:https://youtu.be/ZcJQb59YzUA?t=1m50s
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魔棒也可以在3D模式下工作选择面板)．
魔棒工具的选择修改器:
- 无+鼠标左键点击，将用新的选择来取代现有的选择。
- Shift +鼠标左键点击，将添加新的选择到现有的选择。
- Ctrl +鼠标左键点击，将从当前选择中删除新的选择。
7.膜点击跟踪工具
该工具通过使用定义膜域起始点和结束点的两次鼠标点击来跟踪膜类型的对象。
2D的简要演示可以在以下视频中看到:https://youtu.be/ZcJQb59YzUA?t=3m14s
下面是一个简短的3D演示视频:https://youtu.be/ZcJQb59YzUA?t=2m22s
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如何使用:
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利用精确快速行进功能对膜进行跟踪http://www.mathworks.se/matlabcentral/fileexchange/24531-accurate-fast-marching德克-简·克鲁恩(Dirk-Jan Kroon)， 2011年，特温特大学。
注意!强烈建议编译相应的功能(详见“膜点击跟踪器”一节)“系统要求”页面)，否则函数会非常慢!
额外的参数:
- 的规模编辑框-在跟踪过程中，图像通过考虑开始和结束点的强度得到增强img(img>min([val1 val2])-diff([val1 val2])*options.scaleFactor) = maxIntensity;
- 的宽度编辑框-定义结果跟踪的宽度
- 的BlackSignal复选框定义信号是黑白相间还是黑白相间
- 的直线复选框-当勾选时，点用直线连接
注意!当3D开关在选择面板启用的膜点击追踪工具连接点(线性)(这可能对追踪微管非常有用)。
8.对象选择器
该模式允许快速选择对象面具或模型层。当面具和模型单选按钮定义选择的目标层。
以下视频提供了一个简短的演示:https://youtu.be/mzILHpbg89E
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也在工作3 d(选择3 d复选框中的选择面板)． 注意!3D模式需要对对象进行统计。请选择材料在选择从列表框，按下Recalc。统计数据按钮(按钮变为可用时面具- >面具统计…或菜单- >模型- >模型统计……． |
可能的对象选择器选择模式有:
- 1.鼠标点击:从面具/模型层与鼠标点击．注1 !物体的分离对连通邻域连通性参数很敏感魔杖工具;注2 !在3D模式下，该函数使用按|Recalc生成的对象统计信息。统计|按钮。如果面具/模型图层已经改变，按|Recalc。再次统计|按钮。
- 2.套索:选择对象套索工具(按第一[无/Shift/Ctrl] +鼠标右键，然后按住鼠标左键，同时移动鼠标)。的|3D|复选框也可以对整个数据集进行选择选择面板检查。
- 3.矩形或椭圆这些工具的工作原理类似于套索工具方式，但给矩形或椭球选择。也适用于3D。
- 4.与多段线选项的选择是通过一点一点地绘制多边形形状来完成的。开始画鼠标右键最后用一个双击或右击鼠标．也适用于3D。
- 5.使用刷选择一些蒙版/模型区域。笔刷的大小在笔刷编辑框中定义。
- 6.面具在选择与鼠标点击在图像上创建一个新的选区，它是现有选区和蒙版/模型层的交集。与Ctrl +鼠标点击新的选择是selection- - - - - - -面具。此操作敏感于Selection面板中的3D复选框状态。
选择修改器：
- 无/ Shift +鼠标左键点击，将添加与现有的选择。
- Ctrl +鼠标左键点击，将从当前选项中删除所选内容。
9.聪明的分水岭
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这是一个简化版的分水岭图像分割。详情请参阅菜单- >工具- >分水岭分割部分。 简而言之:需要一个模型，包含2种材料。一种材料标注背景，而另一种材料标注感兴趣的物体。标签可以使用在智能分水岭期间激活的画笔工具绘制。使用Ctrl +鼠标滚轮来改变画笔的大小。
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- 分割当前显示的切片(2D)只需按下段按钮
- 分割所有切片(2D)举行转变键，并按段按钮
- 到整个3D数据集检查3 d复选框的选择面板并按下段按钮
注2:该工具与投资回报模式和块模式．
10.现场工具
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添加一个点-一个圆形物体鼠标点击 以下视频提供了一个简短的演示: https://youtu.be/AlCzjKuyJww使用半径,px编辑框指定点的半径。 也适用于3D。 选择修改器
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