.sheet . getelementbyid(“的主题”)。禁用= true。

确认

采用MATLAB,MathWorks公司。

2010 - 2021年期间开发
核心开发人员:
Ilya Belevich
开发人员:
Merja Joensuu沾光Kumar,海伦娜Vihinen和艾嘉Jokitalo

电子显微镜装置
生物技术研究所
阿宝56箱(Viikinkaari 9)
00014年,赫尔辛基大学
芬兰

特别感谢来

Radhakrishna Achanta洛桑联邦理工(EPFL)的墨西哥人代码SLIC supervoxels superpixels
汤姆Boissonnet(EMBL)和埃琳娜Bertseva(哥本哈根大学)广泛的测试
约翰·休曼的博尔德实验室3 d电子显微镜的细胞与Mattomo寻求帮助
康斯坦丁·Kogan赫尔辛基大学与Mac OS援助
大卫LeglandINRA,法国的修改区域邻接图(imRAG)功能检测指标之间的分水岭地区和帮助其他一些功能
弗拉基米尔•Moltchanov讨论软件体系结构
Henrik P萨林佩特森工作室内由手工制作完成挪威科技大学/圣。康医院,特隆赫姆驾驶DeepMIB病理学

团队要感谢显微镜图像浏览器用户社区的MATLAB-Central和作者的代码中使用MIB的发展。显微镜图像浏览器适应部分或全部代码从以下方面:

灵感来自于imageview由汪东城Doke MathWorks 2010
通过使用API文档的类MTOC + + - Doxygen过滤MATLAB和工具马丁写的Drohmann(大学Munster)和丹尼尔Wirtz(斯图加特大学),2011 - 2013
准确快速行进函数Dirk-Jan克朗特文特大学,2011年利用膜点击跟踪工具
ANISODIFF彼得•Kovesi函数写的2000 - 2002用于各向异性扩散滤波的图像
BIO-FORMATS梅丽莎Linkert,柯蒂斯Rueden et al . 2002 - 2013是用于阅读专用显微镜图像格式使用代码>生物< /代码复选框
BMxD外部过滤器由Kostadin Dabov et al .,坦佩雷理工大学,芬兰2007 - 2014可以使用MIB,当分别安装在系统过滤图像*BWDISTSC为三维欧氏距离变换变量数据纵横比写的看门人尤里Mishchenko(公牛大学,2007 - 2013)是用于分离各向异性对象的3 d和计算距离的地图
自定义GINPUT写的,汪东城Doke (MathWorks 2016)点击点的坐标
细胞迁移在SCRATCH伤口化验*Constantino卡洛斯Reyes-Aldasoro,由伦敦大学的城市,是用于伤口愈合分析工具
为JAVA GUI组件拖&下降功能写的Maarten van der Seijs(荷兰代尔夫特理工大学,2015)
DRAWREGIONBOUNDARIES画函数图像标记的边界地区使用刷时,彼得所写Kovesi(中心勘探目标,地球与环境学院,西澳大利亚大学,2013)
DRIFTY_SHIFTY_DELUXE,由约书亚·d·糖(桑迪亚国家实验室,利弗莫尔,CA 2014);从这个函数的一部分代码采用mibCalcShifts.m
弹性变形过滤器是基于弹性变形转换在一个图像由大卫·佛朗哥(巴拉那河天主教大学的)
EXPORT_FIG函数来度量添加到快照是由奥利弗·伍德福德和Yair奥特曼写的
快速3 d / 2 d地区增长(墨西哥人)由基督教Wuerslin(斯坦福大学,2013 - 2015)是用于该地区日益增长的工具
斐济连接正在使用MIJJava包,双向通信和数据交换从MATLAB ImageJ /斐济,由丹尼尔圣人,杀螨醇Prodanov,让Tinevez Johannes Schindelin, 2012
FINDJOBJ——找到java MATLAB图形对象的句柄Yair奥特曼,2007 - 2013
FRANGI过滤器由马克·Schrijver Dirk-Jan克朗特文特大学(2001 - 2009)
FSTACK扩展动态图像使用noise-robust选择性all-in-focus从聚焦序列算法,Pertuz(大学·罗维拉我Virgili,塔拉戈纳,西班牙2013)用于强度投影工具
HistThresh工具箱由Antti Niemisto(芬兰坦佩雷理工大学)是用于大多数全球基于直方图阈值的方法
图像边缘增强一致性滤波器Dirk-Jan克朗,帕斯卡Getreuer(特文特大学)
IceImarisConnector写的亚伦·c·庞帝(苏黎世联邦理工学院)是用于连接伊万里瓷器
图像测量工具写的Jan Neggers(埃因霍温科技大学)为基础的测量工具和重写roiRegion类
IMCLIPBOARD函数由汪东城Doke MathWorks 2010中使用快照工具和进口从系统剪贴板
IMGAUSSIAN由Dirk-Jan克朗(特文特大学),2009年实现用于3 d高斯滤波器
MATGEOM几何,MATLAB工具箱为2 d / 3 d几何计算是大卫写Legland (INRA,法国,2013)是用于一些函数
MATTOMO是皮特的一部分(粒子估计电子断层扫描)包,博尔德开发三维电子显微镜实验室的细胞用于出口模型IMOD中格式
v.2.22 MAXFLOW / MINCUT算法写的尤里Boykov(西安大略大学)和弗拉基米尔·柯尔莫哥洛夫(微软研究院、剑桥)是用于Graphcut工具
MAXFLOW / MINCUT MATLAB包装作者是迈克尔·鲁宾斯坦(谷歌)是用于Graphcut工具
NUM2CLIP函数由Grigor布朗宁,2005用于列项目复制到系统剪贴板
NRRD,几乎实现原始栅格数据格式使用项目:MATLABSlicerExampleModule由约翰Melonakos NRRD阅读使用http://teem.sourceforge.net/TEEM;和一个自定义函数读取元数据的基础上NRRD格式文件阅读器由杰夫•马瑟2012年创作的
NRRD NHDR读者和作家局长Gaetan Rensonnet功能的,2018是用于读取NRRD MacOS上格式文件
OMERO MATLAB绑定(包括到编译后的版本,但应该为MATLAB版本下载分离)用于连接OMERO服务器
P_JSON,具有高度的可移植性JSON解析器函数Nedialko所写,2009用于HDF5最佳工作文件
PATCHNORMALS由Dirk-Jan克朗(特文特大学)2009年实现用于计算法线在出口伊万里瓷器的表面
POOLWAITBAR类是基于代码提交Edric埃利斯
美化MATLAB html由布里斯托尔大学哈利小说,被用来美化MIB文档
随机森林分类器是基于Verena Kaynig实现与利用randomforest-matlab由阿布Jaiantilal
区域邻接图(布)函数是由大卫Legland (INRA,法国,2013)是用于Graphcut工具
REGIONPROPS3函数是由Chaoyuan叶(南加州大学,2014)是用于定量一些3 d对象属性
RENDERTEXT函数由大卫。迪格洛丽亚(意大利Di热那亚,2010)是用于文本图像
斐济是基于渲染MATLAB的硬件加速的3 d查看器写的让Tinevez(巴斯德研究所,2011)
呈现与MATLAB使用VIEW3D函数Torsten傅高义写的,1999
SLIC(简单线性迭代聚类)写的Radhakrishna Achanta, Appu沙棘,凯文•史密斯Aurelien Lucchi,帕斯卡Fua, Sabine年代?sstrunk,洛桑联邦理工(EPFL),瑞士,2015年利用superpixels模式的画笔工具和Graphcut分割。
STLWRITE斯文Holcombe(密歇根大学2008 - 2015年)的储蓄模型使用STL格式
UIGETFILE_N_DIR蒂亚戈/ Peugas用于选择多个目录
VIEWER3DDirk-Jan克朗(焦机器视觉在光学系统)作为基础数据的体绘制
小提琴的阴谋Holger霍夫曼2015用于可视化结果的一些分析功能
XLWRITE:生成XLS (X)文件没有Excel在Mac / Linux /赢亚历克·德·Zegher (NV贝卡尔特SA 2013)
XLSWRITE国防部巴里•狄龙(怡安保险经纪人2010)
XML2STRUCT和STRUCT2XMLWouter Falkena(代尔夫特理工大学,2010)

调色板生成的帮助

Icons8.com提供的一些图标用于MIB (< https://icons8.com>),许可证信息

年长的脚本

DIPLIB是一个平台独立的科学开发的图像处理库用C编写的定量成像小组应用科学学院,代尔夫特科技大学。安装后,显微镜图像浏览器可以使用几个额外的各向异性扩散滤波方法可以从DipLib(用于MIB 0。和1. x)。
极值函数由卡洛斯•艾德里安•巴尔加斯·阿奎莱拉瓜达拉哈拉大学,2006 - 2007(用于MIB 0。和1. x)
快速/健壮的模板匹配Dirk-Jan克朗(2009 - 2011),特文特大学用于对齐的数据集(用于MIB 0。x和1. - 1.22)。图像边缘增强一致性滤波器>通过Dirk-Jan克朗&帕斯卡Getreuer特文特大学2009(用于MIB 0。和1. x)。
当地的正常化由三位熊清华大学,北京,中国,2005(用于MIB 0。和1. x)。

回指数