当运行FrangiFilter3D时，我得到以下错误:
FrangiFilter3D错误(第101行)
[Lambda1，Lambda2，Lambda3，VX，VY，VZ] = Eig3Volume（DXX，DXY，DXZ，Dyy，Dyz，DZZ）;
eig3volume后检查。M，文件里什么都没有。我是不是漏掉了什么?

我在血管造影上应用这个过滤器有困难。我能够在示例图像(vessel.png)上运行过滤器，但当我尝试在我自己的图像上运行它时，我得到以下错误消息:
赋值比非单例下标有更多的非单例rhs维

Frangifilter2d中的错误（第96行）
ALLfiltered (:,:, i) = Ifiltered;”

真的很欣赏一些洞察力。谢谢！

作为Crico，在Matlab2017A中使用Imgaussian在64位机器之后，Mex与-compatiblearraydims，或者将Ndimsi和Dimsi []的类型从Int改变为MWSize。

对于那些“Imgaussian”问题的人：你需要用“-compatiblearraydims`”选项编译MEX文件，因为它使用`int`而不是`mwsize`以获取阵列大小。

很适合我。谢谢你！

我一直在玩这个，只是想说，它非常好，除了可怕的边缘效果，可以通过在Hessian2D的imfilter调用中添加“复制”参数来巧妙处理。米,即。

Dxx = imfilter(我DGaussxx“conv”,“复制”);
Dxy = imfilter(我DGaussxy“conv”,“复制”);
Dyy = imfilter(我DGaussyy“conv”,“复制”);

优秀。

关于下面由Gregory描述的im高斯内存请求错误，这似乎是MATLAB/mex新版本的函数mxCreateNumericArray中的函数定义问题。一个快速修复是改变函数imgaussian.c:
改变表格的两行
plhs[0] = mxCreateNumericArray(ndimsI, dimsI，…)
来
plhs[0] = mxCreateNumericArray(ndimsI, dimsI_const，…)

然后通过运行“mex imgaussian.c”来重新编译。

我不知道我之前的经历发生了什么，再来一次:
关于下面由Gregory描述的im高斯内存请求错误，这似乎是MATLAB/mex新版本的函数mxCreateNumericArray中的函数定义问题。一个快速修复是改变函数imgaussian.c:
改变表格的两行
plhs[0] = mxCreateNumericArray(ndimsI, dimsI，…)
来
plhs[0] = mxCreateNumericArray(ndimsI, dimsI_const，…)

然后通过运行“mex imgaussian.c”来重新编译。

嗨格雷戈里，

我遇到了同样的问题。你解决这个问题了吗?

我认为Imgaussian函数有一个问题。我正在尝试在10x512x512 CT图像上运行并获取此错误：

错误使用imgaussian
请求的42949672970x140037408686090x140039176060928 (17179869184.0GB)阵列超过最大阵列
大小的偏好。创建大于此限制的数组可能需要很长时间，并导致MATLAB
变得反应迟钝。有关更多信息，请参阅数组大小限制或首选项面板。

我已经尝试将数据施放到不同类型（单，双重，int16，int32等）并拍摄图像的子样本（10x10x10），但我仍然会通过请求的一些粗糙度的内存获得此错误。

有人想到了为什么发生这种情况？

我认为二维分析中有个漏洞。据我所知，尺度的定义是尺度= ^2。在代码中，它的设置为比例=。

请指导我如何使用这个进行2D CT肺血管的气道检测

大家好！
谢谢你的讨论。
这个纤维过滤器增强了单独的线条结构，而不是它们的交叉点。增强或检测结合应该做的是什么？

这并没有实现Frangi论文中描述的算法——代码中存在一些概念性的问题，比如这种“类型”检测船只，但与使用正确的算法得到的结果不同。

Matlab代码运行成功。但问题是“未定义函数或变量”Dxy。当我尝试用“mex”将代码转移到c++时，对局部变量的第一个赋值决定了它的类。有什么帮助吗?非常感谢。

这正是我需要的过滤器。我只有一个问题与运行脚本，我不知道如何编译eig3volume.c。我试过用google搜索它，试过用mex功能，但都没有成功。有人能帮我一下吗?给我一些如何做的指导，或者简单地发送已经编译好的matlab脚本(如果它是这样工作的)

最好的问候,
查尔斯

我精确地说明我想要使用Frangifilter2D功能

嗨，什么是语法调用函数改变一些选项值?

谢谢

对于错误，请确保图像是灰度

当我运行Ivessel=FrangiFilter2DInternet(I);
我收到错误“分配有更多的非单例RHS维度
单体
下标

Frangifilter2d中的错误（第96行）
ALLfiltered (:,:, i) = Ifiltered;”

任何人都可以帮助

你好，任何一个请帮助我如何在matlab中执行所有文件抱歉这个跛脚的问题，但我是新的matlab开发请帮助我紧急，提前感谢

运行IT代码时内存。如何处理这个问题？

@reza和Somayeh Ebrahimkhani，也许你必须先编译eig3volume.c。

你好 ，
我试着下载这个文件，但是eig3volume。M函数是空的。有人能把这个功能的代码分享给我吗?
谢谢

你好,

为什么eig3volume。m函数空?2D版本的工作很好，但对于3D版本，上述功能是必需的!你能添加这个功能吗?

*maïlleblancode la torre
看
//www.tatmou.com/matlabcentral/answers/84794-edge-detection-using-the-hessian-based-frangi-vesselness-filter

你好。我尝试运行代码，但我没有得到任何结果。要运行此代码，需要遵循什么步骤?
谢谢！

别介意我之前的评论。对于那些编译mex文件有问题的人，我在这里找到了编译版本[1]，它们工作得非常好。亲爱的Dirk-Jan，您必须在FrangiFilter3D.m上注释第129行。

[1]https://github.com/shayo/Planner/tree/master/MEX/Win_x64

谢谢你的代码。你能给我编译过的(c++)文件吗?我有一些奇怪的问题，在我的matlab没有检测编译器…

非常感谢您的代码。代码有效，但是我遇到了使用IsoSurface（第75行）v必须是3D阵列的问题。

这种方法可以用于OCT-B扫描的3D血管追踪吗？

非常感谢非常感谢

我在做一个关于动脉分割的项目，我需要这个模块。如你所说，eig3volume.c是空的。我如何在窗口中使用它?

嗨朋友
我正在做一个关于在图像中计数活跃精子的项目，我已经发现了活跃的核心，我的问题是，我不能在图像中检测尾巴，我不知道如何只检测图像中的尾巴，以及如何识别哪个核心是被检测的尾巴。请帮我解决这个问题!尽快

eig3volume的函数。M是空的，我该怎么办?

尊敬的先生，
请把你执行的工作发给我。
正如你提到的
见第45页

>> MEX EIG3VOLUME.C

C:\ programa ~1\MATLAB\R2013A\BIN\MEX.PL:错误:'eig3volume.c'未找到。

使用MEX时出错（第206行）
无法成功完成。

我该如何解决这个问题?

如何运行这段代码?

非常感谢您提供的这个有用的程序。一个问题:我认为在FrangiFilter3D。m line "(2*options.FrangiC^2)"在128行可以被"C"替换，因为第120行，不是吗?

你好，我想通过这个提交来分离血管和气道，但是我做不到。有人能帮我吗?

非常好的代码。用于提取图像中的许多曲率主导特征。

谁能告诉我c (max)是什么意思?黑森规范)?它是某一尺度下整个图像的最大标准，还是所有尺度下的最大标准?

谁能告诉我c (max)是什么意思?黑森规范)?它是某一尺度下整个图像的最大标准，还是所有尺度下的最大标准?

嗨,德克,

提交似乎很有效。谢谢您的努力!只是一个细节，你是不是忘记了一个'keyboard'语句，当调试'FrangiFilter3D'在129行?还是故意的?

干杯,克里斯

你好，先生，

主要是它的工作原理。但我发现了一些小问题（可能是我的问题）：
1.2D版本，方向不正确。我用了cos和sin函数，然后用“quiver”函数来画它们，看起来方向矩阵并没有反映血管结构的主要方向。
2.对于3D版本，如果你不仅能提供主要方向，还能提供与2个“较大”特征值相关的2个子方向，那就太好了。

谢谢你的工作。请告诉我2D方向有什么问题。

伊恩

工作很棒!!

非常感谢你的Frangi2D代码!我已经在我的数字减影图像序列(脑血管)上尝试过了。该规范在大多数船只上运行良好。但我的主血管由于组织复杂，背景颜色较暗，所以结果不是很好，可能参数需要调整。关于复杂容器部分的暗色背景如何预处理，您能给点建议吗?

您好，我正在使用2D心脏图像，我使用弗兰西过滤器来突出船只，但我在包含窄船只的图像中存在问题，我不确定在使用Frangie滤波器之前有效提高图像的对比度，可以我有任何帮助改善图像的对比度，我必须提到我尝试了对比度拉伸，直方图均衡，自适应直方图均衡。

你好，我已经测试过了，但是我只使用Hessian2D，我不知道如何使用特征值和特征向量。谁能帮助我?

嗨，我用弗兰吉过滤器提取血管，没关系…之后我有一个问题，以获得二进制图像…我不知道怎么……你知道吗?我使用otsu阈值，但结果不好…你能帮我吗?谢谢你！

谁能告诉我为什么eig3volume.m文件里什么都没有

你好星系,

在3D图像中使用eig不需要3D矩阵，只需要3x3矩阵。
对于BLOB检测，您需要在3D数据的Hessian矩阵上使用EIG。所以例如：
>>黑森州= [
Ixx、Ixy Ixz;
Ixy、Iyy Iyz;
Ixz，Iyz，Izz
]；
%，其中Ixx是图像在x方向上的二阶高斯导数，Ixy是图像在x和y方向上的偏导数，你必须使用Hessian3D或类似的函数来计算这些项。
[V D] = eig(黑森);%V是一个3 × 3矩阵的特征向量在列向量上D是一个3 × 3矩阵的特征值在对角上。

希望这可以帮助。

亲爱的劳伦Haaitsma,
我想检测管和blob结构，但我有eig3volume的问题，正如你说的。我认为它不能在三维正确地检测。..你如何使用“eig”在matlab的三维图像?

先生，您能告诉我，我应该按什么顺序运行这些文件来制作2D图像吗?

到目前为止，我只使用了3D过滤器，但我发现eig3volume计算的特征值与Matlab的'eig'函数不同。此外，管状结构和blob之间的区别在Matlab的“eig”中更加明显。不过，它的速度有点慢。
在Frangifilter3d中还有一个杂散的“键盘”，我认为应该被删除。
除此之外，这是一个伟大而非常有用的提交。

这对放射学来说真的很好，但当我试图在其他冠状动脉造影图像上运行示例pf FrangiFilter2D时，它给了我以下错误:赋值有更多的非单例rhs维度比非单例下标。任何建议吗?

谢谢你的好代码
2D代码对CT肺图像的结果很好(增强血管很好)，但在3D中，不是增强血管出现了一些圆圈，结果不太好。请告诉我为什么?

当K >>运行3D版本时，我该怎么办。

Lee，代码没问题，当从eig2image传递Lambda1和Lambda2时，它们的值实际上是交换的(检查FrangiFilter2D中的第108行)。
我的问题是，有人试过在一系列核磁共振扫描上测试3D算法吗?
我做了56次扫描，把它们放在一个数组里但似乎无法取出血管。这是因为片之间的分辨率大于片内分辨率吗?
任何想法都非常感谢。

非常好的代码-节省了我很多时间。我可能是错误的，但我认为在FrangiFilter2D中有一个问题，在那里你定义Rb = (Lambda2./Lambda1)。^2在第83行。这与假设为Lambda1 > Lambda2的原始论文相矛盾。Rb被定义为对blob-ness的偏差，当Lambda1 == Lambda2时，Rb的最大值应该是1。

我已经做了不同的测试，我发现它非常有用和容易理解。然而，最近出现了一个关于sigma值的问题:这些术语是以毫米还是以体素单位度量的?(这可能是一个关于卷积的matlab问题)。这个对应于管状物体的半径或直径?谢谢！

出于分析原因，为什么流程应该在循环中增长?
然后......你如何生成你的内核？生成你的内核的数学基本是什么？谢谢

非常感谢，非常有用

对我很有用
也许我需要把它转换到c或c++

请帮助。首先我运行它，我遇到了这个错误:
错误使用==> mex在208
无法成功完成。
我不记得究竟但是引导我下载“安装Microsoft Visual C ++ 2010 Express和Microsoft Windows SDK 7.1”。但是我有问题的问题是安装SDK。我很迷惑！我该做什么？我的操作系统是Windows 7.您认为我应该更改我的操作系统？我使用7.12 R2011A。旧版本会帮助我吗？我需要使用完美的计划。为什么你用C ++的形式写了它

更新：在调试器中逐步运行时确实有效。通过逐步运行或按下继续。显然，每个Sigma都会出现问题，例如，如此。3 sigma步骤，我必须按下继续3x，当k >>出现时，到达最终结果......

谢谢你的代码！它在2D中适用于地质样品的μCT数据，具有窄骨折！

然而，我没有得到3D版本的工作;已经没有“ExampleVolumeStent”了。用Visual c++ Express 2010编译eig3volume.c似乎很好，但是当在示例上运行代码时，它显示“Current Frangi Filter Sigma: 1”(这是应该的)，但随后返回“K>>”和“等待输入”。这可能是什么原因呢?

(我在Win64 PC上运行Matlab R2010a)

*斯维特拉娜
必须编译eig3volume.c(参见帮助中的示例)才能使用该函数

谢谢你的代码！
你能帮助错误吗？
当我尝试“尝试执行SCRIPT eig3volume作为一个函数”时，我得到了错误。
实际上eig3volume。m是空的…
提前谢谢你!

很有帮助！谢谢！

超级有用。非常感谢!!

它非常有用。
你能给我解释一下“方向矩阵”怎么解释吗?
每个像素的角度代表什么?它是否暗示下一个像素被包含在脊上的角度?
提前感谢你。

非常有用和有启发性

你好。
谢谢你的代码，但我没有理解一些东西。
例如，在Frangi2D中。米,是什么:
if（选项.blackwhite）
Ifiltered(λ₁< 0)= 0;
（什么是pp.45？）
我如何计算一个容器的方向，这个方向是根据什么来计算的?
你能解释一下这个代码吗?

对于Hessian3D函数中可能出现内存问题的大卷，以下更改可以帮助Gradient3子功能：
变化:
取内部点的中心差异
D (2: k - 1,:,) = (F (3: k,:,:) - F (1: k-2,:,:)) / 2;

:
试一试
D (2: k - 1,:,) = (F (3: k,:,:) - F (1: k-2,:,:)) / 2;
抓住我
(我的警告。标识符,(我。标识符”。尝试逐行筛选以节省内存'])
for thisIdx = 2:k-1
D (thisIdx:,) = (F (thisIdx + 1,:,:) - F (thisIdx-1,:,:)) / 2;
结尾
结尾

这看起来非常棒，不幸的是，我不能得到c文件来编译。

#10157:忽略选项'-w';参数类型错误
Icc:错误#10104:无法打开'all'
MEX：编译“Eig3Volume.c”失败。

任何帮助吗?提前谢谢!

谢谢，这对我帮助很大!

这是一个很棒的应用程序!我想知道是否有人能推荐一个合适的值在脑MRI中分割动脉?σ的默认值合适吗?

这很棒，非常感谢分享，所有的叉子。我想知道这里有人是否使用类似的想法来获得来自2D / 3D图像的纤维方向。我猜它使用输入图像的梯度矩阵的特征向量和特征值。

如果你感兴趣的话，我已经做了一个关于这个话题的视频。
http://www.youtube.com/watch?v=4nogjnbipu0.
这里有一些文件供您阅读。
Frangi，A.等人，多尺度船舶增强过滤，
http://www.springerlink.com/content/a57784628587870p/
基于模型的三维图像管状结构检测，
http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?doi=10.1.1.98.4723&rep=rep1&type=pdf
http://doi.ieeecomputersociety.org/10.1109/MMBIA.1996.534065
张志强，王志强，王志强，等，管状物体中心线提取的初始化、噪声、奇异性和高度脊线穿越的尺度，http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=993126
萨塔。杨志强，等，基于三维多尺度线滤波器的医学图像中曲线结构的分割与可视化，http://www.springerlink.com/content/d8752l41j884u249/

能否列出一些参考资料，我们可以阅读这个过滤器，实现任何文献的实现请?谢谢你！

谢谢你们，Brian和Dirk-Jan Kroon，谢谢，赵继超

这是一个非常方便的实现!谢谢。

Jichao,

我偶然看到你的帖子，因为我正在寻找如何解决另一个文件的相同问题。我发现这是因为编译器无法处理“//”形式的新的C99注释，将它们更改为原来的C注释风格的“/*”和“*/”解决了我的问题。我在这里找到了这个信息(更多细节):
http://www.mathworks.nl/matlabcentral/newsreader/view_thread/169199.

嗨,克朗。非常感谢你的帖子。我发现你的几篇帖子很有帮助。当我尝试实现你的代码时，我遇到了以下错误。你能告诉我怎么修理吗?

mex eig3volume.c.
Eig3Volume.c：21：错误：预期标识符或'（'之前'/'令牌
Eig3volume.c:101:错误:预期标识符或'('在'/'标记之前
eig3volume.c:在函数'mexFunction'中:
Eig3volume.c:258: error: expected expression before '/' token
Eig3Volume.c：265：错误：'/'令牌之前的预期表达式
Eig3volume.c:280:错误:'i'未声明(第一次在这个函数中使用)
eig3volume.c:280: error:(每个未声明的标识符只报告一次
Eig3Volume.c：280：错误：对于它出现的每个函数。）
Eig3volume.c：280：错误：'npixels'未删除（第一次使用此功能）

MEX：编译“Eig3Volume.c”失败。

???207时使用==> mex错误
无法成功完成。

*沃尔特
我已经检查了由M. Schrijver编写的二维特征值代码，你是对的，特征值不是按abs(值)在2D中排序的，(它也不需要包括血管造影图像)。我今天会在Mathworks上发布最新消息。再次感谢您的评论。

*沃尔特
c-code已经包含了一个部分，它根据abs值对特征值进行排序，下面的注释开始:
/ *通过abs eigen值对eIgen值和向量进行排序* /

这个实现是由Frangi纸做的，因此是的，如果Frangi是错误的，它必须是sigma^2而不是sigma，它在当前版本的代码中也是错误的。

我认为有一个错误。特征值的比例并不总是正确的。他们之前必须由他们的ABS值订购。在实现中，这不是真的。
第二点:林德伯格的归一化导数。在标准化过程中，应该用²而不是。也许我错了，但奇怪的是，Frangi(1998)的论文也出现了同样的错误。

感谢您的实现。我刚刚开始尝试自己实现这个，您的解决方案非常有帮助。