主要内容

探索三维容积数据的标签量观众

这个例子展示了如何探索三维容积数据使用的标签量观众应用。使用这个应用程序,您可以查看标签卷本身或视图上的标签作为一个覆盖强度体积。为了说明这一点,装载一个强度卷的例子展示了人类的大脑与标签领域显示的位置和类型肿瘤在大脑中发现。

加载标签卷和强度卷

负载人类大脑的磁共振强度数据和标签卷垫文件到工作区中。核磁共振数据的修改子集小鬼数据集[1]。这个操作在工作区中创建了两个变量:标签

datadir = fullfile (toolboxdir (“图片”),“imdata”,“BrainMRILabeled”);负载(fullfile (datadir“图片”,“vol_001.mat”));负载(fullfile (datadir“标签”,“label_001.mat”));谁
类属性名称大小字节datadir 1 x1 294字符串标签240 x240x155 8928000 uint8第240卷x240x155 17856000 uint16

查看器应用程序打开卷。从MATLAB将来发布,打开应用程序选项卡,并在图像处理和计算机视觉,点击查看器体积。你也可以打开应用程序使用volumeViewer命令。

volumeViewer(卷、标签)

加载标签卷到卷查看器应用程序,单击进口标签卷打开标签体积。你可以加载一个图像文件名称或从工作区中加载一个变量。(如果您有体积数据DICOM格式,使用多个文件来表示一个卷,您可以指定DICOM文件夹的名字。)对于这个示例,选择从工作区进口选择。

选择工作空间体积与标记相关的变量的数据从工作区进口对话框,然后单击好吧

查看器视图标签卷在卷

查看标签卷卷查看器应用程序中。默认情况下,查看器显示的数据量作为标签卷但你也可以把它看成片飞机。探索标签卷,放大和缩小的图像使用鼠标滚轮或右键单击。你也可以旋转的体积定位光标在图像窗口中,紧迫和拿着鼠标,光标移动。你总是缩放或旋转中心的体积。轴的位置定位轴窗口反映了空间定位标记量的旋转。

完善你的标签卷使用视图呈现编辑器观众量的一部分。您可以使用呈现编辑器查看某些标签和隐藏,改变颜色,修改标签的透明度。标签000是背景,它通常是不可见的。当您选择背景标签,显示标签复选框是明确的,默认情况下。选择所有可见的标签,标签,然后单击选择背景逆选择。改变标签的颜色(或标签),选择的标签呈现编辑器并指定的颜色颜色选择器。您还可以控制标签使用的透明度不透明度滑块。

嵌入标记体积与体积强度

在这部分的示例中,您查看标签卷和强度卷卷观众在同一时间。查看标签体积覆盖在强度上的体积可以提供上下文数据。

标签卷已经在观众数量,体积强度加载到应用程序,单击进口数量和选择从工作区进口选择。

选择工作区与强度的相关变量从工作区进口对话框,然后单击好吧

体积查看器显示标签体积/体积强度数据。默认情况下,查看器显示标签数据量和强度数据卷,但你也可以把它看成是飞机。探讨标记和强度卷,使用鼠标滚轮放大和缩小或右键单击。你也可以旋转的卷定位光标在图像窗口中,紧迫和拿着鼠标,光标移动。查看只有强度体积和隐藏标签体积,点击查看卷

完善你的视图的标签数量和强度卷使用选项呈现编辑器。只查看标签体积,体积和隐藏强度、清晰将标签嵌入体积复选框。在标签区域的呈现编辑器,你可以选择任何的标签和改变它的颜色和透明度。标签背景是000年。默认情况下,背景设置为黑色,是不可见的。的显示标签复选框是明确的。选择所有的标签,然后点击点击背景逆选择。如果强度卷是可见的,您可以修改阈值使用的滑块和透明度体积区域的呈现编辑器

引用

[1]医学分割十项全能。“大脑肿瘤。”Tasks. Accessed May 10, 2018.http://medicaldecathlon.com/。

有钱的数据集是由医学分割使用4.0许可下十项全能。保证和陈述都否认。有关详细信息,请参阅许可。MathWorks®已经修改这个示例中所使用的数据的子集。这个例子使用一个扫描的MRI数据从原始数据集,保存到一个垫子文件。

另请参阅

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