主要内容

序列查看器

可视化和互动探索生物序列

描述

序列查看器APP使您可以可视化和探索氨基酸或核苷酸序列。

你可以:

  • 直接从NCBI或EMBL数据库导入序列。

  • 查看和探索各种序列信息(例如ORF和CDS)和基本统计​​数据(例如基数百分比或氨基酸计数)。

  • 查看补体和反向补体序列以及其他序列特征,例如基因和外显子。

  • 提取核苷酸序列的蛋白质编码切片并将其导出到MATLAB®工作区。

  • 使用正则表达式搜索特征性的单词或序列模式。

打开序列查看器应用程序

  • MATLAB工具条:在应用标签,下计算生物学,单击应用程序图标。

  • MATLAB命令提示:输入seqviewer

例子

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从GenBank检索序列®数据库。

S = GetGenBank('M10051');

将序列加载到序列查看器应用中。

seqviewer(S)

另外,您可以单击序列查看器应用打开应用程序,并查看生物序列s

关闭应用程序。

seqviewer('Close')

相关示例

程序化使用

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seqviewer打开序列查看器应用程序。

seqviewer(seq加载氨基酸或核苷酸序列seq进入应用程序。seq可以是以下之一:

版本历史记录

在R2006a之前引入

也可以看看

应用

功能