序列比对

可视化和编辑多个序列对齐

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描述

的序列比对应用程序让你可视化和编辑多个序列对齐。

您可以:

打开生活的脚本

加载并查看多个序列对齐文件。

seqalignviewer (“aagag.aln”）

图生物序列对齐- 1包含3个轴对象和其他类型的uipanel, uitoolbar, uimenu对象。axis对象1包含两个类型为text, patch的对象。axis对象2包含5个类型为图像，文本，补丁的对象。坐标轴对象3包含6个类型为图像，补丁，文本的对象。

或者，您可以单击序列对齐应用程序选项卡以打开应用程序，并查看对齐数据。

您还可以从应用程序内的对齐序列生成系统发育树。选择显示>树视图．

seqalignviewer打开序列比对应用程序。

seqalignviewer (对齐）加载多个序列比对数据对齐进入应用程序。对齐可以是以下情况之一:

一个MATLAB结构包含序列字段，如返回fastaread，gethmmalignment，multialign,或multialignread
一种包含MSA数据的MATLAB字符数组，如multialign
指定包含MSA数据的文件或URL的字符串
一个3乘n的字符数组，显示两个序列的成对对齐，如返回的数组nwalign或swalign．