建立模型
代表机械系统生物学模型的动态，或者PKPD系统
功能
simbiology |
打开SimBiology应用程序构建PK / PD和机械系统生物学模型 |
sbiomodel |
构建模型对象 |
sbioroot |
返回SimBiology根对象 |
sbioreset |
删除所有模型对象 |
sbioselect |
搜索与指定的约束对象 |
sbiolastwarning |
SimBiology最后的警告消息 |
sbiolasterror |
SimBiology最后一条错误消息 |
校验 |
验证和核实SimBiology模型 |
addcompartment |
创建隔间对象 |
addobservable |
观察的对象添加到SimBiology模型 |
addspecies |
建立种对象和模型对象中添加到隔间对象 |
addparameter |
创建参数对象，并添加到模型或动力学定律对象 |
addreaction |
创建反应对象，并添加到模型对象 |
addrule |
创建规则对象，并添加到模型对象 |
的addEvent |
事件对象添加到模型对象 |
findUnusedComponents |
发现未使用的种类，参数和模型中的车厢 |
findUsages（种类，参数，隔室） |
找出一个物种，参数，或隔间如何在模型中使用 |
findUsages |
了解如何观察的对象SimBiology模型用于 |
findUsages（单元，unitprefix） |
找出一个单位或单位前缀是如何使用 |
findUsages（AbstractKineticLaw） |
找出一个AbstractKineticLaw对象是如何使用 |
updateInitialAssignments |
更新初始分配规则删除订单的依赖 |
类
模型对象 |
模型和组件信息 |
可观察 |
对于后仿真计算含有表达目的 |
车厢对象 |
含隔间信息对象 |
种对象 |
包含对象的物种信息 |
参数对象 |
参数和范围信息 |
反应物 |
对象包含模型反应信息 |
KineticLaw对象 |
对于反应动力学定律信息 |
规则对象 |
物种和参数保持规则 |
活动对象 |
存储事件信息 |
根对象 |
保持模型，单元库和抽象动力法库 |
PKModelDesign对象 |
辅助对象，构建药物动力学模型 |
PKCompartment对象 |
通过使用PKModelDesign去创造SimBiology模型 |
PKModelMap对象 |
定义SimBiology模型组件的角色 |
构造 |
从构建模型SimBiologyPKModelDesign宾语 |
addCompartment |
加入隔间PKModelDesign宾语 |
示例以及如何
编程工作流程
这个例子说明了如何编程构建一个简单的模型。
这个例子说明了如何构建一个简单的基因调控模型，并模拟它。
这个例子说明了如何创建自定义函数，并在模型模拟其纳入。
概念
一个SimBiology®模型是由一组数量和数学表达式描述的动态系统。
您可以查看公式中系统的SimBiology当你建立使用反应，规则，事件，变体和剂量的模型创建。
一个种对象代表一个物种，这是一种化学或实体的该参与了反应的量。
规则是数学表达式，允许您定义或修改模型数量，即厢容积，物种数量，或参数值。
反应是一种数学表达式，描述了转换，传输，或改变一个或多个物种的结合过程。
使用质量作用动力学定义零级，一级，二级，和可逆的反应。
使用微分方程，质量作用动力学，或的Michaelis-Menten动力学，以限定酶反应。
在SimBiology，事件是在模型中的量或表达的值的离散过渡。
使用剂量，以不同给药方案建模。
SimBiology可以让你创建一维，二维或模型模拟和参数估计多室的药代动力学模型。
SimBiology可以让你找到未在模型中使用，并找出如何使用它们的物种，参数，车厢，和观测。
评估表达式名称时SimBiology如下一些优先级规则。
您还可以选择从下面的列表中的网站：
