SimBiology模型分析

分析QSP, PK / PD和机械系统生物学模型

自从R2019b

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描述

的SimBiology模型分析应用程序允许您分析模型的动态系统,如代谢网络,信号通路,定量系统药理学(QSP)模型和药代动力学/药效学(PK / PD)模型的药物。它提供了几种方法来分析模型和各种阴谋可视化结果。

使用这个应用程序,您可以:

模拟模型来看到它的动态行为。
探索生物多样性通过模拟场景,如虚拟病人。
使用非线性回归和非线性mixed-effects方法估计模型参数。
执行参数扫描和敏感性分析,探讨模型参数和初始条件的影响模型的行为。
指定单位,让程序自动匹配的物理量转换成一个一致的单位系统。
探索不同的给药方案。
执行noncompartmental分析(NCA)计算药物的PK的PK参数数据。
查看分析结果在不同的情节。

可用的情节

这个应用程序允许您可视化分析结果使用各种阴谋,包括:

时间的模型数量
灵敏度矩阵
覆盖实验数据的估计结果
土地测量符合质量、置信区间等情节,残差图,剩余分配土地,actual-versus-predicted情节,情节和盒子
散点图矩阵
百分位图

打开SimBiology分析仪的应用模型

MATLAB^®将来发布:应用程序选项卡,在计算生物学,点击应用程序图标。
MATLAB命令提示:输入simBiologyModelAnalyzer。

例子

编程使用

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`simBiologyModelAnalyzer`

simBiologyModelAnalyzer打开SimBiology模型分析应用程序。

`simBiologyModelAnalyzer (m1)`

simBiologyModelAnalyzer (m1)打开SimBiology模型m1在SimBiology模型分析如果你也有应用。SimBiology模型构建器应用程序开放的同时,这两个应用程序共享相同的模型。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析应用程序已经打开,你不能加载模型从命令行或项目。直接从应用程序加载模型。

`simBiologyModelAnalyzer (sbprojFile)`

simBiologyModelAnalyzer (sbprojFile)打开SimBiology项目文件sbprojFile在SimBiology模型分析应用程序。sbprojFile是一个字符串或字符向量指定一个文件名或路径和文件名SimBiology项目SBPROJ文件。如果只指定一个文件名,文件必须在MATLAB搜索路径或在当前文件夹。如果你也有SimBiology模型构建器应用程序开放的同时,这两个应用程序共享相同的项目。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析应用程序已经打开,你不能加载模型从命令行或项目。直接从应用程序加载模型。