joinseq
加入两个序列产生最短超层序
语法
SeqNT3= joinseq (SeqNT1,SeqNT2)
参数
SeqNT1,SeqNT2 |
核苷酸序列。为每个序列向量输入一个字符或字符串。 |
描述
SeqNT3= joinseq (SeqNT1,SeqNT2)SeqNT1和SeqNT2。如果没有重叠序列,然后SeqNT2连接到年底吗SeqNT1。如果重叠的长度是相同的两端的序列,然后年底重叠SeqNT1的开始SeqNT2用于联接序列。
如果SeqNT1子序列的SeqNT2,然后SeqNT2作为最短返回超层序,反之亦然。
例子
加入两个序列包含一个重叠。
seq1 =“ACGTAAA”;seq2 =“AAATGCA”;加入= joinseq (seq1 seq2)加入= ACGTAAATGCA
