主要内容

使用Volume Viewer应用程序浏览三维体积数据

此示例演示如何使用Volume Viewer应用程序查看和浏览三维体积数据。体渲染高度依赖于定义适当的alphamap,以便数据中希望看到的结构是不透明的,而不希望看到的结构是透明的。为了举例说明,该示例将人头的MRI研究加载到Volume Viewer中,并使用Volume Viewer的可视化功能探索数据。

将音量数据加载到音量查看器中

示例的这一部分展示了如何将容量数据加载到Volume Viewer中。

将人头部的MRI数据从MAT文件加载到工作区。此操作将创建一个名为D在包含体积数据的工作空间中。使用挤压命令从数据中删除单例维度。

负载核磁共振成像D=挤压(D);谁
名称大小字节类属性D 128x128x27 442368 uint8映射89x3 2136双码1x3 24双码

打开量观众应用程序®工具条,打开“应用程序”选项卡,在“图像处理和计算机视觉”下,单击. 您还可以使用打开应用程序容量测试器命令

将体积数据加载到量观众应用程序,点击进口数量.您可以通过指定图像的文件名或从工作区加载一个变量来加载图像。如果DICOM格式的容量数据使用多个文件来表示一个卷,则可以指定DICOM文件夹名称。选择从工作区导入选项,因为数据在工作区中。

在中选择工作空间变量从工作区导入对话框,然后单击好吧

要启动的新实例,请执行以下操作:量观众,点击新会话

创建新会话时,此选项将删除查看器中当前的所有数据。点击创建新会话。

在音量查看器中查看音量数据

在本例的这一部分中,您决定如何查看数据。量观众提供几个选项。

查看卷量观众应用。默认情况下,量观众将数据显示为体积,但您也可以将其视为切片平面。显示为体积的MRI数据可以识别为人头。若要查看体积,请使用鼠标滚轮或右键单击放大和缩小图像。您还可以通过在图像窗口中定位光标、按住鼠标并移动来旋转体积移动光标。始终围绕体积中心缩放或旋转。轴在定位轴窗口在旋转图像时反映图像的空间方向。

要更改显示窗口中使用的背景颜色,请单击背景色选择一种颜色。

将MRI数据视为一组切片平面。点击切片平面.您还可以放大和旋转数据的这个视图。使用三个切片窗口中的滚动条可以查看任意平面中的各个切片。

继续使用量观众功能,直到您获得数据的最佳视图。

调整卷查看器中卷数据的视图

在示例的这一部分中,您将调整量观众应用程序。

点击体积返回将数据作为卷查看并使用量观众以获得最好的数据可视化。量观众提供几个空间参考选项,让您获得更真实的头部体积视图。(在默认视图中,头部看起来是扁平的。)

  • 指定的尺寸—您可以指定在X, Y, Z方向的尺寸。

  • 向上采样到立方体--量观众计算一个比例因子,使每个维度中的样本数量与体积中的最大维度相同。这种设置可以使非各向同性采样数据更准确地显示成比例。

  • 使用卷元数据--如果数据文件的元数据中包含分辨率数据,量观众使用元数据并按比例显示卷。量观众选择使用卷元数据选项,如果存在元数据,则默认为。

使用渲染编辑器优化视图

示例的这一部分描述了如何使用量观众呈现编辑器以修改数据视图。使用渲染编辑器,你可以:

  • 选择整体查看方法:体渲染、最大强度投影或等值面。

  • 通过指定预设的alphamap(如ct骨骼)或通过使用不透明度/图像强度曲线自定义alphamap来修改alphamap。

  • 指定可视化中使用的颜色贴图。

  • 指定可视化中的照明。

选择观看方式。

量观众提供了几种卷的查看方法。这个最大强度投影(MIP)选项查找通过数据投影的每条光线具有最高强度值的体素。MIP可用于显示体积内的最高强度结构。您还可以将该卷视为等值面

指定alphamap。

体渲染在很大程度上依赖于定义适当的alphamap,以便您希望看到的结构是不透明的,而不希望看到的结构是透明的。通过渲染编辑器,可以定义整个体积中体素值的不透明度和透明度。您可以从一组alphamap预设中进行选择,这些预设会自动实现某些定义良好的效果。例如,要定义与CT骨骼数据配合良好的视图,请选择断层骨骼渲染预设。默认情况下,量观众使用一个简单的线性关系,但每个预设改变曲线的绘图,以给予某些数据值或多或少的不透明度。您可以通过直接操作情节来定制alphamap。

指定colormap。

当与体素强度和不透明度一起使用时,颜色是体素可视化的一个重要元素。在渲染编辑器中,您可以从预定义的MATLAB颜色图列表中选择,例如喷气式飞机森莺.您还可以指定在工作区中定义为变量的自定义颜色映射。您还可以通过使用交互式颜色条比例为任何颜色映射更改颜色映射。例如,要在可视化中减轻颜色值,单击颜色条创建一个圆形滑块。要修改颜色映射,使更多的值映射到较浅的颜色,将滑块向左移动。您可以在颜色条上创建多个滑块来定义其他颜色映射。

修改灯光效果。默认情况下,量观众在音量显示上使用某些照明效果。您可以通过清除照明复选框。

保存音量查看器渲染和相机配置设置

在北京工作后量观众要获得数据的最佳视图,可以保存渲染设置和相机配置。量观众将此信息存储在一个名为配置默认情况下,它写入工作区。您可以将此结构与volshowlabelvolshow中创建的视图的函数量观众

要保存渲染和摄影机配置设置,请单击出口并单击渲染和摄影机配置选择。

指定该结构的名称量观众创建或接受默认名称(配置)点击好吧