Cox比例风险模型中截尾数据

这个例子说明了如何构建一个Cox比例风险模型,并评估预测变量的意义。

步骤1.加载样本数据。

加载示例数据。

加载readmissiontimes

响应变量是ReadmissionTime,其示出了用于100名病人重新接纳倍。预测变量是年龄性别重量和每个患者的吸烟状况,抽烟者。1表示患者是吸烟者,而0表明该患者不抽烟。列向量截尾具有用于每个患者,其中1表示截尾数据,0表示时间观察到的精确的重新接纳检查的信息。这是模拟数据。

步骤2。拟合考克斯风险比例函数。

拟合一个Cox比例风险函数,以变量性别为预测变量,并考虑截尾。

X =性别;并[b,logl,H,统计] = coxphfit(X,ReadmissionTime,“截尾”、审查);

评估足月性别的统计意义。

统计
统计=同场的结构:covb:0.1016测试:-1.7642 SE:0.3188 Z:-5.5335号码:3.1392e-08 csres:[100X1双] devres:[100X1双]马尔特雷:[100X1双] schres:[100X1双] sschres:[100X1双]分数:[100X1双] sscores:[100X1双]

p -值,p,表明术语性别统计显著。

用不同的名称保存loglikelihood值。您将使用它来评估扩展模型的重要性。

loglSex = logl
loglSex = -262.1365

步骤3。在模型上加上年龄和体重。

用变量性别、年龄和体重拟合考克斯比例风险模型。

X = [性别年龄体重];并[b,logl,H,统计] = coxphfit(X,ReadmissionTime,“截尾”、审查);

评估方面的意义。

stats.beta
ANS =3×1-0.5441 0.0143 0.0250
stats.p
ANS =3×10.4953 0.3842 0.0960

经调整后,这些术语在统计上都不显著。

评估使用对数似然比术语的意义。您可以使用评估的似然比统计的新模式的意义。首先找到没有条款年龄和体重,并与性别,年龄和体重的模型的对数似然模型的数似然统计之间的差异。

-2 * [loglSex  -  logl]
ANS = 3.6705

现在,计算 p -似然比统计值。似然比统计量具有卡方分布,其自由度等于被评估的预测变量的数量。在这种情况下,自由度是2。

P = 1  -  CDF(“卡方”,3.6705,2)
p值= 0.1596

p - 值0.1596表示该条款年龄和体重在统计上并不显著,考虑到模型中的长期性。

第4步:添加吸烟者的模型。

正好与变量性别和吸烟者Cox比例风险模型。

X = [性别吸烟者];并[b,logl,H,统计] = coxphfit(X,ReadmissionTime,...“截尾”、审查);

评估模型中术语的重要性。

stats.p
ANS =2×10.0000 - 0.0148

这种模式比较到性爱是唯一任期的第一款车型。

-2 * [loglSex  -  logl]
ans = 5.5789

计算 p -似然比统计值。似然比统计量具有一定程度的自由1的卡方分布。

P = 1  -  CDF(“卡方”,5.5789,1)
p值= 0.0182

p - 值0.0182表明,性别和吸烟者有统计学显著给出另一种是在模型中。与性别,吸烟者的模型是更适合相比,只有性模型。

请求系数估计。

stats.beta
ANS =2×1-1.7165 - 0.6338

默认的基准是平均的X,所以对于危险比最终模型是

H [R = H X Ť H X Ť = EXP [ β 小号 X 小号 - X 小号 + β α X α - X α ]

适合为0的基线Cox比例风险模型。

X = [性别吸烟者];并[b,logl,H,统计] = coxphfit(X,ReadmissionTime,...“截尾”,审查,“基线”, 0);

对于危险比的模型是

H [R = H X Ť H 0 Ť = EXP [ β 小号 X 小号 + β α X α ]

请求系数估计。

stats.beta
ANS =2×1-1.7165 - 0.6338

系数不受影响,但危险率与基线为平均值时不同X

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